太字, 昆虫遺伝研所属者
*, 責任著者
†, equal contribution
Katsuma S*, Matsuda-Imai N, Muro T, Yoda M, Kawaoka S, Kiuchi T. Identification of two Wolbachia genes with cell proliferation-inhibitory activity in Ostrinia cultured cells. mBio 2026: e0007426. DOI: 10.1128/mbio.00074-26 農学生命科学研究科HP記事
Tomihara K†, Pinharanda A†, Kwon YM, Taverner AM, Kors LS, Aardema ML, Holder JC, Poyraz L, Kiuchi T*, Andolfatto P.* Cis-regulatory evolution of Wnt family genes contributes to a morphological difference between silkworm species. PLoS Biol. 2026: 24(3): e3003605. DOI: 10.1371/journal.pbio.3003605 農学生命科学研究科プレスリリース
Fukui T, Muro T, Matsuda-Imai N, Kaneda T, Kosako H, Hiraki H, Shoji K, Fujii T, Suzuki Y, Toyoda A, Itoh T, Kiuchi T, Katsuma S*. Complete transition from chromosomal to cytoplasmic sex determination during prolonged Wolbachia symbiosis. Nat Commun. 2026: 17, 104. DOI: 10.1038/s41467-025-67993-x 農学生命科学研究科プレスリリース, 朝日新聞記事(2026年1月21日掲載)
Tobita H*, Kiuchi T*. Pigment-dispersing factor is not essential for eclosion rhythm and inducing the photoperiodic diapause in the silkworm, Bombyx mori. J Isect Physiol. 2026: 168, 104914. DOI: 10.1016/j.jinsphys.2025.104914
Fujimoto S†, Fujimaki K†, Katsuma S, Iwanaga M*. Involvement of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus GP37 in the postmortem host liquefaction. J Invertebr Pathol. 2025: 214, 108469. DOI: 10.1016/j.jip.2025.108469
Fujimoto T, Katsuma S, Sahara K*. Non-directional pairing of the WZ chromosome bivalent in Bombyx mori. J Insect Biotechnol Sericology. 2025: 94, 19-22. DOI: 10.11416/jibs.94.2_019
Kaneda T, Matsuda-Imai N, Kosako H, Shoji K, Suzuki MG, Suzuki Y, Kiuchi T, Katsuma S*. The Masc–PSI complex directly induces male-type doublesex splicing in silkworms. Commun Biol. 2025: 8, 927. DOI: 10.1038/s42003-025-08350-y 農学生命科学研究科プレスリリース
Arai H*, Wijonarko A, Katsuma S, Naka H, Kageyama D, Hornett EA, Hurst GDD. Evolution of Wolbachia male-killing mechanism within a host species. Curr Biol. 2025: S0960-9822(25)00312-4. DOI: 10.1016/j.cub.2025.03.027
Muro T*, Fujii T, Katsuma S*. Interspecific differences in the abdominal hair and mid-tibial traits are likely determined by a single locus in Ostrinia moths (Lepidoptera: Crambidae). Appl Entomol Zool. 2025: 60, 183-190. DOI: 10.1007/s13355-025-00907-x
Arai H*, Katsuma S, Matsuda-Imai N, Shiou-Ruei Lin, Inoue N M, Kageyama D*. Prophage-encoded Hm-oscar gene recapitulates Wolbachia-induced male-killing in the tea tortrix moth Homona magnanima. eLife. 2025: 13, RP101101. DOI: 10.7554/eLife.101101
Katsuma S*, Fukaura K, Matsuda-Imai N. Specific nucleotide substitutions in the burst sequence enhance polyhedrin expression in alphabaculoviruses: improvement of baculovirus expression vectors. Appl Environ Microbiol. 2025: e0014425. DOI: 10.1128/aem.00144-25
Yu J, Kawasaki F, Izumi N, Kiuchi T, Katsuma S, Tomari Y*, Shoji K*. Autonomous shaping of the piRNA sequence repertoire by competition between adjacent ping-pong amplification sites. Mol Cell. 2025: 85, 1134-1146. DOI: 10.1016/j.molcel.2025.02.015 東京農工大学プレスリリース, 日本経済新聞記事(2025年3月21日掲載)
Kokusho R*, Katsuma S*. Baculoviruses remodel the cytoskeleton of insect hemocytes to breach the host basal lamina. Commun Biol. 2025: 8(1), 268. DOI: 10.1038/s42003-025-07579-x 農学生命科学研究科プレスリリース, 日本経済新聞記事(2025年3月22日掲載)
baculovirusの膜タンパク質ARIF-1 が宿主血球の細胞骨格を操作して浸潤突起を形成させることで、組織表面の基底膜バリアを破壊して組織内部への侵入効率を劇的に向上させていることを明らかにした論文。arif-1自体は以前から見つけていたのだが(Kokusho et al., J Gen Virol, 2015)、当初は作用機序が分からず、膨大な組織観察の過程で「感染組織では表面に血球がくっついているように見えるかも?」と気づいたことが解明のきっかけとなった。やはり観察は大事。リバイズで厳密な定量性を求められて、大量の組織免染をやり直す羽目になったのも今となってはいい思い出。(國生)
Hikida H*, Kokusho R, Katsuma S*. BV/ODV-E26 is a conserved baculoviral inhibitory factor for optimizing viral virulence in lepidopteran hosts. iScience. 2025: 28(2), 111723. DOI: 10.1016/j.isci.2024.111723
Kamiyama T†, Shimada-Niwa Y*†, Mori H, Tani N, Takemata-Kawabata H, Fujii M, Takasu A, Katayama M, Kuwabara T, Seike K, Matsuda-Imai N, Senda T, Katsuma S, Nakamura A, Niwa R*. Parasitoid wasp venoms degrade Drosophila imaginal discs for successful parasitism. Sci Adv. 2025: 11(5), eadq8771. DOI: 10.1126/sciadv.adq8771 筑波大学プレスリリース, 日本経済新聞記事(2025年1月30日掲載)
Tobita H*, Kiuchi T*. Knockout of cryptochrome 1 disrupts circadian rhythm and photoperiodic diapause induction in the silkworm, Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2024: 172, 104153. DOI: 10.1016/j.ibmb.2024.104153
Katsuma S*, Matsuda-Imai N. Codon Optimization-based Whole-gene Scanning Identifies Hidden Nucleotides Essential for Bombyx mori Nucleopolyhedrovirus polyhedrin Hyperexpression. J Mol Biol. 2024: 436(12), 168595. DOI: 10.1016/j.jmb.2024.168595
Fukui T, Kiuchi T, Tomihara K, Muro T, Matsuda-Imai N, Katsuma S*. Expression of the Wolbachia male-killing factor Oscar impairs dosage compensation in lepidopteran embryos. FEBS Lett. 2023: 598(3), 331-337. DOI: 10.1002/1873-3468.14777
Kiuchi T*, Shoji K, Izumi N, Tomari Y, Katsuma S*. Non-gonadal somatic piRNA pathways ensure sexual differentiation, larval growth, and wing development in silkworms. PLoS Genet. 2023: 19(9), e1010912. DOI: 10.1371/journal.pgen.1010912 農学生命科学研究科プレスリリース
Sugiyama H†, Katsuma S*†. A method for screening the suppressor genes of siRNA and piRNA pathways using cultured silkworm cells. microPubl Biol. 2023. DOI: 10.17912/micropub.biology.000953
Katsuma S*, Matsuda-Imai N. A seamless connection from the burst sequence to the start codon is essential for polyhedrin hyperexpression in alphabaculoviruses. Biochem Biophys Res Commun. 2023: 679, 1-5. DOI: 10.1016/j.bbrc.2023.08.046
Tomihara K*, Kiuchi T*. Disruption of a BTB-ZF transcription factor causes female sterility and melanization in the larval body of the silkworm, Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2023: 159, 103982. DOI: 10.1016/j.ibmb.2023.103982
Fukui T, Shoji K, Kiuchi T, Suzuki Y, Katsuma S*. Masculinizer is not post-transcriptionally regulated by female-specific piRNAs during sex determination in the Asian corn borer, Ostrinia furnacalis. Insect Biochem Mol Biol. 2023: 156, 103946. DOI: 10.1016/j.ibmb.2023.103946
Tomihara K*, Tanaka S, Katsuma S, Shimada T, Kobayashi J, Kiuchi T*. Recessive embryonic lethal mutations uncovered in heterozygous condition in silkworm semiconsomic strains. Insect Biochem Mol Biol. 2023: 155, 103933. DOI: 10.1016/j.ibmb.2023.103933
Fujimoto S, Fujimaki K, Suzuki T, Katsuma S, Iwanaga M*. Expression and localization of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus GP37. Virus Genes. 2023: 59(3), 457-463. DOI: 10.1007/s11262-023-01983-3
Shoji K*, Umemura Y, Katsuma S, Tomari Y*. The piRNA cluster torimochi is an expanding transposon in cultured silkworm cells. PLoS Genet. 2023: 19(2), e1010632. DOI: 10.1371/journal.pgen.1010632
Muro T, Hikida H, Fujii T, Kiuchi T, Katsuma S*. Two Complete Genomes of Male-Killing Wolbachia Infecting Ostrinia Moth Species Illuminate Their Evolutionary Dynamics and Association with Hosts. Microb Ecol. 2023: 86, 1740-1754. DOI: 10.1007/s00248-023-02198-7
Izumi N†, Shoji K†, Kiuchi T, Katsuma S, Tomari Y*. The two Gtsf paralogs in silkworms orthogonally activate their partner PIWI proteins for target cleavage. RNA. 2022: 29(1), 18-29. DOI: 10.1261/rna.079380.122
Katsuma S*†, Hirota K†, Matsuda-Imai N†, Fukui T, Muro T, Nishino K, Kosako H, Shoji K, Takanashi H, Fujii T, Arimura S, Kiuchi T. A Wolbachia factor for male killing in lepidopteran insects. Nat Commun. 2022: 13(1), 6764. DOI: 10.1038/s41467-022-34488-y 農学生命科学研究科プレスリリース
Hikida H*, Katsuma S. KaicoTracker: a robust and automated locomotory analysis for baculovirus-infected silkworm larvae. J Insect Biotechnol Sericology. 2022: 91(2), 2-26. DOI: 10.11416/jibs.91.2_021
Tobita H, Kiuchi T*. Knockouts of positive and negative elements of the circadian clock disrupt photoperiodic diapause induction in the silkworm, Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2022: 149, 103842. DOI: 10.1016/j.ibmb.2022.103842
Tomihara K†, Kawamoto M, Suzuki Y, Katsuma S*, Kiuchi T*†. Masculinizer-induced dosage compensation is achieved by transcriptional downregulation of both copies of Z-linked genes in the silkworm, Bombyx mori. Biol Lett. 2022: 18(9), 20220116. DOI: 10.1098/rsbl.2022.0116
Katsuma S*. Mutations in the polyhedrin NLS affect the assembly and polyhedral shape of alphabaculovirus occlusion bodies. Biochem Biophys Res Commun. 2022: 622, 15-21. DOI: 10.1016/j.bbrc.2022.07.023
Tomihara K*, P Andolfatto, Kiuchi T*. Allele-specific knockouts reveal a role for apontic-like in the evolutionary loss of larval melanin pigmentation in the domesticated silkworm, Bombyx mori. Insect Mol Biol. 2022: 31(6), 701-710. DOI: 10.1111/imb.12797
Ito K*, Sivaprasad V, Katsuma S, Yokoyama T, Kadono-Okuda K. Resistance mechanism of Nid-1, a dominant non-susceptibility gene, against Bombyx mori densovirus 1 infection. Virus Res. 2022: 198849. DOI: 10.1016/j.virusres.2022.198849
Kawamoto M*, Kiuchi T, Katsuma S. SilkBase: an integrated transcriptomic and genomic database for Bombyx mori and related species. Database. 2022: Vol.2022, baac040. DOI: 10.1093/database/baac040
Tomihara K, Katsuma S*, Kiuchi T*. Transcriptome analysis in the silkworm Bombyx mori overexpressing piRNA-resistant Masculinizer gene. Biochem Biophys Res Commun. 2022: 616, 104-109. DOI: 10.1016/j.bbrc.2022.05.073
Kiuchi T*, Katsuma S. Functional Characterization of Silkworm PIWI Proteins by Embryonic RNAi. Methods Mol Biol. 2022: 2360, 19-31. DOI: 10.1007/978-1-0716-1633-8_3
Tomihara K, Satta K, Matsuzaki S, Yoshitake K, Yamamoto K, Uchiyama H, Yajima S, Futahashi R, Katsuma S, Osanai-Futahashi M*, Kiuchi T*. Mutations in a β-group of solute carrier gene are responsible for egg and eye coloration of the brown egg 4 (b-4) mutant in the silkworm, Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2021: 137, 103624. DOI: 10.1016/j.ibmb.2021.103624
Shigematsu M, Kawamura T, Morichika K, Izumi N, Kiuchi T, Honda S, V Pliatsika, Matsubara R, I Rigoutsos, Katsuma S, Tomari Y, Kirino Y*. RNase κ promotes robust piRNA production by generating 2′,3′-cyclic phosphate-containing precursors. Nat Commun. 2021: 12(1), 4498. DOI: 10.1038/s41467-021-24681-w
Shoji K†, Kokusho R†, Kawamoto M, Suzuki Y, Katsuma S*†. H3K4me3 histone modification in baculovirus-infected silkworm cells. Virus Genes. 2021: 57, 459–463. DOI: 10.1007/s11262-021-01858-5
