Talks & Presentations

前田和勲、人工知能とシミュレーションを使って生物を理解・設計する、第54回LaMer特別講演会、愛媛大学、2024年1月26日

前田和勲、倉田博之、動力学シミュレーションを使って生物システムを理解・設計する、第13回 日本細胞性粘菌学会例会 、九州工業大学戸畑キャンパス、2023年10月21日

前田和勲、倉田博之、遺伝子回路設計と塩基配列設計の自動化、「細胞を創る」研究会 16.0、東京大学駒場キャンパス、2023年9月26日

前田和勲、萩森秀太、杉本昌弘、酒井康行、西川昌輝、肝臓のzonationを考慮した薬物代謝動態の数理モデル、第31回日本医学会総会、東京、2023年4月21日

前田和勲、動力学シミュレーションを使った生化学システムの理解と設計 、第2回分子サイバネティクス・第46回分子ロボティクス定例研究会、オンライン、2021年5月10日

前田和勲, 生物シミュレーションモデルのパラメータ推定問題, 創価大学, 2019年2月14日

前田和勲、平順一、坂本寛、倉田博之、遺伝子回路開発プロセスの自動化、第9回分子サイバネティクス・第53回分子ロボティクス定例研究会、九州工業大学、2024年5月29日

前田和勲、Fred C. Boogerd、倉田博之、RCGAToolbox: 動力学モデルのパラメーター推定 のための実数値遺伝的アルゴリズムソフトウェア、第69回　情報処理学会 バイオ情報学研究会、金沢＆オンライン、2022年3月11日

前田和勲, Hans V. Westerhoff, 倉田博之, and Fred C. Boogerd、大腸菌アンモニア輸送-同化ネットワークの定量的動力学モデルの構築 、第71回日本生物工学会大会、岡山、2019年9月18日

前田和勲, Hans V. Westerhoff, 倉田博之, and Fred C. Boogerd、制約付き最適化に基づくパラメータ推定を用いた大腸菌アンモニア輸送-同化の動力学モデリング 、IIBMP2019 (ハイライトトラック)、東京、2019年9月10日

前田和勲、動力学パラメータ推定問題：大腸菌アンモニア同化-輸送ネットワークの事例 、第59回　情報処理学会 バイオ情報学研究会、東京、2019年9月8日

Kazuhiro Maeda, Hans V. Westerhoff, Hiroyuki Kurata, and Fred C. Boogerd, Ranking E. coli’s ammonium transport and assimilation netwoks by how they fit diverse experiments, AMSA Meeting, University of Amsterdam, Netherlands (28 March 2019)

Kazuhiro Maeda, Hans V. Westerhoff, Hiroyuki Kurata, and Fred C. Boogerd, 制約付き最適化を使った動力学パラメータ推定手法の提案と大腸菌アンモニア同化-輸送ネットワークへの応用, 生命科学系フロンティアミーティング 2018, 三島, 2018年10月5日

前田和勲、Fred C. Boogerd、倉田博之、libRCGA: 動力学モデルの高速なパラメータ推定のための遺伝的アルゴリズムライブラリ、第55回　情報処理学会 バイオ情報学研究会、鶴岡、2018年9月18日

前田和勲、倉田博之、ネガティブフィードバック構造に基づく生物振動子の周期調節可能性の解析 、第51回　情報処理学会 バイオ情報学研究会、札幌、2017年9月26日

前田和勲、細胞のモデリングとシミュレーション、平成28年度 九州工業大学と山口大学のテニュアトラック合同シンポジウム、北九州、2017年1月31日

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Hans V. Westerhoff, and Hiroyuki Kurata, Developing a kinetic model of the E. coli ammonium assimilation network for the metabolic engineering of efficient glutamate fermentation, ICSB 2015 (The International Conference on Systems Biology), Singapore, (November 2015)

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, Multiparameter Sensitivity Analysis of Simple Oscillator Models, International Symposium on Synthetic Systems Biology: Synthetic Metabolic Pathway, Mathematical System Analysis and Design of Bio-inspired Systems Joint 14th Symposium of Biochemical Systems Theory (BST 2015), Fukuoka, Japan, (September 2015)