Fujii T, Kiuchi T, Daimon T, Ito K, Katsuma S, Shimada T, Yamamoto K, Banno Y. Development of interspecific semiconsomic strains between the domesticated silkworm, Bombyx mori and the wild silkworm, B. mandarina. J Insect Biotechnol Sericology. 2021: 90(2), 33-40. DOI: 10.11416/jibs.90.2_033
Kokusho R*, Katsuma S*. Bombyx mori nucleopolyhedrovirus ptp and egt genes are dispensable for triggering enhanced locomotory activity and climbing behavior in Bombyx mandarina larvae. J Invertebr Pathol. 2021: 107604. DOI: 10.1016/j.jip.2021.107604
Kokusho R*, Katsuma S*. Loss of p24 from the Bombyx mori nucleopolyhedrovirus genome results in the formation of cuboidal occlusion bodies. Virology. 2021: 559, 173-181. DOI: 10.1016/j.virol.2021.03.017
Dai X, Kiuchi T, Zhou Y, Jia S, Xu Y, Katsuma S, Shimada T, Wang H*. Horizontal gene transfer and gene duplication of β-fructofuranosidase confer lepidopteran insects metabolic benefits. Mol Biol Evol. 2021: msab080. DOI: 10.1093/molbev/msab080
Hirota K, Matsuda-Imai N, Kiuchi T, Katsuma S*. Characterization of nuclear localization signal in Ostrinia furnacalis Masculinizer protein. Arch Insect Biochem Physiol. 2021: 106(3), e21768. DOI: 10.1002/arch.21768
Katsuma S*. Hsp90 function is required for stable transcription of the baculovirus transactivator ie-1 gene. Virus Res. 2021: 291, 198200. DOI: 10.1016/j.virusres.2020.198200
Katsuma S*, Shoji K, Suzuki Y, Iwanaga M. Potential for small RNA production against Bombyx mori latent virus in Bombyx mori ovaries. Arch Insect Biochem Physiol. 2020: e21761. DOI: 10.1002/arch.21761
Katsuma S*†, Shoji K†, Suzuki Y, Kiuchi T. CRISPR/Cas9-mediated mutagenesis of Ago2 and Siwi in silkworm cultured cells. Gene. 2020: 145314. DOI: 10.1016/j.gene.2020.145314
Senaratne AP, Muller H, Fryer KA, Kawamoto M, Katsuma S, Drinnenberg IA*. Formation of the CenH3-deficient holocentromere in Lepidoptera avoids active chromatin. Curr Biol. 2020: S0960-9822(20)31448-2. DOI: 10.1016/j.cub.2020.09.078
Hikida H*, Katsuma S. High-resolution analysis of baculovirus-induced host manipulation in the domestic silkworm, Bombyx mori. Parasitology. 2020: 1-5. DOI: 10.1017/S0031182020001924
Matsuda-Imai N†, Katsuma S*†. Characterization of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus infection in fat body-derived Bombyx mori cultured cells. J Invertebr Pathol. 2020: 177, 107476. DOI: 10.1016/j.jip.2020.107476
Lee J*, Nishiyama T, Shigenobu S, Yamaguchi K, Suzuki Y, Shimada T, Katsuma S, Kiuchi T. The genome sequence of Samia ricini, a new model species of lepidopteran insect. Mol Ecol Resour. 2020: 21, 327-339. DOI: 10.1111/1755-0998.13259
Hikida H, Kokusho R, Matsuda-Imai N, Katsuma S*. Bombyx mori nucleopolyhedrovirus Bm96 suppresses viral virulence in Bombyx mori larvae. J Invertebr Pathol. 2020: 173, 107374. DOI: 10.1016/j.jip.2020.107374
疋田くんの第二弾論文.國生くんが博士論文で解析していた行動関連遺伝子Bm96の仕事をまとめたもの.表現型としては強いものではないので,なかなか強い主張ができなかったが,なんとか論文として発表することができた.この論文では,疋田くんの新しい行動アッセイ系を用いているが,これについては,現在,別論文として論文投稿中である(國生追記:Hikida* & Katsuma, Parasitology, 2020としてpublishされました).(勝間)
Cortes-Silva N, Ulmer J, Kiuchi T, Hsieh E, Cornilleau G, Ladid I, Dingli F, Loew D, Katsuma S, Drinnenberg IA*. CenH3-Independent Kinetochore Assembly in Lepidoptera Requires CCAN, Including CENP-T. Curr Biol. 2020: 30(4), 561-572.e10. DOI: 10.1016/j.cub.2019.12.014
Izumi N†, Shoji K†, Suzuki Y, Katsuma S, Tomari Y*. Zucchini consensus motifs determine the mechanism of pre-piRNA production. Nature. 2020: 578(7794), 311-316. DOI: 10.1038/s41586-020-1966-9
Izumi et al., Cell, 2019の論文から約4年,泉さんと泊研に異動した庄司くん(現在,泊研助教)がBmN-4細胞の実験系を用いて,Zuc依存的,非依存的なpiRNA産生経路を解明しました.泉さんの生化学と庄司くんのインフォマティクスがうまく融合したすばらしい結果です.庄司くんは博士課程時代からインフォ解析を行っており, Shoji et al., RNA, 2017で開発した方法を改良して,Zucの認識配列の同定につなげました.以下の記事にこの研究成果とともにBmN-4細胞を用いたpiRNA経路の歴史が紹介されています.(勝間)
Fujii T*†, Sakurai T†, Mitsuno H†, Matsuyama S, Shiota Y, Ito K, Yokoyama T, Nishioka T, Katsuma S, Kanzaki R, Ishikawa Y. Pheromonal activities of the bombykol isomer, (10E,12E)-10,12-hexadecadien-1-ol, in the pheromone gland of the silkmoth Bombyx mori. J Insect Physiol. 2020: 121, 104018. DOI: 10.1016/j.jinsphys.2020.104018
Fujimoto S, Kawamoto M, Shoji K, Suzuki Y, Katsuma S, Iwanaga M*. Whole-genome sequencing and comparative transcriptome analysis of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus La strain. Virus Genes. 2020: 56, 249-259. DOI: 10.1007/s11262-019-01727-2
Zhou Y, Li X, Katsuma S, Xu Y, Shi L, Shimada T, Wang H*. Duplication and Diversification of Trehalase Confers Evolutionary Advantages on Lepidopteran Insects. Mol Ecol. 2019: 24, 5282-5298. DOI: 10.1111/mec.15291
Katsuma S†*, Shoji K†, Sugano Y, Suzuki Y, Kiuchi T. Masc-induced dosage compensation in silkworm cultured cells. FEBS Open Bio. 2019: 9(9), 1573–1579. DOI: 10.1002/2211-5463.12698
Katsuma* et al., J Biol Chem, 2015の続き.Masc依存的オス化の培養細胞でのアッセイ系はすでに(18)で確立していた.そこで,カイコのBmN-4, M1の2つの培養細胞とRNA-seqを用いて,遺伝子量補償をアッセイする実験系ができないかどうかを検討した.その結果,BmN-4細胞を用いた実験系において,微細な変化ではあるが,Masc過剰発現時にZ染色体上の遺伝子群の発現が低下することがわかった.また,この実験系を用いて,301番目のシステイン(以前の研究で,オス化に重要であることが判明しているアミノ酸残基)が遺伝子量補償にも関与していることを明らかにした.この論文はFEBS lettersに投稿したが,リジェクトされたため,おすすめ転送先のFEBS Open Bioに初めて投稿した.(勝間)
Tomihara K, Satta K, Shimada T, Kiuchi T*. CRISPR/Cas9-mediated somatic mutation of the sex-linked translucent (os) gene in the silkworm, Bombyx mori. J Insect Biotechnol Sericology. 2019: 88(2), 31-38. DOI: 10.11416/jibs.88.2_031
Kawamoto M†, Jouraku A†, Toyoda A, Yokoi K, Minakuchi Y, Katsuma S, Fujiyama A, Kiuchi T*, Yamamoto K*, Shimada T*. High-quality genome assembly of the silkworm, Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2019: 107, 53-62. DOI: 10.1016/j.ibmb.2019.02.002
Tsukui K†, Yagisawa C†, Fujimoto S†, Ogawa M, Kokusho R, Nozawa M, Kawasaki H, Katsuma S, Iwanaga M*. Infectious Virions of Bombyx mori Latent Virus Are Incorporated into Bombyx Mori Nucleopolyhedrovirus Occlusion Bodies. Viruses. 2019: 11(4). DOI: 10.3390/v11040316 宇都宮大学プレスリリース
Kiuchi T*, Sugano Y, Shimada T, Katsuma S*. Two CCCH-type zinc finger domains in the Masc protein are dispensable for masculinization and dosage compensation in Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2019: 104, 30-38. DOI: 10.1016/j.ibmb.2018.12.003
木内くんのCRISPR/Cas9によるMasc KOカイコの解析.様々な領域を欠損したMasc変異体を作成し,それらの性状を解析することで,Mascタンパク質の大きな特徴であるZinc Fingerドメインがオス化にも遺伝子量補償にも必須ではないことが明らかになった.培養細胞の研究(Katsuma* et al., J Biol Chem, 2015)において,Zinc Fingerドメインがオス化に関与しないということは示されていたが,個体においてそれを示した点は大きいといえる.(勝間)
Fukui T, Kiuchi T, Shoji K, Kawamoto M, Shimada T, Katsuma S*. In vivo masculinizing function of the Ostrinia furnacalis Masculinizer gene. Biochem Biophys Res Commun. 2018: 503(3), 1768-1772. DOI: 10.1016/j.bbrc.2018.07.111
Fukui†, Kawamoto†, Shoji†, Kiuchi† et al., PLoS Pathog, 2015 の続き.アワノメイガの卵塊から胚子を一個一個単離する方法とRNAiを合わせて,アワノメイガMascがオス化に関与することを個体において証明した研究.福井くんの修士論文の一部であり,彼の卒業後にまとめて論文化した.この研究で見つかった知見の一つが現在のプロジェクトのきっかけになっている.なお,福井くんは2020年度から,また,ラボの一員として復帰することになった.(勝間)
Takai H, Ozawa R, Takabayashi J, Fujii S, Arai K, Ichiki RT, Koeduka T, Dohra H, Ohnishi T, Taketazu S, Kobayashi J, Kainoh Y, Nakamura S, Fujii T, Ishikawa Y, Kiuchi T, Katsuma S, Uefune M, Shimada T, Matsui K*. Silkworms suppress the release of green leaf volatiles by mulberry leaves with an enzyme from their spinnerets. Sci Rep. 2018: 8 (1), 11942. DOI: 10.1038/s41598-018-30328-6
Wang L, Dong Z, Wang J, Yin Y, Liu H, Hu W, Peng Z, Liu C, Li M, Banno Y, Shimada T, Xia Q, Zhao P*. Proteomic Analysis of Larval Integument in a Dominant Obese Translucent (Obs) Silkworm Mutant. J Insect Sci. 2018: 18(6), 4. DOI: 10.1093/jisesa/iey098
Zhang H, Kiuchi T, Hirayama C, Banno Y, Katsuma S, Shimada T*. A reexamination on the deficiency of riboflavin accumulation in Malpighian tubules in larval translucent mutants of the silkworm, Bombyx mori. Genetica. 2018: 146(4-5), 425-431. DOI: 10.1007/s10709-018-0034-y
Ito K*, Kidokoro K, Katsuma S, Sezutsu H, Uchino K, Kobayashi I, Tamura T, Yamamoto K, Mita K, Shimada T, Kadono-Okuda K*. A single amino acid substitution in the Bombyx-specific mucin-like membrane protein causes resistance to Bombyx mori densovirus. Sci Rep. 2018: 8(1), 7430. DOI: 10.1038/s41598-018-25388-7
Takai H, Asaoka K, Ishizuna F, Kiuchi T, Katsuma S, Shimada T*. Morphological and electrophysiological differences in tarsal chemosensilla between the wild silkmoth Bombyx mandarina and the domesticated species Bombyx mori. Arthropod Struct Dev. 2018: 47 (3), 238-247. DOI: 10.1016/j.asd.2018.03.001
Hikida H, Kokusho R, Kobayashi J, Shimada T, Katsuma S*. Inhibitory role of the Bm8 protein in the propagation of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus. Virus Res. 2018. DOI: 10.1016/j.virusres.2018.03.011
疋田くんの第一弾論文. (Katsuma* et al., J Virol, 2012)の論文で組織トロピズムに関与することが明らかになったBm8の続報である.前の論文では主に絹糸腺,中腸,脂肪体に注目していたが,今回の論文では小林淳先生の研究ですでに明らかになっていた前胸腺をはじめとする他組織における遺伝子発現を調査することで,Bm8がBmNPVの増殖に対して,全ての組織で抑制的に働く因子であること明らかにした.ちょうど蚕糸学会に参加しているときにアクセプトメールがきたのを覚えている.(勝間)
Zhang H, Kiuchi T, Hirayama C, Katsuma S, Shimada T*. Bombyx ortholog of the Drosophila eye color gene brown controls riboflavin transport in Malpighian tubules. Insect Biochem Mol Biol. 2018: 92, 65-72. DOI: 10.1016/j.ibmb.2017.11.012
Katsuma S*†, Kawamoto M†, Shoji K†, Aizawa T†, Kiuchi T, Izumi N, Ogawa M, Mashiko T, Kawasaki H, Sugano S, Tomari Y, Suzuki Y, Iwanaga M*. Transcriptome profiling reveals infection strategy of an insect maculavirus. DNA Res. 2018: 25 (3), 277–286. DOI: 10.1093/dnares/dsx056 農学生命科学研究科プレスリリース
カイコマキュラウイルス(以前はBmMLVと呼んでいましたが,現在はBmLVと名前を変えています)は植物ウイルスに属しますが,これまで調べられた限りではカイコの培養細胞以外では増殖することができません.この研究では,まず,トランスクリプトーム解析を行うことによって,BmN-4細胞の約15%のmRNAがBmLV由来であることを明らかにしました.また,BmN-4由来の小分子RNAにはBmLV由来のpiRNAとsiRNAが存在すること,そしてこれらがBmLVの過剰な蓄積を抑制していることを明らかにしました.実際,SiwiやAgo2の発現を抑制するとBmLV由来のmRNAが増加し,細胞の生存率が低下することがわかりました.この結果から,ウイルスRNAはゲノムに挿入されていなくてもpiRNA経路に認識されることがわかりました.論文は最初PLoS Pathogens誌に投稿しましたが,2回のリバイズの後でリジェクトされるという経過を辿りました.最終的には,かなりのデータを抜いた状態でDNA Research誌にアクセプトされました.成仏していないデータはなんとかしないといけません...(勝間)
Lee J, Kiuchi T*, Kawamoto M, Shimada T, Katsuma S*. Accumulation of uric acid in the epidermis forms the white integument of Samia ricini larvae. PLoS One. 2018: 13(10), e0205758. DOI: 10.1371/journal.pone.0205758
Katsuma S*. The very late promoter-driven ptp transcription can rescue the ELA-defective phenotype of a ptp-disrupted BmNPV. J Insect Biotechnol Sericology, 2018; 87 (1), 25–28. DOI: 10.11416/jibs.87.1_025
PTP論文第三弾.当初は(Katsuma*, J Invertebr Pathol, 2015)の論文に含まれていたデータであるが,査読時に一緒だと混乱するから本体から削除した方が良いと言われたデータを短報としてまとめた.ちょうどヘルニアの厳しいリハビリ期間であり,実験できないので論文でも書こうと考えてまとめた記憶がある.ポリヘドリンプロモータでのptpの過剰発現でも(少しdelayするが)行動惹起はレスキューされることがわかった. 単著第三弾である.(勝間)
Namiki S*, Fujii T, Shimada T, Kanzaki R*. The morphology of antennal lobe projection neurons is controlled by a POU-domain transcription factor Bmacj6 in the silkmoth Bombyx mori. Sci Rep. 2017: 7(1), 14050. DOI: 10.1038/s41598-017-14578-4
Zhang H, Kiuchi T, Wang L, Kawamoto M, Suzuki Y, Sugano S, Banno Y, Katsuma S, Shimada T*. Bm-muted, orthologous to mouse muted and encoding a subunit of the BLOC-1 complex, is responsible for the otm translucent mutation of the silkworm Bombyx mori. Gene. 2017: 629, 92-100. DOI: 10.1016/j.gene.2017.07.071
Katsuma S*, Kokusho R. A conserved glycine residue is required for proper functioning of a baculovirus VP39 protein. J Virol. 2017: 91(6), e02253-16. DOI: 10.1128/JVI.02253-16
突然変異誘起剤であるブロモデオキシウリジンを投与して作出したFP変異体の原因が主要キャプシドタンパク質であるVP39における1アミノ酸置換であることを報告した論文.VP39の機能に重要なアミノ酸を同定した初めての論文であるとともに,キャプシド形成と最後期遺伝子発現の関係を明らかにした重要な報告であると考えている.ほとんどのデータは2012年に取り終えていたが,性決定プロジェクトの方が忙しくなり,5年ほど放置してしまった.幸い國生くんが電顕のデータを取ってくれたので,非常に厚みのある内容にすることができた.電顕室の石綱さんにも大変お世話になった(ありがとうございます).この論文は当該号のSpotlight(注目論文)に選ばれた.このように自分で変異体を作り出し,何百のクローンの中から表現型ベースで変異体を選び出し,変異領域をマーカーレスキューで決定し,最終的に組換えウイルスの作成によって遺伝子を確定する古典的な方法,今でも一番好きかもしれません.(勝間)
Shoji K, Suzuki Y, Sugano S, Shimada T, Katsuma S*. Artificial ping-pong cascade of PIWI-interacting RNA in silkworm cells. RNA. 2017: Vol.23, No.1, 86-97. DOI: 10.1261/rna.058875.116 農学生命科学研究科プレスリリース
庄司くんが昆虫遺伝研に所属していた時に出したラスト論文.カイコBmN-4細胞を利用して,piRNAのping-pongサイクルの存在を実験的に証明した論文である.また,この実験系を利用して,piRNAがターゲット配列を認識するのに必要な配列の条件を探索し,5'末端から17塩基分連続した相補性があればpiRNAによってターゲット配列を認識できること,および22塩基分の相補性があればそれ以上の相補性は認識効率には影響しないことを明らかにした.この実験系を利用した研究は現在も発展継続中です.論文を最初に投稿してからアクセプトされるまで約1年を要したが,最終的には良い論文になったと思います.(勝間)
Kokusho R*, Koh Y, Fujimoto M, Shimada T, Katsuma S*. Bombyx mori nucleopolyhedrovirus BM5 protein regulates progeny virus production and viral gene expression. Virology. 2016: 498, 240–249. DOI: 10.1016/j.virol.2016.08.032
國生くんの第三弾論文.最初はウイルス誘導性徘徊行動に関与する遺伝子として解析していたBm5を,変異体の性状解析を中心にしてまとめたもの.BM5が核膜の内側に沿って局在するタンパク質であり,ウイルス遺伝子の発現やウイルス産生量に関与することを示した.植物分子遺伝学研究室とのコラボレーションにより,非常に美しい共焦点画像を取得することができた(ありがとうございます).國生くん初のコレス論文である.(勝間)
Katsuma S*. Transcription of dbp from the coding region of the Bm17 gene is required for the efficient propagation of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus. Virus Res. 2016: 223, 57–63. DOI: 10.1016/j.virusres.2016.06.018
2016年の年始にMacのデータを整理している時に思い出した昔のデータをまとめたもの.同じ遺伝子の変異体なのに表現型が異なるのは?という疑問を転写開始点のマッピング結果から考察したもの.7年以上眠っていたデータを昔のノートの記述を元に思い出し,正月明けから執筆した.結局,再実験をすることになり,思っていたより時間がかかった.単著第二弾である.(勝間)
Sakai H†, Sumitani M†, Chikami Y, Yahata K, Uchino K, Kiuchi T, Katsuma S, Aoki F, Sezutsu H, Suzuki MG*. Transgenic Expression of the piRNA-Resistant Masculinizer Gene Induces Female-Specific Lethality and Partial Female-to-Male Sex Reversal in the Silkworm, Bombyx mori. PLoS Genet. 2016: 12 (8), e1006203. DOI: 10.1371/journal.pgen.1006203 新領域創成科学研究科プレスリリース, マイナビニュースTECH+記事(2016年9月15日掲載)
新領域研究科の鈴木雅京准教授,農研機構の瀬筒先生のグループとの共同研究.piRNA抵抗性のMascを導入したトランスジェニックカイコの解析によって,メスで精子が形成されるなど,Mascタンパク質のオス化能を実証することができた.Natureにほぼアクセプトの状態であった2014年の蚕糸学会で瀬筒先生に共同研究をお願いし,その研究を酒井くんと笠嶋さん仕上げた成果.この結果は特許の取得にもつながっている.(勝間)
Sugano Y, Kokusho R, Ueda M, Fujimoto M, Tsutsumi N, Shimada T, Kiuchi T, Katsuma S*. Identification of a bipartite nuclear localization signal in the silkworm Masc protein. FEBS Lett. 2016: 590(14), 2256–2261. DOI: 10.1002/1873-3468.12246
Katsuma* et al., J Biol Chem, 2015 の続き.培養細胞を用いて,Mascタンパク質の核移行シグナルを同定し,核移行の程度とオス化能力の関係を調査したもの.植物分子遺伝学研究室とのコラボレーションにより,非常に美しい共焦点画像を取得することができた(ありがとうございます).菅野くんの第一弾論文.彼は専攻長賞を授与され,とある製薬会社に就職した.(勝間)
Innami K, Aizawa T, Tsukui T, Katsuma S, Imanishi S, Kawasaki H, Iwanaga M*. Infection studies of nontarget mammalian cell lines with Bombyx mori macula-like virus. J Virol Methods. 2016: 229, 24–26. DOI: 10.1016/j.jviromet.2015.12.002
Ito K*, Shimura S, Katsuma S, Tsuda Y, Kobayashi J, Tabunoki H, Yokoyama T, Shimada T, Kadono-Okuda K. Gene expression and localization analysis of Bombyx mori bidensovirus and its putative receptor in B. mori midgut. J Invertebr Pathol. 2016: 136, 50-6. DOI: 10.1016/j.jip.2016.03.005
Sakai H, Kirino Y, Katsuma S, Aoki F, Suzuki MG*. Morphological and histomorphological structures of testes and ovaries in early developmental stages of the silkworm, Bombyx mori. J Insect Biotechnol Sericology. 2016: 85, 15–20. DOI: 10.11416/jibs.85.1_015
Izumi N, Shoji K, Sakaguchi Y, Honda S, Kirino Y, Suzuki T, Katsuma S, Tomari Y*. Identification and Functional Analysis of the Pre-piRNA 3' Trimmer in Silkworms. Cell. 2016: 164(5), 962-73. DOI: 10.1016/j.cell.2016.01.008
Kawaoka et al., Mol Cell, 2011の論文から約5年,泊研の泉さんがついにトリマーの分子実体を生化学的手法で明らかにした論文.本当にすごい仕事です.piRNAの3'トリミングに関わる酵素が生物種間(昆虫間でも)異なることが示唆されました.庄司くんがpiRNAのインフォ解析で貢献しました.(勝間)
Ito K*, Katsuma S, Kuwazaki S, Jouraku A, Fujimoto T, Sahara K, Yasukochi Y, Yamamoto K, Tabunoki H, Yokoyama T, Kadono-Okuda K, Shimada T. Mapping and recombination analysis of two moth colour mutations, Black moth and Wild wing spot, in the silkworm Bombyx mori. Heredity. 2016: 116, 52–59. DOI: 10.1038/hdy.2015.69
Yuasa M, Kiuchi T, Banno Y, Katsuma S, Shimada T*. Identification of the silkworm quail gene reveals a crucial role of a receptor guanylyl cyclase in larval pigmentation. Insect Biochem Mol Biol 2016: 68, 33-40. DOI: 10.1016/j.ibmb.2015.10.016
Uchiyama K, Fujimoto H, Katsuma S, Imanishi S, Kato A, Kawasaki H, Iwanaga M*. Inactivation of Bombyx mori macula-like virus under physical conditions. In Vitro Cell Dev Biol Anim. 2016: 52(3), 265-70. Epub 2015 Nov 5. DOI: 10.1007/s11626-015-9972-1
Katsuma S*. Phosphatase activity of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus PTP is dispensable for enhanced locomotory activity in B. mori larvae. J Invertebr Pathol. 2015: 132, 228–232. DOI: 10.1016/j.jip.2015.11.002
PTP論文第二弾.(Katsuma* et al., PLoS Pathog, 2012)の論文で,PTP活性と行動制御の間には関連性がないと報告していたが,モニーク博士のグループはAcMNPV感染個体では,PTPのフォスファターゼ活性が必須であると発表した(PLoS One, 2012).この二つの研究では,作成したウイルスの構造や変異の入れ方が異なっていたため,できるだけモニーク博士の研究と条件を合わせるべく幾つかの変異BmNPVを追加で作成した.それらのウイルスを用いた性状解析,行動実験の結果,(Katsuma* et al., PLoS Pathog, 2012)の論文の結果をサポートする結果が得られた.以上のことから,BmNPVとAcMNPVは非常に近縁なウイルスであるにもかかわらず,PTP依存的な行動制御のメカニズムが全く異なるものであることが明らかになった.このデータをどこで発表すべきか悩んだが,最終的にはJIP誌に掲載されることになった.初の単著論文である.(勝間)
Katsuma S*, Sugano Y, Kiuchi T, Shimada T. Two Conserved Cysteine Residues Are Required for the Masculinizing Activity of the Silkworm Masc Protein. J Biol Chem. 2015: 290(43), 26114–26124. DOI: 10.1074/jbc.M115.685362
カイコオス化因子Mascのオス化に関わる領域,及びアミノ酸残基を特定した論文.(12), (15), (16)の論文でMasc cDNAをカイコ卵巣由来BmN-4細胞に導入するとBmdsxのオス型スプライシングとオス型BmIMPの発現が観察されたことから,この実験系を利用してMascタンパク質のオス化に関わる領域を絞り込んだ.その結果,チョウ目昆虫のMasc間で保存されていた二つのシステイン残基がオス化に必須であることが示された.培養細胞系では遺伝子量補償の検証が難しいため,今後は遺伝子量補償に関与する領域を同定するための実験系を構築する必要がある.論文はテーブルをサプリに回すだけのノーリバイズでアクセプトになった.(勝間)
Shoji K, Katsuma S*. Is the expression of sense and antisense transgenes really sufficient for artificial piRNA production? Current Biol. 2015: 25(16), R708-10. DOI: 10.1016/j.cub.2015.07.001
人工的にpiRNAを産生させるために必要な条件は何か,についてCorrespondenceとしてCurrent Biology誌に発表した.ゲノム上のpiRNAクラスタにトランスジーンが挿入されることがpiRNA産生に必要であると考えているが,蚊のアルボウイルスに感染した一部の細胞や後述するカイコマキュラウイルスでは,ウイルス抑制にpiRNA経路が関与していることも報告されており,まだ結論は出ていないと言える.(勝間)
Lee J, Kiuchi T, Kawamoto M, Shimada T, Katsuma S*. Identification and functional analysis of a Masculinizer orthologue in Trilocha varians (Lepidoptera: Bombycidae). Insect Mol Biol. 2015: 24(5), 561-9. DOI: 10.1111/imb.12181
李くんの第一弾論文.カイコの近縁種であるイチジクカサンのMasc遺伝子をクローニンングし,その機能解析を行った報告である.カイコ培養細胞BmN-4における発現,及び胚子におけるRNAiの結果,この種のMascもオス化に関与していることを明らかにした.(勝間)
Fukui T†, Kawamoto M†, Shoji K†, Kiuchi T†, Sugano S, Shimada T, Suzuki Y, Katsuma S*. The Endosymbiotic Bacterium Wolbachia Selectively Kills Male Hosts by Targeting the Masculinizing Gene. PLoS Pathog. 2015: 11(7), e1005048. DOI: 10.1371/journal.ppat.1005048 農学生命科学研究科プレスリリース
Nature論文のMasc KD実験で明らかになった「Mascの発現低下でオス殺しが起きる」という人工的な現象が自然界でも起きているのかを検証した研究.グループ総出で虫取りに行き,福井くんが実験し,川本さん,庄司くんがインフォ解析し,木内くんがインジェクションを行った.ボルバキア感染アワノメイガにおける「オス殺し」がMascの発現量低下による遺伝子量補正の破綻によるものであることを証明できた論文である.PLoS Pathogens誌には最初リジェクトされたが,コメントで書かれた実験を全て行い再投稿することで,エディターレベルでアクセプトに至った.次のゴールはボルバキアの持つ「Masc制御因子」を同定することであり,新学術領域「性スペクトラム」で研究を継続している.(勝間)
Li JJ, Cao C, Fixsen SM, Young JM, Ono C, Bando H, Elde NC, Katsuma S*, Dever TE*, Sicheri F*. Baculovirus protein PK2 subverts eIF2α kinase function by mimicry of its kinase domain C-lobe. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015: 112(32), E4364-73. DOI: 10.1073/pnas.1505481112 農学生命科学研究科プレスリリース
トロント大のSicheri博士,NIHのDever博士,北大の伴戸教授との6年にも及ぶ共同研究の結果を論文化したもの.バキュロウイルスが持つPK2と呼ばれるキナーゼホモログが,宿主のHRIと呼ばれるeIF2αキナーゼと結合することで,宿主の翻訳抑制を解除し,ウイルス増殖を正に制御していることを明らかにし,PNAS誌に報告した.トロント大のグループが生化学的解析,NIHのグループが酵母を用いた遺伝学,私がバックミドを用いた欠損ウイルスの性状解析と宿主のターゲット分子の同定を行った.(勝間)
Wang H, Kiuchi T, Katsuma S, Shimada T*. A novel sucrose hydrolase from the bombycoid silkworms Bombyx mori, Trilocha varians, and Samia cynthia ricini with a substrate specificity for sucrose. Insect Biochem Mol Biol. 2015: 61, 46-52. DOI: 10.1016/j.ibmb.2015.04.005
Kokusho R, Kawamoto M, Koyano Y, Sugano S, Suzuki Y, Shimada T, Katsuma S*. Bombyx mori nucleopolyhedrovirus ARIF-1 enhances systemic infection in B. mori larvae. J Gen Virol. 2015: 96(Pt 7), 1938-1946. DOI: 10.1099/vir.0.000130
國生くんの第二弾論文.修論の時に取り組んでいた行動変異体の原因遺伝子が,紆余曲折を経て,arif-1と呼ばれるアクチン骨格のリアレンジに関与すると報告されている遺伝子の変異であることを見出したもの.別目的で行っていたウイルス感染カイコ脳のRNA-seqデータが変異箇所の同定に非常に役立った.最初は行動変異体として論文投稿したが,レフリーからはその方向性をみとめてもらえなかったため,カイコ幼虫個体における感染の広がりが抑制されている変異体として報告することになった.BmNPVの脳への感染を初めて可視化した論文である.現在,新たな知見を得ており,鋭意論文作成中である(國生追記:ARIF-1の作用機序を解明した論文はKokusho & Katsuma, Commun Biol, 2025としてpublishされました).(勝間)
Kawamoto M, Koga H, Kiuchi T, Shoji K, Sugano S, Shimada T, Suzuki Y, Katsuma S*. Sexually biased transcripts at early embryonic stages of the silkworm depend on the sex chromosome constitution. Gene. 2015: 560, 50–56. DOI: 10.1016/j.gene.2015.01.036