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, Systems Biology of Body Clocks: Toward a Cancer Therapy Based on a Systems Understanding of Circadian Rhythms, 計測自動制御学会 ライフエンジニアリング部門シンポジウム 2015, Iizuka, Japan, (September 2015)

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Hans V. Westerhoff, and Hiroyuki Kurata, Toward a quantitative in silico model for the E. coli ammonium assimilation system, BMIRC Symposium 2015, Iizuka, Japan, (March 2015)

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, Analytical study of robustness of a negative feedback oscillator by multiparameter sensitivity, GIW/ISCB-Asia 2014, Tokyo, Japan, (December 2014)

前田和勲、倉田博之、マルチパラメータ感度を用いたネガティブフィードバック振動子のロバストネス解析、生命情報科学若手の会　第6回研究会、神戸、2014年10月30日

前田和勲, Fred C. Boogerd, Frank J. Bruggeman, Hans V. Westerhoff, 倉田博之, 大腸菌アンモニア同化制御機構のダイナミックモデルの構築, 第35回　情報処理学会 バイオ情報学研究会、札幌、2013年9月20日

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Hans V. Westerhoff, Frank J. Bruggeman, and Hiroyuki Kurata, Dynamic modeling of E. coli ammonia assimilation system, FOSBE 2012, Tsuruoka, Japan, (October 2012)

前田和勲、倉田博之、大腸菌アンモニア同化システムのダイナミックモデルの構築、第30回　情報処理学会 バイオ情報学研究会、福岡、2012年8月9日

前田和勲、倉田博之、A Symmetric Dual Feedback System is a Robust and Entrainable Oscillator for Circadian Rhythm、生命情報科学若手の会　第3回研究会、岡崎、2011年10月16日

前田和勲、倉田博之、概日リズムのフィードバックシステムのロバストネス解析、第24回　情報処理学会 バイオ情報学研究会、京都、2011年3月10日

前田和勲、倉田博之、概日リズムのインターロックフィードバックのロバストネス解析、第17回　情報処理学会 バイオ情報学研究会、沖縄、2009年5月26日

前田和勲、倉田博之、インターロックフィードバックが概日リズムのロバストネスに与える効果、生命情報科学若手の会　第1回研究会、静岡、2009年4月26日

前田和勲、倉田博之、Two-phase search (TPS) 法: 動的生化学ネットワークモデルの偏りのない効率的なパラメータ探索、第14回　情報処理学会 バイオ情報学研究会、札幌、2008年9月18日

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, CADLIVE for Construction and Dynamic Simulation of Biochemical Networks, Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2007, Taipei, Taiwan, (November 2007)

前田和勲、吉田圭佑、倉田博之、大規模な動的生命分子ネットワークモデルのグローバルな最適化、情報処理学会　第66回　数理モデル化と問題解決研究会、名古屋、2007年9月4日

Kazuhiro Maeda, Aoi Hatae, Yukie Sakai and Hiroyuki Kurata, A hybrid approach for kinetic parameter estimation based on machine learning and global optimization, IIBMP2022, Osaka, (13 September 2022)

前田和勲、倉田博之、RCGAToolboxを使った遺伝子回路の自動設計、IIBMP2021、Online、2021年9月27日

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, and Hiroyuki Kurata, RCGAToolbox: A real-coded genetic algorithm software for parameter estimation of kinetic models, ISMB/ECCB 2021, Online, (July 2021)

前田和勲、倉田博之、RCGAToolbox: 生化学システムの動力学パラメータ推定のためのツールボックス、 IIBMP2020、福岡、2020年9月1日

Kazuhiro Maeda, Hans V. Westerhoff, Hiroyuki Kurata, and Fred C. Boogerd, The ‘rubber band method’ of ranking network mechanisms rather than claimi the single best: E. coli's active ammonium transport is 130 times better than the passive transport network, ICSB2019, OIST, Japan (1 November 2019)

Kazuhiro Maeda, Hans V. Westerhoff, Hiroyuki Kurata, and Fred C. Boogerd*, Ranking E. coli’s ammonium transport and assimilation networks, AIMMS Meeting, VU University Amsterdam, Netherlands (18 April 2019) *Presenter