川本さんの1st論文.Nature論文ではスペースの関係で入れることができなかった,カイコ胚子期で発現に雌雄差がある遺伝子のリスト化論文.初期胚においてメスで発現が高い遺伝子の多くはW染色体から転写されるpiRNA前駆体であり,オスで発現の高い遺伝子の多くはZ染色体上の遺伝子であることが明らかになった.また,遺伝子量補正は産下後72時間でほぼ確立するが、幾つかの遺伝子では遺伝子量補正を免れたり,徐々に補正されることが明らかになった.論文の大部分は川本さんが仕上げ,qPCRによるバリデーションを古賀くんが行った.(勝間)
Ishihara G, Kokusho R, Shimada T, Katsuma S*. Functional analysis of antisense long non-coding RNAs transcribed from the Bombyx mori (Lepidoptera: Bombycidae) nucleopolyhedrovirus genome. Appl Entomol Zool. 2015: 50, 155–167. DOI: 10.1007/s13355-014-0317-4
石原くんの2nd論文であり,博士論文の主内容である.長鎖非コードRNAのプロモーターに変異を導入することで,長鎖非コードRNAが発現しないように改良したウイルスを網羅的に作成し,その表現型を記載した報告である.この研究によって,BmNPVゲノムから発現している長鎖非コードRNAの大部分はウイルス遺伝子の発現には大きな影響を与えないことが判明した.(勝間)
Katsuma S*, Shimada T. The killing speed of egt-inactivated Bombyx mori nucleopolyhedrovirus depends on the developmental stage of B. mori larvae. J Invertebr Pathol. 2015: 126, 64-70. DOI: 10.1016/j.jip.2015.01.012
様々なバキュロウイルスにおいて,egt欠損ウイルスは宿主昆虫の早期致死をもたらすことが知られていた.その原因はマルピーギ管の機能不全によるものであるとされてきたが,エクジソン濃度が低い時期にも同じ表現型が現れることから,エクジソン濃度と早期致死との関係に疑問を持っていた.さらに,(Katsuma* et al., J Virol, 2012)の論文から,egt欠損ウイルスによる早期致死の原因の一部は,Bm8の発現異常によるものであることが判明していた.そこで,4齢から5齢にかけて10ステージのカイコ幼虫を使用し,egt欠損と早期致死との関係を詳細に調査した.その結果,Bm8の発現異常をともなわないegt欠損ウイルスは,その感染ステージによって,正常ウイルスと比較して,早期致死,致死遅延,変化なし,及びそれらの複合型という3タイプ+αの表現型を示した.特に早期致死を示すのは,脱皮直前にウイルス感染した場合に限定されることが判明した.(勝間)
Katsuma S*, Bando H, Shimada T. Deletion analysis of a superoxide dismutase gene of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus. Appl Entomol Zool. 2015: 50, 57-62. DOI: 10.1007/s13355-014-0304-9
宿主ホモログの一つであるsod遺伝子の機能解析.iap2と同じようにsodも相同組換えで欠損ウイルスが作成できなかったことから,北大の伴戸先生との共同研究でバックミドを用いた解析を行った.その結果,培養細胞では正常株と異なる表現型を示さなかったが,カイコ幼虫において出芽ウイルス,及び多角体の産生量が低下することが明らかになった.iap2の例も考慮すると,必須遺伝子ではないのに相同組換えで単離できない遺伝子がいくつも存在することがわかった(理由は不明).(勝間)
Ito H, Bando H, Shimada T, Katsuma S*. The BIR and BIR-like domains of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus IAP2 protein are required for efficient viral propagation. Biochem Biophys Res Commun. 2014: 454(4), 581-587. DOI: 10.1016/j.bbrc.2014.10.132
三人目の女性バキュラーである伊藤さんの修論の内容を論文化したもの.IAPはアポトーシス抑制能があることが知られているが,BmNPVに存在するIAP1, IAP2はアポトーシスには関与しない.iap1の欠損ウイルスの性状は論文(Katsuma* et al., Insect Biochem Mol Biol, 2008)で報告しているが,iap2は相同組換えで欠損ウイルスが作成できなかったことから,北大の伴戸先生との共同研究でバックミドを用いた解析を行った.その結果,BmNPVの増殖に関与する遺伝子であることが判明した.(勝間)
Rong Y, Fujii T*, Katsuma S, Yamamoto M, Ando T, Ishikawa Y. CYP341B14: A cytochrome P450 involved in the specific epoxidation of pheromone precursors in the fall webworm Hyphantria cunea. Insect Biochem Mol Biol. 2014: 54, 122-128. DOI: 10.1016/j.ibmb.2014.09.009
Iwanaga M*, Tsukui K, Uchiyama K, Katsuma S, Imanishi S, and Kawasaki H. Expression of recombinant proteins by BEVS in a macula-like virus-free silkworm cell line. J Invertebr Pathol. 2014: 123, 34-37. DOI: 10.1016/j.jip.2014.09.004
Shoji K, Hara K, Kawamoto M, Kiuchi T, Kawaoka S, Sugano S, Shimada T, Suzuki Y, Katsuma S*. Silkworm HP1a transcriptionally enhances highly expressed euchromatic genes via association with their transcription start sites. Nucleic Acids Res. 2014: 42(18):11462-11471. DOI: 10.1093/nar/gku862 農学生命科学研究科プレスリリース
庄司くんの第二弾論文で修論の一部である.原さんが残してくれたHP1aのChIP-seqデータを利用して,カイコのHP1aが発現量の高い遺伝子の転写を亢進する役割があることを示した.インフォ解析をフルに行い,RNAiなどの機能解析も行った重厚な内容になっている.リバイズではBmN-4以外のカイコ細胞においても同じ現象が観察されるか検証しなければならないなど結構大変だったが,庄司くんが踏ん張ってくれ,NAR誌での掲載に至った.(勝間)
Iwanaga M*, Adachi Y, Uchiyama K, Tsukui K, Katsuma S, Kawasaki H. Long-term adaptation of the Bombyx mori BmN4 cell line to grow in serum-free culture. In Vitro Cell Dev Biol Anim. 2014: 50(9), 792-796. DOI: 10.1007/s11626-014-9781-y
Kiuchi T, Koga H†, Kawamoto M†, Shoji K†, Sakai H, Arai Y, Ishihara G, Kawaoka S, Sugano S, Shimada T, Suzuki Y, Suzuki MG, Katsuma S*. A single female-specific piRNA is the primary determiner of sex in the silkworm. Nature. 2014: 509, 633-636. DOI: 10.1038/nature13315 農学生命科学研究科プレスリリース, Natureダイジェスト記事, ライフサイエンス 新着論文レビュー
カイコ雌性決定遺伝子がW染色体から産生される一種類のpiRNAであることを証明した論文.内容は下記のプレスリリースをはじめいろいろなところで書いているので,そちらを参照されたい.RNA-seqの解析結果をメーリスで流したとき,それを見たみんなが「これだ!」とFemの本体を見つけたのが2013年2月ごろ.その時点から論文の構成を考え始め,Fem piRNAのターゲットMascの同定,RNAiによるMascの機能解析等を並行して行い,8月終わりにほぼ投稿原稿を作り上げた.2013年10月2日にNature誌に投稿し,エディターキックを逃れた時に一安心し,4人のレフリーからの審査結果がマイナーリビジョンだった時にはガッツポーズが出たが,1stリバイズの結果がメジャーリビジョンに変わった時から地獄が始まった.最終的には,木内くんをはじめグループみんなの不眠不休の努力で,4thリビジョンの段階で2014年の4月8日の夕方にアクセプトメールが届いた.遺伝子量補償に関しては別論文にして詳細に報告する予定だったので,リバイズ時に組み込まなければいけなかった点は非常に残念だった.Nature誌で発表された後は海外のメデイアからも高い評価を受け,その号のHot Topics(最もホットな話題)にも選ばれた.現在,この研究は多くの発展的テーマとして鋭意継続されている.2020年5月時点ですでに260回以上引用されています.(勝間)
Iwanaga M*, Shibano Y, Ohsawa T, Fujita T, Katsuma S, Kawasaki H. Involvement of HSC70-4 and other inducible HSPs in Bombyx mori nucleopolyhedrovirus infection. Virus Res. 2014: 179, 113-118. DOI: 10.1016/j.virusres.2013.10.028
Uemura N, Tabunoki H*, Suzuki T, Ishikawa K, Nojima Y, Katsuma S, Sato R, Satoh JI. Production of wild-type and mutant-type human DAP12 proteins by Bombyx mori nucleopolyhedrovirus vector. Biosci Biotechnol Biochem. 2014: 78(1), 71-74. DOI: 10.1080/09168451.2014.877824
Bisch-Knaden S*, Daimon T, Shimada T, Hansson BS, Sachse S. Anatomical and functional analysis of domestication effects on the olfactory system of the silkmoth Bombyx mori. Proc Biol Sci. 2013: 281(1774), 20132582. DOI: 10.1098/rspb.2013.2582
Fujii T*, Suzuki MG, Katsuma S, Ito K, Rong Y, Matsumoto S, Ando T, Ishikawa Y. Discovery of a disused desaturase gene from the pheromone gland of the moth Ascotis selenaria, which secretes an epoxyalkenyl sex pheromone. Biochem Biophys Res Commun. 2013: 441(4), 849-55. DOI:10.1016/j.bbrc.2013.10.143
Suetsugu Y, Futahashi R, Kanamori H, Kadono-Okuda K, Sasanuma SI, Narukawa J, Ajimura M, Jouraku A, Namiki N, Shimomura M, Sezutsu H, Osanai-Futahashi M, Suzuki MG, Daimon T, Shinoda T, Taniai K, Asaoka K, Niwa R, Kawaoka S, Katsuma S, Tamura T, Noda H, Kasahara M, Sugano S, Suzuki Y, Fujiwara H, Kataoka H, Arunkumar KP,* Tomar A, Nagaraju J, Goldsmith MR*, Feng Q, Xia Q, Yamamoto K, Shimada T, Mita K*. Large scale full-length cDNA sequencing reveals a unique genomic landscape in a lepidopteran model insect, Bombyx mori. G3 (Bethesda). 2013: 3, 1481-1492. DOI: 10.1534/g3.113.006239
Shoji K, Kiuchi T, Hara K, Kawamoto M, Kawaoka S, Arimura S, Tsutsumi N, Sugano S, Suzuki Y, Shimada T, Katsuma S*. Characterization of a novel chromodomain-containing gene from the silkworm, Bombyx mori. Gene. 2013: 527 (2), 649-654. DOI: 10.1016/j.gene.2013.06.071
庄司くんの第一弾論文.カイコのHP1遺伝子を探索する過程で見つけたクロモドメインのみを持つ新規遺伝子のクローニングと性状解析の報告.ChIP-seqでゲノム上の結合領域を特定し,その近傍の遺伝子発現がBmN-4やカイコ胚子でのRNAiで変化するかを調べたが,特に何も起こらなかった.未だにこの遺伝子の機能は不明である.(勝間)
Izumi N†, Kawaoka S†, Yasuhara S, Suzuki Y, Sugano S, Katsuma S*, Tomari Y*. Hsp90 facilitates accurate loading of precursor piRNAs into PIWI proteins. RNA. 2013: 19, 896-901. DOI: 10.1261/rna.037200.112
Kawaoka et al., Mol Cell, 2011の論文で確立したin vitro piRNA実験系とpiRNAのインフォ解析を合わせて,分子シャペロンであるHSP90がpiRNA前駆体の loadingに関わることを示した論文.泊研の泉さん,河岡くん,安原くんの共同研究の成果である.(勝間)
Bono F†, De Smet F†, Herbert C, De Bock K, Georgiadou M, Fons P, Tjwa M, Alcouffe C, Ny A, Bianciotto M, Jonckx B, Murakami M, Lanahan A, Michielsen C, Sibrac D, Dol-Gleizes F, Mazzone M, Zacchigna S, Herault JP, Fischer C, Rigon P, Ruiz de Almodovar C, Claes F, Blanc I, Poesen K, Zhang J, Segura I, Gueguen G, Bordes MF, Lambrechts D, Broussy R, van de Wouwer M, Michaux C, Shimada T, Jean I, Blacher S, Noel A, Motte P, Rom E, Rakic JM, Katsuma S, Schaeffer P, Yayon A, Schepdael VA, Schwalbe H, Gervasio F, Carmeliet G, Rozensky J, Dewerchin M, Simons M, Christopoulos A, Herbert JM†, Carmeliet P*†. Inhibition of tumor angiogenesis and growth by a small-molecule multi-FGF receptor blocker with allosteric properties. Cancer Cell. 2013: 23, 477-488. DOI: 10.1016/j.ccr.2013.02.019
Wang L, Kiuchi T, Fujii T, Daimon T, Li M, Banno Y, Kikuta S, Kikawada T, Katsuma S, Shimada T*. Mutation of a novel ABC transporter gene is responsible for the failure to incorporate uric acid in the epidermis of ok mutants of the silkworm, Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2013: 43 (7) 562-571. DOI: 10.1016/j.ibmb.2013.03.011
Lin Y†, Meng Y†, Wang YX†, Luo J, Katsuma S, Yang CW, Banno Y, Kusakabe T, Shimada T*, Xia QY*. Vitellogenin receptor mutation leads to the oogenesis mutant phenotype 'scanty vitellin' of the silkworm, Bombyx mori. J Biol Chem. 2013: 288, 13345-13355. DOI: 10.1074/jbc.M113.462556
Fujii T*, Abe H, Kawamoto M, Katsuma S, Banno Y, Shimada T*. Albino (al) is a tetrahydrobiopterin (BH4)-deficient mutant of the silkworm Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2013: 43(7), 594-600. DOI: 10.1016/j.ibmb.2013.03.009
Ishihara G, Shimada T, Katsuma S*. Functional characterization of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus CG30 protein. Virus Res. 2013: 174, 52–59. DOI: 10.1016/j.virusres.2013.02.014
宇都宮大学から博士課程に入ってきた石原くんの1st論文である.非コードRNAに関する研究の過程で作成したcg30変異株に関してその結果をまとめたもの.投稿直前に上述の浙江大学Zhang教授のグループから同じ遺伝子に関する論文が発表されてしまったため,いろいろ苦労したが,ドメイン変異株の解析を加えることでなんとか掲載されるに至った.石原くんの博士論文の一部になった.(勝間)
Tsuchida A, Ishihara G, Shimada T, Katsuma S*. Dimerization and proper degradation of Bombyx mori nucleopolyhedorivirus IE2 are required for efficient virus growth in B. mori larvae. Appl Entomol Zool. 2013: 48, 125–130. DOI: 10.1007/s13355-012-0159-x
二人目の女性バキュラーである土田さんの修論の内容を論文化したもの.バキュロウイルスのE3ユビキチンリガーゼの一つであるIE2に変異を導入したウイルスを作成し,それらの培養細胞,及びカイコ幼虫における性状を調査した研究である.培養細胞ではウイルス増殖に差がないが,カイコ幼虫では少し増殖が低下するという内容である.(勝間)
Ito K*, Kidokoro K, Shimura S, Katsuma S, Kadono-Okuda K*. Detailed investigation of the sequential pathological changes in silkworm larvae infected with Bombyx densovirus type 1. J Invertebr Pathol. 2013: 112, 213-218. DOI: 10.1016/j.jip.2012.12.005
Wang L, Kiuchi T, Fujii T, Daimon T, Li M, Banno Y, Katsuma S, Shimada T*. Reduced expression of the dysbindin-like gene in the Bombyx mori ov mutant exhibiting mottled translucency of the larval skin. Genome. 2013: 56, 101-108. DOI: 10.1139/gen-2012-0127
Kawaoka S*†, Hara K†, Shoji K, Kobayashi M, Shimada T, Sugano S, Tomari Y, Suzuki Y, Katsuma S. The comprehensive epigenome map of piRNA clusters. Nucleic Acids Res. 2013: 41, 1581-1590. DOI: 10.1093/nar/gks1275 農学生命科学研究科プレスリリース
原さん2nd論文かつ河岡くんのコレス2作目で,取りまとめはほとんど河岡くんがやってくれた.原さんのChIP-seqと庄司くんのqPCR,鈴木先生のインフォや統計処理指導も強力でした.BmN-4細胞における各種ヒストン修飾と遺伝子の転写開始点,piRNAクラスタに関するマップを作成した論文で,のちのHP1a論文に大いに活かされるデータベースが構築できた.(勝間)
Hori T, Kiuchi T, Shimada T, Nagata M, Katsuma S*. Silkworm plasmatocytes are more resistant than other hemocyte morphotypes to Bombyx mori nucleopolyhedrovirus infection. J Invertebr Pathol. 2013: 112, 102-104. DOI: 10.1016/j.jip.2012.09.004
新領域研究科の堀くん(永田研究室)が昆虫遺伝研に出向して作出したGFPレポーターウイルスを使って,カイコの血球間におけるウイルス感染性の差異を調査した論文である.木内くんに最後の写真データ取得を行ってもらった.プラズマ細胞のウイルス感染性が他の血球種よりも低いことを示した.伝統的な昆虫病理学の雑誌であるJIP誌に初めて投稿した(この後,気に入ったのでよく投稿するようになった).(勝間)
Katsuma S*, Shimada T. Comparative studies of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus infection in BmN4 cell lines maintained in different laboratories. J Insect Biotechnol Sericology. 2012: 81, 7-12. DOI: 10.11416/jibs.81.1_007
由来が同じ培養細胞でも長期間異なる研究室で継代されていると,その性状が異なってくることが知られている.この研究では,東京大学,九州大学,山口大学で継代されているカイコ卵巣由来培養細胞BmN-4について,特にウイルス感染性に関してその差異を報告した.いろいろな実験で適したBmN-4が存在することを研究者仲間に伝えたかったというのがこの論文を作った真意である.(勝間)
Fujii T*, Banno Y, Abe H, Katsuma S, Shimada T*. A homolog of the human Hermansky-Pudluck Syndrome-5 (HPS5) gene is responsible for the oa larval translucent mutants in the silkworm, Bombyx mori. Genetica. 2012: 140, 463-468. DOI: 10.1007/s10709-012-9694-1
Daimon T*, Fujii T, Fujii T, Yokoyama T, Katsuma S, Shinoda T, Shimada T, Ishikawa Y. Reinvestigation of the sex pheromone of the wild silkmoth, Bombyx mandarina: The effects of bombykal and bombykyl acetate. J Chem Ecol. 2012: 38, 1031-1035. DOI: 10.1007/s10886-012-0164-0
Ito K*, Kidokoro K, Katsuma S, Shimada T, Yamamoto K, Mita K, Kadono-Okuda K*. Positional cloning of a gene responsible for the cts mutation of the silkworm, Bombyx mori. Genome. 2012: 55, 493-504. DOI: 10.1139/g2012-033
Katsuma S*, Koyano Y, Kang W-K, Kokusho R, Kamita SG, Shimada T. The baculovirus uses a captured host phosphatase to induce enhanced locomotory activity in host caterpillars. PLoS Pathog. 2012: 8, e1002644. DOI: 10.1371/journal.ppat.1002644 農学生命科学研究科プレスリリース
東大に着任以来取り組んできたバキュロウイルスPTPと行動制御に関する研究.幾多の困難を乗り越え7年越しに結実した研究.BmNPV感染カイコにおいては,PTPは酵素としてではなく構造タンパク質として機能し,脳への効率的感染に関わることで行動制御を司ることを明らかにした.研究の経緯は「昆虫科学読本-虫の目で見た驚きの世界」に詳述したので割愛するが,初代女性バキュラー小谷野さん,理研の姜さん,UCデービスのKamita博士の協力でPLoS Pathogens誌に掲載された.バキュロウイルスの論文としては初めてこの雑誌に掲載されたように思う.この後,AcMNPVにおいては異なるメカニズムでPTPが行動制御に関与するという論文がオランダのモニーク博士のグループから発表された.いくつもの検証実験の結果,現時点ではBmNPVとAcMNPVではメカニズムが異なると考えている.この研究結果は,日経産業新聞,日経新聞の日曜版と英語版などに掲載されるとともに,上記の通りプレスリリースした.(勝間)
Daimon T, Kozaki T, Niwa R, Kobayashi I, Furuta K, Namiki T, Uchino K, Banno Y, Katsuma S, Tamura T, Mita K, Sezutsu H, Nakayama M, Itoyama K, Shimada T, Shinoda T*. Precocious metamorphosis in the juvenile hormone-deficient mutant of the silkworm, Bombyx mori. PLoS Genet. 2012: 8, e1002486. DOI: 10.1371/journal.pgen.1002486
Hara K, Fujii T, Suzuki Y, Sugano S, Shimada T, Katsuma S*, Kawaoka S*. Altered expression of testis-specific genes, piRNAs, and transposons in the silkworm ovary masculinized by a W chromosome mutation. BMC Genomics. 2012: 13, 119. DOI: 10.1186/1471-2164-13-119
修士から他研究室より移籍してきた原さんの1st論文. W染色体に変異を持つカイコ間性系統のpiRNAや遺伝子発現を調査した論文.河岡くんにコレスになってもらった初めての論文でもある.この論文で作成したpiRNAライブラリーはのちのFem piRNA論文でいい働きをすることになる.(勝間)
Kang W-K, Katsuma S*, Matsuda-Imai N, Kurihara M, Yoshiga T, Shimada T, Matsumoto S. Identification and characterization of host factors interacting with Bombyx mori nucleopolyhedrovirus ORF8. J Microbiol. 2012: 50, 469-477. DOI: 10.1007/s12275-012-2010-z
Daimon T*†, Fujii T†, Yago M, Hsu Y-F, Nakajima Y, Fujii T, Katsuma S, Ishikawa Y, Shimada T. Female sex pheromone and male behavioral responses of the bombycid moth Trilocha varians: comparison with those of the domesticated silkmoth Bombyx mori. Naturwissenschaften. 2012: 99, 207-215. DOI: 10.1007/s00114-012-0887-3
Katsuma S*, Kobayashi J*, Koyano Y, Matsuda-Imai N, Kang W-K, Shimada T. Baculovirus-encoded protein BV/ODV-E26 determines tissue tropism and virulence in lepidopteran insects. J Virol. 2012: 86, 2545-2555. DOI: 10.1128/JVI.06308-11
山口大の小林淳教授との共同研究.昔からエクジソン不活化酵素遺伝子(egt)欠損ウイルス感染カイコで見られていた絹糸腺での多角体の異常産生が,egt自身ではなくその隣の遺伝子であるBm8 (bv/odv-e26)の発現異常によるものであることを明らかにした.この論文はバキュロウイルス感染における組織トロピズムを定量的に解析した初めての報告であるとともに,それに関与するバキュロウイルス遺伝子を発見した最初の報告である.また,egt欠損ウイルスにおけるカイコの早期致死もBm8の異常によるものであることを証明した点で,これまでの通説を覆す大きな成果であると考えている.(勝間)
Iwanaga M*, Hitotsuyama T, Katsuma S, Ishihara G, Daimon T, Shimada T, Imanishi S, Kawasaki H. Infection study of Bombyx mori macula-like virus (BmMLV) using a BmMLV-negative cell line and an infectious cDNA clone. J Virol Methods. 2012: 179, 316-324. DOI: 10.1016/j.jviromet.2011.11.016
Kawaoka S†, Mitsutake H†, Kiuchi T, Kobayashi M, Yoshikawa M, Suzuki Y, Sugano S, Shimada T, Kobayashi J*, Tomari Y*, Katsuma S*. A role for transcription from a piRNA cluster in de novo piRNA production. RNA. 2012: 18, 265-273. DOI: 10.1261/rna.029777.111
バキュロウイルスの研究でもお世話になっている山口大の小林淳教授のグループが作成したGFPレポーター導入BmN-4細胞を用いて,外来遺伝子がpiRNAによる制御を受ける仕組みにアプローチした研究.ハエとマウスで類似研究を行っていたグループとコサブミットすることになったが,結果的にこのジャーナルに落ち着いた.レポーターカセットがpiRNAクラスタにアンチセンス方向で挿入されることが, piRNA経路に認識されるために重要であることが示唆されたが,後述のように未だに議論の余地があるテーマである.(勝間)
Daimon T*, Yago M, Hsu YF, Fujii T, Nakajima Y, Kokusho R, Abe H, Katsuma S, Shimada T*. Molecular Phylogeny, Laboratory Rearing, and Karyotype of the Bombycid Moth, Trilocha varians. J Insect Sci. 2012: 12, 49. DOI: 10.1673/031.012.4901
Fujii T, Fujii T, Namiki S, Abe H, Sakurai T, Ohnuma A, Kanzaki R, Katsuma S, Ishikawa Y, Shimada T*. Sex-linked transcription factor involved in a shift of sex-pheromone preference in the silkmoth Bombyx mori. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011: 108(44), 18038-18043. DOI: 10.1073/pnas.1107282108
Kokusho R, Zhang CX, Shimada T, Katsuma S*. Comparative analysis of budded virus infectivity of Bombyx mandarina and B. mori nucleopolyhedroviruses. Virus Genes. 2011: 43(2), 313-317. DOI: 10.1007/s11262-011-0623-7
現在,金沢大学の博士研究員である國生くんの第一弾論文.浙江大学のZhang教授からクワコNPV (BomaNPV)をいただき,その病原性をBmNPV(カイコNPV)と比較した報告.BomaNPVはBmNPVよりカイコに対する病原性が強いことが判明した.この論文が現在ルーチンで行っているバキュロウイルス感染カイコの行動実験の最初の報告となった.(勝間)
Kawaoka S†, Kadota K†, Arai Y, Suzuki Y, Fujii T, Abe H, Yasukochi Y, Mita K, Sugano S, Shimizu K, Tomari Y, Shimada T, Katsuma S*. The silkworm W chromosome is a source of female-enriched piRNAs. RNA. 2011: 17(12), 2144-2151. DOI: 10.1261/rna.027565.111
W染色体上の雌性決定領域から産生されるpiRNAの発見を報告した論文.カイコのW染色体変異体やpiRNAのSNPs(一塩基多型)を利用して,メスで多い,あるいはメス特異的に存在するpiRNAを同定した.最初のバージョンでは,これらのpiRNAが性決定・性分化と関連している可能性を強く記載したため,piRNAの機能解析を求められ,ハイランクジャーナルからはことごとくリジェクトされた.しかし,この路線での研究はやがて単一のpiRNAが性を決定するという大きな発見につながったものであり,極めて重要な論文であると位置付けている.自分の研究生活の中でも苦労した論文の一つであり,最終的にRNA誌に掲載まで持ち込んだ河岡くんの努力には敬意を表したい.(勝間)
Fujii T*, Abe H, Yamamoto K, Katsuma S, Shimada T. Interspecies linkage analysis of mo, a Bombyx mori locus associated with mosaicism and gynandromorphism. Genetica. 2011: 139(10), 1323–1329. DOI: 10.1007/s10709-012-9634-0
Kiuchi T, Banno Y, Katsuma S, Shimada T*. Mutations in an amino acid transporter gene are responsible for sex-linked translucent larval skin of the silkworm, Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2011: 41(9), 680-687. DOI: 10.1016/j.ibmb.2011.04.011
Kawaoka S, Izumi N, Katsuma S*, Tomari Y*. 3' End Formation of PIWI-Interacting RNAs In Vitro. Mol Cell. 2011: 43(6), 1015-1022. DOI: 10.1016/j.molcel.2011.07.029 農学生命科学研究科プレスリリース
Kawaoka et al., RNA, 2009の論文のリバイズの時から,河岡くんが分生研の泊先生のところで生化学実験の修行を行った結果生まれた大きな成果であり,2020年5月末ですでに220件以上の引用がある.BmN-4ライセートを用いて,試験管内でpiRNAを産生するシステムを構築することに成功し,piRNAの3'末端を決定するヌクレアーゼ“トリマー”の存在を示唆した.この実験系は後の幾つかの大きな論文につながることになる.(勝間)
Kawaoka S, Arai Y, Kadota K, Suzuki Y, Hara K, Sugano S, Shimizu K, Tomari Y, Shimada T, Katsuma S*. Zygotic amplification of secondary piRNAs during silkworm embryogenesis. RNA. 2011: 17(7), 1401-1407. DOI: 10.1261/rna.2709411
カイコの胚子piRNAを発生段階別にクローニングして,その配列を解析することで,トランスポゾンに対するpiRNAが産生される様子をモニタリングすることに成功した.修士から加入した新井くんが参加した論文である.投稿がちょうど震災の頃で非常に落ち着かない時期だった気がするが,審査結果が前のBmN-4論文と比較して非常に良かったのでホッとした覚えがある.この頃からインフォ解析を極めるために,河岡くんがアグリインフォの門田先生のところに入門した.(勝間)
Fujii T, Abe H, Katsuma S, Shimada T*. Identification and characterization of the fusion transcript, composed of the apterous homolog and a putative protein phosphatase gene, generated by 1.5-Mb interstitial deletion in the vestigial (Vg) mutant of Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2011: 41(5), 306-312. DOI: 10.1016/j.ibmb.2011.01.007
Fujii T, Ito K, Tatematsu M, Shimada T, Katsuma S, Ishikawa Y*. Sex pheromone desaturase functioning in a primitive Ostrinia moth is cryptically conserved in congeners' genomes. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011: 108(17), 7102-7106. DOI: 10.1073/pnas.1019519108
Tatematsu K, Yamamoto K, Uchino K, Narukawa J, Iizuka T, Banno Y, Katsuma S, Shimada T, Tamura T, Sezutsu H, Daimon T*. Positional cloning of silkworm white egg 2 (w-2) locus shows functional conservation and diversification of ABC transporters for pigmentation in insects. Genes Cells. 2011: 16, 331-342. DOI: 10.1111/j.1365-2443.2011.01490.x
Tabunoki H*, Ode H, Banno Y, Katsuma S, Shimada T, Mita K, Yamamoto K, Sato R, Ishii-Nozawa R, Satoh J. BmDJ-1 is a key regulator of oxidative modification in the development of the silkworm, Bombyx mori. PLoS One. 2011: 6(3), e17683. DOI: 10.1371/journal.pone.0017683
Sakudoh T, Nakashima T, Kuroki Y, Fujiyama A, Kohara Y, Honda N, Fujimoto H, Shimada T, Nakagaki M, Banno Y, Tsuchida K*. Diversity in copy number and structure of a silkworm morphogenetic gene as a result of domestication. Genetics. 2011: 187(3), 965-976. DOI: 10.1534/genetics.110.124982
Katsuma S*, Tsuchida A, Matsuda-Imai N, Kang WK, Shimada T. Role of the ubiquitin-proteasome system in Bombyx mori nucleopolyhedrovirus infection. J Gen Virol. 2011: 92(3), 699-705. DOI: 10.1099/vir.0.027573-0
シグナル伝達論文第2弾.プロテアソーム阻害剤のBmNPV増殖における影響を解析した報告.ユビキチン経路がBmNPVの増殖に強く関与することが示唆された.二人目の女性バキュラーである土田さんと理研の今井さん・姜さんに協力してもらって完成した.IE2の自己分解に関しても言及している.抗IE2抗体が4°Cですぐに活性がなくなってしまうことが分からず,長期間にわたりIE2のウエスタンができない状態が続いてしまった.抗体に関する認識の甘さを痛感した研究である.(勝間)
Katsuma S*, Kang WK, Shin-I T, Ohishi K, Kadota K, Kohara Y, Shimada T. Mass identification of transcriptional units expressed from the Bombyx mori nucleopolyhedrovirus genome. J Gen Virol. 2011: 92(Pt 1), 200-203. DOI: 10.1099/vir.0.025908-0
カイコの完全長cDNAライブラリープロジェクトで作成したBmNPV感染BmN-4細胞におけるシークエンシングデータを用いて,BmNPVゲノムから発現する転写ユニットを網羅的に同定した論文.この結果からバキュロウイルスから長鎖非コードRNAと考えられる転写ユニットが発現していることが予想された.現在も各遺伝子の転写解析にこのデータを有効に利用している.(勝間)