Kazuhiro Maeda, Hans V. Westerhoff, Hiroyuki Kurata, and Fred C. Boogerd, Ranking E. coli’s ammonium transport and assimilation networks by how they fit diverse experiments, BioSB 2019, Lunteren, Netherlands (2-3 April 2019)

Kazuhiro Maeda, Hans V. Westerhoff, Hiroyuki Kurata, and Fred C. Boogerd, 大腸菌アンモニア輸送-同化システムのシミュレーション, 定量生物学の会 第９回年会, 大阪, 2019年1月13-14日

Kazuhiro Maeda, Hans V. Westerhoff, Hiroyuki Kurata, and Fred C. Boogerd, 大腸菌AmtBはアンモニアの能動輸送体か？それとも受動輸送体か？, The 41th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan, Yokohama, Japan, (November 2018)

Kazuhiro Maeda, Hans V. Westerhoff, Hiroyuki Kurata, and Fred C. Boogerd, 制約付き最適化を使った動力学パラメータ推定手法の提案と大腸菌アンモニア同化-輸送ネットワークへの応用, 生命科学系フロンティアミーティング 2018, 三島, 2018年10月5日-7日

前田和勲、倉田博之、ネガティブフィードバック構造に基づく生物振動子の頑健性と調節可能性の解析、IIBMP2018、P-29、鶴岡、2018年9月19日-21日

前田和勲、モデリングによって生命現象の仕組みに迫る、平成29年度 九州工業大学と山口大学のテニュアトラック合同シンポジウム、山口、2018年2月27日

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Hans V. Westerhoff, and Hiroyuki Kurata, A Modeling Approach for Analysis of Regulation of Glutamine Synthetase and Ammonium Transporter in E. coli, ACB 2015 (Asian Congress on Biotechnology), Kuala Lumpur, Malaysia (November 2015)

前田和勲, Fred C. Boogerd, Hans V. Westerhoff, 倉田博之, 大腸菌アンモニア同化制御の解析：ダイナミックモデリングによるアプローチ、生命情報科学若手の会　第7回研究会、鶴岡、2015年10月1日

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Hans V. Westerhoff, and Hiroyuki Kurata, Dynamic Modeling of the E. coli Ammonium Assimilation Network, GIW/InCoB 2015, Tokyo, Japan, (September 2015)

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Hans V. Westerhoff, and Hiroyuki Kurata, Toward a quantitative in silico model for the E. coli ammonium assimilation system, BMIRC Symposium 2015, Iizuka, Japan, (March 2015)

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Frank J. Bruggeman, Hans V. Westerhoff, and Hiroyuki Kurata, 大腸菌アンモニア同化システムのダイナミックモデル構築, 定量生物学の会 第七回年会, 福岡, 2015年1月11-12日

Hiroyuki Kurata, Yurie Sugimoto and Kazuhiro Maeda, BioFNet Database for Rational Design of Biological Systems, GIW/ISCB-Asia 2014, 16, Tokyo, Japan, (December 2014)

Hiroyuki Kurata and Kazuhiro Maeda, BioFNet: Biological Function Network Database, IIBMP2014, C-08, Sendai, Japan, (October 2014)

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, ネガティブフィードバック振動子のマルチパラメータ感度解析, IIBMP2014, C-02, Sendai, Japan, (October 2014)

Hiroyuki Kurata and Kazuhiro Maeda, BioFNet database supports analysis and synthesis of biochemical networks, ICSB 2014 (The International Conference on Systems Biology), Poster 125, Melbourne, Australia, (September 2014)

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, Robustness analysis of a negative feedback oscillator, ICSB 2014 (The International Conference on Systems Biology), Poster 124, Melbourne, Australia, (September 2014)

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Frank J. Bruggeman, Hans V. Westerhoff, and Hiroyuki Kurata, Toward a quantitative dynamic model for the E. coli ammonium assimilation system, The Second BMIRC International Symposium on Advances in Bioinformatics and Medical Engineering, Iizuka, Japan, (January 2014)

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, Multiparameter sensitivity as a robustness measure for dynamic biochemical models, 24th International Conference on Genome Informatics, Singapore, (December 2013)

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Frank J. Bruggeman, Hans V. Westerhoff, and Hiroyuki Kurata, Developing a dynamic model of the E. coli ammonium assimilation system, The 36th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan, Kobe, Japan, (December 2013)

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Frank J. Bruggeman, Hans V. Westerhoff, and Hiroyuki Kurata, 大腸菌アンモニア同化システムの定量的ダイナミックモデルの構築, 定量生物学の会 第六回年会, 大阪, 2013年11月23-24日

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Frank J. Bruggeman, Hans V. Westerhoff, and Hiroyuki Kurata, A quantitative model for kinetic regulation of the E. coli ammonium assimilation system, The 2013 Annual Conference of Japanese Society for Bioinformatics, Tokyo, Japan, (October 2013)

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, Quasi-multiparameter Sensitivity Analysis Reveals Mechanisms to Enhance Robustness in Circadian Oscillators, The First BMIRC International Symposium on Frontiers in Computational Systems Biology and Bioengineering, Iizuka, Japan, (February 2013)

Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Hans V. Westerhoff, Frank J. Bruggeman, and Hiroyuki Kurata, Dynamic modeling of E. coli ammonia assimilation system, FOSBE 2012, Tsuruoka, Japan, (October 2012)

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, Dual Feedback Loop Architecture is a Robust and Entrainable Oscillator for Circadian Rhythm, The 12th International Conference on Systems Biology, PS232, Mannheim, Germany, (August 2011)

Kazuhiro Maeda, Hiroshi Minamida, Keisuke Yoshida, and Hiroyuki Kurata, Flux Module-based Decomposition for Parameter Optimization in a Dynamic Model of Biochemical Networks, The 2010 Annual Conference of Japanese Society for Bioinformatics, Fukuoka, Japan, (December 2010)

Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, Yuki Kato, Hiroyuki Kurata, CADLIVE: A platform for network modeling and simulation of biological pathway, The 2010 Annual Conference of Japanese Society for Bioinformatics, Fukuoka, Japan, (December 2010)

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, Quasi-Multiparameter Sensitivity Analysis Reveals Remarkable Robustness of Dual Feedback Circadian Oscillators, The 11th International Conference on Systems Biology, P02.180, Edinburgh, UK, (October 2010)

Kazuhiro Maeda, Yuya Fukano, Daichi Nitta, Shunsuke Yamamichi, and Hiroyuki Kurata, An integrative strategy for optimizing large-scale biochemical systems, InCoB2010 -The 9th International Conference on Bioinformatics, Tokyo, Japan, (September 2010)

Hiroshi Minamida, Kazuhiro Maeda, and Hiroyuki Kurata, Exploring huge parameter space of a large-scale model of biochemical networks, InCoB2010 -The 9th International Conference on Bioinformatics, Tokyo, Japan, (September 2010)

Sayaka Tomeda, Shinpei Tonami, Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, and Hiroyuki Kurata, Extended CADLIVE: Multi-User Framework and Data Integrator, The 20th International Conference on Genome Informatics, S004, Yokohama, Japan, (December 2009)

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, Novel Robustness Analysis Reveals Remarkable Robustness of Dual Feedback Loops in a Circadian Clock, The 20th International Conference on Genome Informatics, P065, Yokohama, Japan, (December 2009)

前田和勲、井上健太郎、留田紗彌可、倉田博之、CADLIVE: 生化学ネットワーク構築からシステム解析まで、統合データベースプロジェクトシンポジウム「データベースが拓くこれからのライフサイエンス」、東京、2009年6月12日

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, Searching multiple sets of kinetic parameter values reproducing target experimental data in dynamic biochemical models, The 2008 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics, Osaka, Japan, (December 2008)

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, CADLIVE Supporting Network Construction, Simulation, and Analysis of Biological Systems, The 2nd Taiwan-Japan Young Researchers Conference on Computational and Systems Biology, Tokyo, Japan, (November 2008)

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata, Parameter Search of Large-scale Dynamic Biochemical Network Models, The 2007 Annual Conference of Japanese Society for Bioinformatics, Tokyo, Japan, (December 2007)

Yuki Shimokawa, Kazuhiro Maeda, Kentaro Inoue, and Hiroyuki Kurata, CADLIVE: Integration for large-scale network data, The 17th International Conference on Genome Informatics, S02, Yokohama, Japan, (December 2006)