Urano K, Daimon T, Banno Y, Mita K, Terada T, Shimizu K, Katsuma S, Shimada T*. Molecular defect of isovaleryl-CoA dehydrogenase in the skunk mutant of silkworm, Bombyx mori. FEBS J. 2010: 277, 4452-4463. DOI: 10.1111/j.1742-4658.2010.07832.x
Abe H*, Fujii T, Shimada T, Mita K. Novel non-autonomous transposable elements on the W chromosome of the silkworm, Bombyx mori. J Genet. 2010: 89(3) (Special issue - How is sex determined in insects?), 375-387. DOI: 10.1007/s12041-010-0049-3
Iwasaki S, Kobayashi M, Yoda M, Sakaguchi Y, Katsuma S, Suzuki T, Tomari Y*. Hsc70/Hsp90 chaperone machinery mediates ATP-dependent RISC loading of small RNA duplexes. Mol Cell. 2010: 39, 292-299. DOI: 10.1016/j.molcel.2010.05.015
Daimon T†, Hirayama S†*, Kanai M, Ruike Y, Meng Y, Kosegawa E, Nakamura M, Tsujimoto G, Katsuma S, Shimada T*. The silkworm Green b locus encodes a quercetin 5-O-glucosyltransferase that produces green cocoons with UV-shielding properties. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010: 107, 11471-11476. DOI: 10.1073/pnas.1000479107
Niwa R†*, Namiki T†, Ito K†, Shimada-Niwa Y, Kiuchi M, Kawaoka S, Kayukawa T, Banno Y, Fujimoto Y, Shigenobu S, Kobayashi S, Shimada T, Katsuma S, Shinoda T*. Non-molting glossy/shroud encodes a short-chain dehydrogenase/reductase that functions in the "Black Box" of the ecdysteroid biosynthesis pathway. Development. 2010: 137, 1991-1999. DOI: 10.1242/dev.045641
Nakanishi T, Shimada T, Katsuma S*. Characterization of a Bombyx mori nucleopolyhedrovirus mutant lacking both fp25K and p35. Virus Genes. 2010: 41, 144-148. DOI: 10.1007/s11262-010-0492-5
FP第5弾論文.とある論文と現象をもとに,FP25Kがp35依存的アポトーシス経路と関係しているのではと予想し,行った研究だが結果はネガティブであった.中西君の代わりに休日に研究室に出向き,写真撮影用に死亡個体を並べ,その写真が論文に掲載されている.この論文で中西君の研究データはほぼ全て吐き出せたことになった.(勝間)
Daimon T, Mitsuhiro M, Katsuma S, Abe H, Mita K, Shimada T*. Recent transposition of yabusame, a novel piggyBac-like transposable element in the silkworm, Bombyx mori. Genome. 2010: 53, 585-593. DOI: 10.1139/G10-035
Fujii T, Daimon T, Uchino K, Banno Y, Katsuma S, Sezutsu H, Tamura T, Shimada T*. Transgenic analysis of the BmBLOS2 gene that governs the translucency of the larval integument of the silkworm, Bombyx mori. Insect Mol Biol. 2010: 19, 659-667. DOI: 10.1111/j.1365-2583.2010.01020.x
Nakanishi T, Goto C, Kobayashi M, Kang WK, Suzuki T, Dohmae N, Matsumoto S, Shimada T, Katsuma S*. Comparative studies of a lepidopteran baculovirus-specific protein FP25K: Development of a novel BmNPV-based vector with a modified fp25K gene. J Virol. 2010: 84, 5191-5200. DOI: 10.1128/jvi.00099-10
FP第4弾論文.中西君の修論の内容を発展させたもの.いろいろなバキュロウイルスのFP25KをBmNPVに導入し,その機能の差異を調査し,最終的には発現量の高いBmNPVベクターの開発に成功した.最初,修論プラスαでJVI誌に投稿したところリジェクトされた.ただ,エディターからは再投稿をサジェストされたため,約半年におよぶリバイズを一人で敢行し,最終的には理研の皆さまにLC-MS/MSでお世話になるなど,データ量が最初の2倍以上に増加した.その結果,無事JVI誌にアクセプトされ,ある意味では強く記憶に残る論文になった.(勝間)
Ito K, Katsuma S, Yamamoto K, Kadono-Okuda K, Mita K, Shimada T*. Yellow-e determines the color pattern of larval head and tail spots of the silkworm, Bombyx mori. J Biol Chem. 2010: 285, 5624-5629. DOI: 10.1074/jbc.M109.035741
Fujii T*, Ito K, Katsuma S, Nakano R, Shimada T, Ishikawa Y. Molecular and biochemical characterization of an acetyl-CoA acetyltransferase from the adzuki bean borer Ostrinia scapulalis (Lepidoptera: Crambidae). Insect Biochem Mol Biol. 2010: 40, 74-48. DOI: 10.1016/j.ibmb.2009.12.012
Fujii T, Kuwazaki S, Yamamoto K, Abe H, Ohnuma A, Katsuma S, Mita K, Shimada T*. Identification and molecular characterization of a sex chromosome rearrangement causing a soft and pliable (spli) larval body phenotype in the silkworm Bombyx mori. Genome. 2010: 53, 45-54. DOI: 10.1139/g09-083
Katsuma S*, Shimada T. Bombyx mori nucleopolyhedrovirus ORF34 is required for efficient transcription of late and very late genes. Virology. 2009: 392, 230-237. DOI: 10.1016/j.virol.2009.07.003
欠損ウイルスライブラリーのスクリーニングによって,ポリヘドリンの合成量に関与する遺伝子の一つを同定した論文.このタンパク質は10 KDa程度の小さな核タンパク質であり,fp25Kやvlf-1の転写亢進を介してポリヘドリンの発現に関与していると考えられた.(勝間)
Kawaoka S, Hayashi N, Suzuki Y, Abe H, Sugano S, Tomari Y, Shimada T, Katsuma S*. The Bombyx ovary-derived cell line endogenously expresses Piwi/Piwi-interacting RNA complexes. RNA. 2009: 15, 1258-1264. DOI: 10.1261/rna.1452209
カイコ卵巣由来の培養細胞であるBmN-4がpiRNA研究に有用であることを示した重要な論文.カイコ個体でのpiRNA研究に行き詰まっていた時に,以前のプレ実験(2005年だと思う)でチョウ目昆虫の培養細胞であるBmN-4, Sf-9, HighFiveにpiRNA様の小分子RNAが存在することを思い出し,培養細胞での実験系の作成に取り組んだ.この論文では,BmN-4細胞からpiRNA様RNAをクローニングし,それがpiRNAであることを示した.また,SiwiとBmAgo3の抗体を作成し,それぞれに結合するpiRNA配列を調査した結果,この細胞がピンポンサイクルと呼ばれるpiRNA産生経路を完全に保持する細胞であることが明らかになった.これはpiRNAピンポン経路を保持することが証明された初めての細胞であり,現在もpiRNA研究に世界中で広く用いられている.論文審査時には自分の名前を自ら名乗るレフリーに初めて遭遇した.この論文から,鈴木先生,菅野先生,泊先生にお世話になり続けている.また,このあたりから河岡くんの論文のコレスポンディングをするようになった.(勝間)
Fujii T, Ozaki M, Masamoto T, Katsuma S, Abe H, Shimada T*. A Bombyx mandarina mutant exhibiting translucent larval skin is controlled by the molybdenum cofactor sulfurase gene. Genes Genet Syst. 2009: 84, 147-152. DOI: 10.1266/ggs.84.147
Meng Y, Katsuma S, Daimon T, Banno Y, Uchino K, Sezutsu H, Tamura T, Mita K, Shimada T*. The silkworm mutant lemon (lemon lethal) is a potential insect model for human Sepiapterin reductase deficiency. J Biol Chem. 2009: 284, 11698 -11705. DOI: 10.1074/jbc.M900485200
Ito K, Katsuma S, Yamamoto K, Kadono-Okuda K, Mita K, Shimada T*. A 25 bp-long insertional mutation in the BmVarp gene causes the waxy translucent skin of the silkworm, Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2009: 39, 287-293. DOI: 10.1016/j.ibmb.2009.01.005
Katsuma S*, Nakanishi T, Shimada T. Bombyx mori nucleopolyhedrovirus FP25K is essential for maintaining a steady-state level of v-cath expression throughout the infection. Virus Res. 2009: 140, 155-160. DOI: 10.1016/j.virusres.2008.11.014
FP論文の第3弾.Katsuma et al., Arch Virol, 2004の論文で見出したFP変異体感染カイコにおけるカテプシンの分泌低下がカテプシン遺伝子の転写量低下によるものであることを証明した論文.中西君の卒論のウエスタンデータも使っている.のちのJVI論文に用いるBm25KD-Bmもこの論文で登場している.(勝間)
Sato Y, Morita R, Katsuma S, Nishimura M, Tanaka A, Kusaba M*. Two short-chain dehydrogenase/reductases, NON-YELLOW COLORING 1 and NYC1-LIKE, are required for chlorophyll b and light-harvesting complex II degradation during senescence in rice. Plant J. 2009: 57, 120-131. DOI: 10.1111/j.1365-313X.2008.03670.x
Kawaoka S, Katsuma S, Meng Y, Hayashi N, Mita K, Shimada T*. Identification and characterization of globin genes from two lepidopteran insects, Bombyx mori and Samia cynthia ricini. Gene. 2009: 431, 33-38. DOI: 10.1016/j.gene.2008.11.004
Meng Y, Katsuma S, Mita K, Shimada T*. Abnormal red body coloration of the silkworm, Bombyx mori, is caused by a mutation in a novel kynureninase. Genes Cells. 2009: 14, 129-140. DOI: 10.1111/j.1365-2443.2008.01257.x
Katsuma S*, Nakanishi T, Daimon T, Shimada T. N-linked glycans located in the pro-region of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus V-CATH are essential for the proper folding of V-CATH and V-CHIA. J Gen Virol. 2009: 90, 170-176. DOI: 10.1099/vir.0.005835-0
バキュロウイルスの宿主溶解に関与するカテプシン(V-CATH)とキチナーゼ(V-CHIA)の機能的な関係を明らかにした論文.かなり実験を繰り返したが,この両者が結合するという免疫沈降の結果は再現よく取れなかったため,この論文には含めなかったが,カテプシンの糖鎖がキチナーゼのフォールディングにも関与するという興味深い結果を報告できたと自負している.すぐ後に別のグループから,両者の結合をFRETと生化学的実験で示した論文がJVI誌に報告された.2番目のバキュラー学生である中西君にウエスタンデータの一部を取ってもらった.(勝間)
Katsuma S*, Horie S, Shimada T. The fibroblast growth factor homolog of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus enhances systemic virus propagation in B. mori larvae. Virus Res. 2008: 137, 80-85. DOI: 10.1016/j.virusres.2008.06.002
FGFの第5弾論文.GFPをレポーターにして,FGFの有無が宿主感染のどの段階で重要なのかを調査した論文.結果としては,血球への感染に重要であるという結論を得ることに成功した.この頃から,GFPをレポーターとして組換えウイルスに導入することが普通になってきたように思う.東大に来て初めて指導した堀江くん(修士から新領域研究科へ移籍)のデータが主体となっている論文である.(勝間)
The International Silkworm Genome Consortium* (Chinese group: Xia Q†*, Wang J†, Zhou Z†, Li R†, Fan W, Cheng D, Cheng T, Qin J, Duan J, Xu H, Li Q, Li N, Wang M, Dai F, Liu C, Lin Y, Zhao P, Zhang H, Liu S, Zha X, Li C, Zhao A, Pan M, Pan G, Shen Y, Gao Z, Wang Z, Wang G, Wu Z, Hou Y, Chai C, Yu Q, He N, Zhang Z, Li S, Yang H, Lu C, Wang J*, Xiang Z* | Japanese group: Mita K†*, Kasahara M†, Nakatani Y†, Yamamoto K†, Abe H, Ahsan B, Daimon T, Doi K, Fujii T, Fujiwara H, Fujiyama A, Futahashi R, Hashimoto S, Ishibashi J, Iwami M, Kadono-Okuda K, Kanamori H, Kataoka H, Katsuma S, Kawaoka S, Kawasaki H, Kohara Y, Kozaki T, Kuroshu RM, Kuwazaki S, Matsushima K, Minami H, Nagayasu Y, Nakagawa T, Narukawa J, Nohata J, Ohishi K, Ono Y, Osanai-Futahashi M, Ozaki K, Qu W, Roller L, Sasaki S, Sasaki T, Seino A, Shimomura M, Shimomura M, Shin-I T, Shinoda T, Shiotsuki T, Suetsugu Y, Sugano S, Suwa M, Suzuki Y, Takiya S, Tamura T, Tanaka H, Tanaka Y, Touhara K, Yamada T, Yamakawa M, Yamanaka N, Yoshikawa H, Zhong Y-S, Shimada T*, Morishita S*). The genome of a lepidopteran model insect, the silkworm Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2008: 38, 1036-1045. DOI: 10.1016/j.ibmb.2008.11.004
Katsuma S*, Kawaoka S, Mita K, Shimada T. Genome-wide survey for baculoviral host homologs using the Bombyx genome sequence. Insect Biochem Mol Biol. 2008: 38, 1080-1086. DOI: 10.1016/j.ibmb.2008.05.008
2008年に発表されたIBMB誌のカイコゲノム特集号のアカンパニー論文として発表したもの.カイコゲノム情報を用いてバキュロウイルスに存在する宿主遺伝子候補を網羅的にスクリーニングし,BmNPVの宿主ホモログについては欠損ウイルスの性状を簡単に報告した.宿主ホモログの研究は今もほそぼそと継続している.(勝間)
Kawaoka S, Hayashi N, Katsuma S, Kishino H, Kohara Y, Mita K, Shimada T*. Bombyx small RNAs: Genomic defense system against transposons in the silkworm, Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2008: 38, 1058-1065. DOI: 10.1016/j.ibmb.2008.03.007
2008年に発表されたIBMB誌のカイコゲノム特集号のアカンパニー論文として発表したもの.カイコのpiRNA配列を発表した最初の論文である.この時代はまだプラスミドにタンデムにクローニングしたpiRNAをサンガー法で読んでいた.生物測定学研究室の林くんがインフォマティクス解析で重要な役割を果たしてくれた.ここからKiuchi et al., Nature, 2014まで到達できたのは,今になってもすごいことだと思う.(勝間)
Fujii T, Abe H, Katsuma S, Mita K, Shimada T*. Mapping of sex-linked genes onto the genome sequence using various aberrations of the Z chromosome in Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2008: 38, 1072-1079. DOI: 10.1016/j.ibmb.2008.03.004
Futahashi R†, Sato J†, Meng Y†, Okamoto S, Daimon T, Yamamoto K, Suetsugu Y, Narukawa J, Takahashi H, Banno Y, Katsuma S, Shimada T, Mita K, Fujiwara H*. yellow and ebony are the responsible genes for the larval color mutants of the silkworm Bombyx mori. Genetics. 2008: 180, 1995-2005. DOI: 10.1534/genetics.108.096388
Katsuma S*, Fujii T, Kawaoka S, Shimada T. Bombyx mori nucleopolyhedrovirus SNF2 global transactivator homologue (Bm33) enhances viral pathogenicity in B. mori larvae. J Gen Virol. 2008: 89, 3039-3046. DOI: 10.1099/vir.0.2008/004887-0
バキュロウイルスの宿主ホモログの一つであるSNF2 (Bm33)の欠損ウイルスの性状解析を報告した論文.強い表現型は示さなかったものの,カイコ幼虫における病原性に関与するという結果が得られた.(勝間)
Arunkumar KP, Tomar A, Daimon T, Shimada T, Nagaraju J*. WildSilkbase: An EST database of wild silkmoths. BMC Genomics. 2008: 9, 338. DOI: 10.1186/1471-2164-9-338
Suzuki MG, Imanishi S, Dohmae N, Nishimura T, Shimada T, Matsumoto S*. Establishment of a novel in vivo sex-specific splicing assay system to identify a trans-acting factor that negatively regulates splicing of Bombyx mori dsx female exons. Mol Cell Biol. 2008: 28, 333-343. DOI: 10.1128/MCB.01528-07
Ito K, Kidokoro K, Sezutsu H, Nohata N, Yamamoto K, Kobayashi I, Uchino K, Kalyebi A, Eguchi R, Hara W, Tamura T, Katsuma S, Shimada T, Mita K, Kadono-Okuda K*. Deletion of a gene encoding an amino acid transporter in the midgut membrane causes resistance to a Bombyx parvo-like virus. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008: 105, 7523-7527. DOI: 10.1073/pnas.0711841105
Daimon T, Taguchi T, Meng Y, Katsuma S, Mita K, Shimada T*. Beta-fructofuranosidase genes of the silkworm, Bombyx mori: Insight into enzymatic adaptation of B. mori to toxic alkaloids in mulberry latex. J Biol Chem. 2008: 283, 15271-15279. DOI: 10.1074/jbc.M709350200
Tabunoki H, Shimada T, Banno Y, Sato R, Kajiwara H, Mita K, Satoh J*. Identification of Bombyx mori 14-3-3 orthologs and the interactor Hsp60. Neurosci Res. 2008: 61, 271-280. DOI: 10.1016/j.neures.2008.03.007
Kawaoka S†, Minami K†, Katsuma S, Mita K, Shimada T*. Developmentally synchronized expression of two Bombyx mori Piwi subfamily genes, SIWI and BmAGO3 in germ-line cells. Biochem Biophys Res Commun. 2008: 367, 755-760. DOI: 10.1016/j.bbrc.2008.01.013
河岡くんのpiRNA研究論文第1弾.卒論生の南くんと協力してカイコのPIWI遺伝子であるSiwiとBmAgo3をESTからクローニング,配列決定し,発現プロファイルを作成した論文.ノーリバイズでアクセプトされた.南くんは修士課程から理学研究科に移籍したが,今では他分野で活躍しているようで(新年会にもよく来てくれる)嬉しい限りである.(勝間)
Abe H*, Fujii T, Tanaka N, Yokoyama T, Kakehashi K, Ajimura M, Mita K, Banno Y, Yasukochi Y, Oshiki T, Nenoi M, Ishikawa T, Shimada T. Identification of the female-determining region of the W chromosome in Bombyx mori. Genetica. 2008: 133, 269-282. DOI: 10.1007/s10709-007-9210-1
Kawaoka S, Katsuma S, Daimon T, Isono R, Omuro S, Mita K, Shimada T*. Functional analysis of four Gloverin-like genes in the silkworm, Bombyx mori. Arch Insect Biochem Physiol. 2008: 67, 87-96. DOI: 10.1002/arch.20223
Meng Y, Omuro N, Funaguma S, Daimon T, Kawaoka S, Katsuma S, Shimada T*. Prominent down-regulation of storage protein genes after bacterial challenge in eri-silkworm, Samia cynthia ricini. Arch Insect Biochem Physiol. 2008: 67, 9-19. DOI: 10.1002/arch.20214
Orihara Y, Hamamoto H, Kasuga H, Shimada T, Kawaguchi Y, Sekimizu K*. Evaluation of therapeutic effects of antiviral agents using a silkworm baculovirus infection model. J Gen Virol. 2007: 89, 188-194. DOI: 10.1099/vir.0.83208-0
Katsuma S*, Mita K, Shimada T. ERK- and JNK-dependent signaling pathways contribute to Bombyx mori nucleopolyhedrovirus infection. J Virol. 2007: 81, 13700-13709. DOI: 10.1128/jvi.01683-07
今で言うところのケミカルバイオロジー的アプローチで,バキュロウイルス感染に重要な役割を果たすMAPキナーゼ経路を明らかにした研究.この論文のために毎日たくさんのタッパーを揺らして,ウエスタンブロットに明け暮れていたことが懐かしい(今では確実に無理です).一度JVI誌にリジェクトされたが,リバイズの結果,最終的にはかなり完成度が上がってよかったと思う.この頃,アメリカウイルス学会のシンポジウムに呼ばれ,主たるバキュロウイルス研究者と知り合いになった.(勝間)
Daimon T, Katsuma S, Kang WK, Shimada T*. Functional characterization of chitinase from Cydia pomonella granulovirus. Arch Virol. 2007: 152, 1655-1664. DOI: 10.1007/s00705-007-1000-7
Quan GX, Kobayashi I, Kojima K, Uchino K, Kanda T, Sezutsu H, Shimada T, Tamura T*. Rescue of white egg 1 mutant by introduction of the wild-type Bombyx kynurenine 3-monooxygenase gene. Insect Sci. 2007: 14, 85-92. DOI: 10.1111/j.1744-7917.2007.00129.x
Iwanaga M*, Shimada T, Kobayashi M, Kang WK. Identification of differentially expressed host genes in Bombyx mori nucleopolyhedrovirus infected cells by using subtractive hybridization. Appl Entomol Zool. 2007: 42, 151-159. DOI: 10.1303/aez.2007.151
Funaguma S, Hashimoto S, Suzuki Y, Omuro N, Sugano S, Mita K, Katsuma S, Shimada T*. SAGE analysis of early oogenesis in the silkworm, Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2007: 37, 147-154. DOI: 10.1016/j.ibmb.2006.11.001
Daimon T, Katsuma S, Shimada T*. Mutational analysis of active site residues of chitinase from Bombyx mori nucleopolyhedrovirus. Virus Res. 2007: 124, 168-175. DOI: 10.1016/j.virusres.2006.11.001
Fujii T, Yokoyama T, Ninagi O, Kakehashi K, Obara Y, Nenoi M, Ishikawa T, Mita K, Shimada T, Abe H*. Isolation and characterization of sex chromosome rearrangements generating male muscle dystrophy and female abnormal oogenesis in the silkworm, Bombyx mori. Genetica. 2007: 130, 267-280. DOI: 10.1007/s10709-006-9104-7
Katsuma S*, Daimon T, Horie S, Kobayashi M, Shimada T. N-linked glycans of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus fibroblast growth factor are crucial for its secretion. Biochem Biophys Res Commun. 2006: 350, 1069-1075. DOI: 10.1016/j.bbrc.2006.10.001
FGFの第4弾論文.FGFタンパク質の性状を組換えタンパク質を用いて解析したもの.BmNPVのFGFにはN結合型の糖鎖が2か所に付加されており,それらがFGFの分泌性に関与していることが判明した.また,AcMNPVのFGFには糖鎖は付加しておらず,ほとんど分泌していないことも分かった.実際,AcMNPVのFGFにアミノ酸置換を導入し糖鎖が付加されるように改変すると,効率よく分泌されるようになったことから,このFGFは分泌せずに機能するタンパク質として進化してきたようである.この発表後に,パサレリ博士らの研究によって,AcMNPVのFGFがエンヴェロープ上に提示されて機能している可能性が報告されている.BmNPVとAcMNPVという非常に近縁なウイルスにおいて,FGFタンパク質の機能が異なっていることを示唆した興味深い結果である.(勝間)
Katsuma S*, Horie S, Daimon T, Iwanaga M, Shimada T. In vivo and in vitro analyses of a Bombyx mori nucleopolyhedrovirus mutant lacking functional vfgf. Virology. 2006: 355, 62-70. DOI: 10.1016/j.virol.2006.07.008
FGFの第3弾論文.fgf欠損ウイルスを作成し,その性状を培養細胞とカイコ幼虫において解析したもの.fgf欠損BmNPVは,培養細胞及びカイコ幼虫においてウイルスの増殖が低下していた.エディターであったジョージ・ローマン博士の要求が細かく,2–3回リバイズした記憶がある.このあたりから,近縁のAcMNPVとはFGFの機能が少し違うのではと感じ始める.(勝間)
Daimon T, Katsuma S, Kang WK, Shimada T*. Comparative studies of Bombyx mori nucleopolyhedrovirus chitinase and its host ortholog, BmChi-h. Biochem Biophys Res Commun. 2006: 345, 825-833. DOI: 10.1016/j.bbrc.2006.04.112
Katsuma S*, Daimon T, Mita K, Shimada T. Lepidopteran ortholog of Drosophila Breathless is a receptor for the baculoviral fibroblast growth factor. J Virol. 2006: 80, 5474-5481. DOI: 10.1128/jvi.00248-06
今のポジションについて最初に執筆した論文で,FGFの第2弾論文である.京大にいる頃から計画を練っていたバキュロウイルスFGFの宿主受容体のクローニングとその機能解析を報告した.バキュロウイルスが宿主受容体を介して宿主の細胞内シグナリングをハイジャックすることを証明した最初の論文であり,ウイルスFGFが宿主細胞のケモタキシスを誘導することを示した報告でもある.初めてコレスポンディングオーサー(責任著者)になった記念論文でもある.(勝間)
Fujii T, Tanaka N, Yokoyama T, Ninaki O, Oshiki T, Ohnuma A, Tazima Y, Banno Y, Ajimura M, Mita K, Seki M, Ohbayashi F, Shimada T, Abe H*. The female-killing chromosome of the silkworm, Bombyx mori, was generated by translocation between the Z and W chromosomes. Genetica. 2006: 127, 253-265. DOI: 10.1007/s10709-005-4147-8
Tsukioka H, Takahashi M, Mon H, Okano K, Mita K, Shimada T, Lee JM, Kawaguchi Y, Koga K, Kusakabe T*. Role of the silkworm argonaute2 homolog gene in double-strand break repair of extrachromosomal DNA. Nucleic Acids Res. 2006: 34, 1092-1101. DOI: 10.1093/nar/gkj507
Zhong YS, Mita K, Shimada T, Kawasaki H*. Glycine rich protein genes, encoding proteins constructing insect cuticle, have different developmental profiles from other cuticle protein genes in Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2006: 36, 99-110. DOI: 10.1016/j.ibmb.2005.07.005
Miao XX†, Xu SJ†, Li MH†, Li MW†, Huang JH†, Dai FY, Marino SW, Mills DR, Zheng PY, Mita K, Jia SH, Zhang Y, Liu WB, Xiang H, Guo QH, Xu AY, Kong XY, Lin HX, Shi YZ, Lu G, Zhang X, Huang W, Yasukochi Y, Sugasaki T, Shimada T, Nagaraju J, Xiang ZH, Wang SY*, Goldsmith MR*, Lu C*, Zhao GP*, Huang YP*. Simple sequence repeat-based consensus linkage map of Bombyx mori. Proc Natl Acad Sci U S A. 2005: 102, 16303-16308. DOI: 10.1073/pnas.0507794102
Daimon T, Katsuma S, Iwanaga M, Kang WK, Shimada T*. The BmChi-h gene, a bacterial-type chitinase gene of Bombyx mori, encodes a functional exochitinase that plays a role in the chitin degradation during the molting process. Insect Biochem Mol Biol. 2005: 35, 1112-1123. DOI: 10.1016/j.ibmb.2005.05.005
Katsuma S, Tanaka S, Omuro N, Takabuchi L, Daimon T, Imanishi S, Yamashita S, Iwanaga M, Mita K, Maeda S, Kobayashi M, Shimada T*. Novel macula-like virus identified in Bombyx mori cultured cells. J Virol. 2005: 79, 5577-5584. DOI: 10.1128/jvi.79.9.5577-5584.2005
バキュロウイルス感染細胞のマイクロアレイ論文(Iwanaga M†, Takaya K†, Katsuma S† et al., Biochem Biophys Res Commun, 2004)で発現変動している遺伝子を調査していた時に,植物ウイルス様の配列を見出し,それがカイコ培養細胞に慢性感染しているRNAウイルスであることを証明した論文.数年前の論文でゲノム中の反復配列と発表されていたので,ラボのとある先生はこの配列がウイルスであるという考えに否定的であった.しかし,渾身のノザンブロットの結果を見せたときに「そう思っていましたよ」と言われたのには拍子抜けしてしまった.最終的に超遠心で精製した画分の電顕観察でウイルス粒子が見えた時には,未知ウイルスを発見した喜びに酔いしれた.この植物RNAウイルス様ウイルスが昆虫細胞に感染するようになった起源や増殖の仕組みなど未だに不明な点が多い.最近の研究では,ミツバチなど他の昆虫にも類似のウイルスが存在することが報告されている.初めてウイルス学雑誌の最高峰であるJVI誌に掲載され,少し自信が出てきた頃である.現在,このBmMLVに関する研究は宇都宮大の岩永准教授のグループが主体となって進めている(piRNAの項のKatsuma*†, Kawamoto†, Shoji†, Aizawa† et al., DNA Res, 2018も参照してください).(勝間)
Ote M, Mita K, Kawasaki H, Daimon T, Kobayashi M, Shimada T*. Identification of molting fluid carboxypeptidase A (MF-CPA) in Bombyx mori. Comp Biochem Physiol B. 2005: 141, 314-322. DOI: 10.1016/j.cbpc.2005.04.005
Ote M, Mita K, Kawasaki H, Kobayashi M, Shimada T*. Characteristics of two genes encoding proteins with an ADAM-type metalloprotease domain, which are induced during the molting periods in Bombyx mori. Arch Insect Biochem Physiol. 2005: 59, 91-98. DOI: 10.1002/arch.20059
Funaguma S, Suzuki MG, Tamura T, Shimada T*. The Bmdsx transgene including trimmed introns is sex-specifically spliced in tissues of the silkworm, Bombyx mori. J Insect Sci. 2005: 5, 17. DOI: 10.1093/jis/5.1.17
Abe H*, Seki M, Ohbayashi F, Tanaka N, Yamashita JI, Fujii T, Yokoyama T, Takahashi M, Banno Y, Sahara K, Yoshido A, Ihara JI, Yasukochi Y, Mita K, Ajimura M, Suzuki MG, Oshiki T, Shimada T. Partial deletions of the W chromosome due to reciprocal translocation in the silkworm Bombyx mori. Insect Mol Biol. 2005: 14, 339-352. DOI: 10.1111/j.1365-2583.2005.00565.x
Kamita SG, Nagasaka K, Chua JW, Shimada T, Mita K, Kobayashi M, Maeda S, Hammock BD*. A baculovirus-encoded protein tyrosine phosphatase gene induces enhanced locomotory activity in a lepidopteran host. Proc Natl Acad Sci USA. 2005: 102, 2584-2589. DOI: 10.1073/pnas.0409457102
Funaguma S, Shimada T*. Accurate pre-mRNA splicing using a nuclear extract from Bombyx mori fat body. Insect Biochem Mol Biol. 2005: 35, 257-261. DOI: 10.1016/j.ibmb.2004.12.005
Prasad MD*, Muthulakshmi M, Madhu M, Arunkumar KP, Sreenu VB, Pavithra V, Bose B, Nagarajaram HA, Mita K, Shimada T, Nagaraju J. SilkSatDb: A microsatellite database of the silkworm, Bombyx mori. Nucleic Acids Res. 2005: 33, D403-406. DOI: 10.1093/nar/gki099
Suzuki MG, Funaguma S, Kanda T, Tamura T, Shimada T*. Role of the male BmDSX protein in the sexual differentiation of Bombyx mori. Evol Dev. 2005: 7, 58-68. DOI: 10.1111/j.1525-142X.2005.05007.x
Iwanaga M†, Takaya K†, Katsuma S†, Ote M, Tanaka S, Kamita SG, Kang WK, Shimada T*, Kobayashi M. Expression profiling of baculovirus genes in permissive and nonpermissive cell lines. Biochem Biophys Res Commun. 2004: 323, 599-614. DOI: 10.1016/j.bbrc.2004.08.114
現在,宇都宮大・准教授の岩永博士が進めていたバキュロウイルスのマイクロアレイの研究をまとめた論文.近縁な2種類のウイルスであるBmNPVとAcMNPVを用いて,宿主特異性とウイルス遺伝子の発現との関係を明らかにした研究である.京大の助手に異動してからUCデービスのKamita博士とメールで相談しながらまとめたことを思い出す.会社時代に取得したマイクロアレイ解析を違う材料に適用できた論文でもある.(勝間)
Katsuma S, Tanaka S, Shimada T*, Kobayashi M. Reduced cysteine protease activity of the hemolymph of Bombyx mori larvae infected with fp25K-inactivated Bombyx mori nucleopolyhedrovirus results in the reduced postmortem host degradation. Arch Virol. 2004: 149, 1773-1782. DOI: 10.1007/s00705-004-0328-5
FP論文の第2弾.リサーチフェロー時に行った研究で,FP変異体における死後溶解の抑制がカテプシンの分泌低下に依存している可能性を報告したもの.当時,大学院生であった田中君にqPCRを手伝ってもらった.(勝間)
Katsuma S, Shimada T*, Kobayashi M. Characterization of the baculovirus Bombyx mori nucleopolyhedrovirus gene homologous to the mammalian FGF gene family. Virus Genes. 2004: 29, 211-217. DOI: 10.1023/B:VIRU.0000036381.11779.dd
6年間勤めていた製薬会社の研究所を退社し,東大の研究室でリサーチフェローとして在籍させていただいた8か月の間に行った仕事.昔から気になっていたバキュロウイルスの成長因子FGFの簡単な性状解析.バキュロウイルスのFGFとしては最初の報告になる.初期遺伝子であり,実際にタンパク質として細胞外に分泌されていることを証明した.(勝間)
Kawasaki H*, Ote M, Okano K, Shimada T, Quan GX, Mita K. Change in the expressed gene patterns of the wing disc during the metamorphosis of Bombyx mori. Gene. 2004: 343, 133-142. DOI: 10.1016/j.gene.2004.08.013
Ote M*, Mita K, Kawasaki H, Seki M, Nohata J, Kobayashi M, Shimada T. Microarray analysis of gene expression profiles in wing discs of Bombyx mori during pupal ecdysis. Insect Biochem Mol Biol. 2004: 34, 775-784. DOI: 10.1016/j.ibmb.2004.04.002
Mita K*, Kasahara M, Sasaki S, Nagayasu Y, Yamada T, Kanamori H, Namiki N, Kitagawa M, Yamashita H, Yasukochi Y, Kadono-Okuda K, Yamamoto K, Ajimura M, Ravikumar G, Shimomura M, Nagamura Y, Shin-i T, Abe H, Shimada T, Morishita S, Sasaki T. The genome sequence of silkworm, Bombyx mori. DNA Res. 2004: 11, 27-35. DOI: 10.1093/dnares/11.1.27
Landais I*, Ogliastro M, Mita K, Nohata J, Lopez-Ferber M, Duonor-Cerutti M, Shimada T, Fournier P, Devauchelle G. Annotation pattern of ESTs from Spodoptera frugiperda Sf9 cells and analysis of the ribosomal protein genes reveal insect-specific features and unexpectedly low codon usage bias. Bioinformatics. 2003: 19, 2343-2350. DOI: 10.1093/bioinformatics/btg324
Markova EP, Shimada T, Takeda M*. Daily expression patterns of Cycle and Clock genes in the head of the silkworm, Bombyx mori. Biotechnol Biotechnol Equip. 2003: 18, 77-81. DOI: 10.1080/13102818.2004.10819234
Mita K, Morimyo M, Okano K, Koike Y, Nohata J, Kawasaki H, Kadono-Okuda K, Yamamoto K, Suzuki MG, Shimada T, Goldsmith MR*, Maeda S. The construction of an EST database for Bombyx mori and its application. Proc Natl Acad Sci U S A. 2003: 100, 14121-14126. DOI: 10.1073/pnas.2234984100
Sahara K*, Yoshido A, Kawamura N, Onuma A, Abe H, Mita K, Oshiki T, Shimada T, Asano S, Bando H, Yasukochi Y. W-derived BAC probes as a new tool for identification of the W chromosome and its aberrations in Bombyx mori. Chromosoma. 2003: 112, 48-55. DOI: 10.1007/s00412-003-0245-5
Daimon T, Hamada K, Mita K, Okano K, Suzuki MG, Kobayashi M, Shimada T*. A Bombyx mori gene, BmChi-h, encodes a protein homologous to bacterial and baculovirus chitinases. Insect Biochem Mol Biol. 2003: 33, 749-759. DOI: 10.1016/S0965-1748(03)00084-5
Yokoyama T, Abe H*, Irobe Y, Saito K, Tanaka N, Kawai S, Ohbayashi F, Shimada T, Oshiki T. Detachment analysis of the translocated W chromosome shows that the female-specific randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) marker, Female-218, is derived from the second chromosome fragment region of the translocated W chromosome of the sex-limited pB silkworm (Bombyx mori) strain. Heredity. 2003: 138, 148-153. DOI: 10.1034/j.1601-5223.2003.01720.x
Suzuki MG, Funaguma S, Kanda T, Tamura T, Shimada T*. Analysis of the biological functions of a doublesex homologue in Bombyx mori. Dev Genes Evol. 2003: 213, 345-354. DOI: 10.1007/s00427-003-0334-8
Noji T, Ote M, Takeda M, Mita K, Shimada T, Kawasaki H*. Isolation and comparison of different ecdysone-responsive cuticle protein genes in wing discs of Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2003: 33, 671-679. DOI: 10.1016/S0965-1748(03)00048-1
Markova EP*, Ueda H, Sakamoto K, Oishi K, Shimada T, Takeda M. Cloning of Cyc (Bmal-1) homolog in Bombyx mori; structural analyses and the tissue specific distributions. Comp Biochem Physiol B. 2003: 134, 535-542. DOI: 10.1016/S1096-4959(03)00004-6
Koike Y, Mita K, Suzuki MG, Maeda S, Abe H, Osoegawa K, deJong PJ, Shimada T*. Genomic sequence of 320 kb containing a kettin orthologue on the Z chromosome in Bombyx mori. Mol Genet Genomics. 2003: 269, 137-149. DOI: 10.1007/s00438-003-0822-6
Abe H*, Sugasaki T, Terada T, Kanehara M, Ohbayashi F, Shimada T, Kawai S, Mita K, Oshiki T. Nested retrotransposons on the W chromosome of the wild silkworm Bombyx mandarina. Insect Mol Biol. 2002: 11, 307-314. DOI: 10.1046/j.1365-2583.2002.00339.x
Quan GX, Kim I, Koumoto N, Sezutsu H, Ote M, Shimada T, Kanda T, Mita K, Kobayashi M, Tamura T*. Characterization of the kynurenine 3-monooxygenase gene corresponding to the white egg 1 mutant in the silkworm Bombyx mori. Mol Genet Genomics. 2002: 267, 1-9. DOI: 10.1007/s00438-001-0629-2
Zhao X, Mita K, Shimada T, Okano K, Quan GX, Kanke E, Kawasaki H*. Isolation and expression of an ecdysteroid-inducible neutral endopeptidase 24.11-like gene in wing discs of Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2001: 31, 1213-1219. DOI: 10.1016/S0965-1748(01)00069-8
Suzuki MG, Ohbayashi F, Mita K, Shimada T*. The mechanism of sex-specific splicing at the doublesex gene is different between Drosophila melanogaster and Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2001: 31, 1201-1211. DOI: 10.1016/S0965-1748(01)00067-4
Takeda M, Mita K, Quan GX, Shimada T, Okano K, Kanke E, Kawasaki H*. Mass isolation of cuticle protein cDNAs from wing discs of Bombyx mori and their characterizations. Insect Biochem Mol Biol. 2001: 31, 1019-1028. DOI: 10.1016/S0965-1748(01)00050-9
Okano K*, Shimada T, Mita K, Maeda S. Comparative expressed-sequence-tag analysis of differential gene expression profiles in BmNPV-infected BmN cells. Virology. 2001: 282, 348-356. DOI: 10.1006/viro.2001.0823
Abe H*, Ohbayashi F, Sugasaki T, Kanehara M, Terada T, Shimada T, Kawai S, Mita K, Kanamori Y, Yamamoto MT, Oshiki T. Two novel Pao-like retrotransposons (Kamikaze and Yamato) from the silkworm species Bombyx mori and B. mandarina: common structural features of Pao-like elements. Mol Genet Genomics. 2001: 265, 375-385. DOI: 10.1007/s004380000428
Matsumoto S*, Yoshiga T, Yokoyama N, Iwanaga M, Koshiba S, Kigawa T, Hirota H, Yokoyama S, Okano K, Mita K, Shimada T, Tatsuki S. Characterization of acyl-CoA-binding protein (ACBP) in the pheromone gland of the silkworm, Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2001: 31, 603-609. DOI: 10.1016/S0965-1748(00)00165-X
Ohbayashi F, Suzuki MG, Mita K, Okano K, Shimada T*. A homologue of the Drosophila doublesex gene is transcribed into sex-specific mRNA isoforms in the silkworm, Bombyx mori. Comp Biochem Physiol B. 2001: 128, 145-158. DOI: 10.1016/S1096-4959(00)00304-3
Quan GX, Mita K, Okano K, Shimada T, Ugajin N, Zhao X, Goto N, Kanke E, Kawasaki H*. Isolation and expression of the ecdysteroid-inducible angiotensin-converting enzyme-related gene in wing discs of Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 2001: 31, 97-103. DOI: 10.1016/s0965-1748(00)00112-0
Katsuma S, Deng DX, Zhou CE, Iwanaga M, Noguchi Y, Kobayashi M*, Maeda S. Identification of novel residues involved in nuclear localization of a baculovirus polyhedrin protein. Virus Genes. 2000: 21, 233-240. DOI: 10.1023/a:1008151916849
UCデービスのDengさん, Zhou博士のサポートでBmNPVの多角体形成変異株のうち未発表であったものを全てまとめた論文.ポリヘドリンの核移行シグナルが保存されていても,ある領域に変異が入ると細胞質に留まってしまうことがあることを明らかにした.前田さんと行った研究を最終的に全部まとめることができてよかったと思う.(勝間)
Mikitani K*, Sugasaki T, Shimada T, Kobayashi M, Gustafsson JA. The chitinase gene of the silkworm, Bombyx mori, contains a novel Tc-like transposable element. J Biol Chem. 2000: 275, 37725-37732. DOI: 10.1074/jbc.M005271200
Abraham EG, Sezutsu H, Kanda T, Sugasaki T, Shimada T, Tamura T*. Identification and characterization of a silkworm ABC transporter gene homologous to Drosophila white. Mol Gen Genet. 2000: 264, 11-19. DOI: 10.1007/s004380000283
Abe H*, Ohbayashi F, Shimada T, Sugasaki T, Kawai S, Mita K, Oshiki T. Molecular structure of a novel gypsy-Ty3-like retrotransposon (Kabuki) and nested retrotransposable elements on the W chromosome of the silkworm, Bombyx mori. Mol Gen Genet. 2000: 263, 916-924. DOI: 10.1007/s004380000270
Abe H*, Sugasaki T, Kanehara M, Shimada T, Gomi SJ, Ohbayashi F, Oshiki T. Identification and genetic mapping of RAPD markers linked to the densonucleosis refractoriness gene, nsd-2, in the silkworm, Bombyx mori. Genes Genet Syst. 2000: 75, 93-96. DOI: 10.1266/ggs.75.93
Yoshiga T, Okano K, Mita K, Shimada T, Matsumoto S*. cDNA cloning of acyl-CoA desaturase homologs in the silkworm, Bombyx mori. Gene. 2000: 246, 339-345. DOI: 10.1016/S0378-1119(00)00047-0
Katsuma S, Noguchi Y, Shimada T, Nagata M, Kobayashi M, Maeda S. Molecular characterization of baculovirus Bombyx mori nucleopolyhedrovirus polyhedron mutants. Arch Virol. 1999: 144, 1275-1285. DOI: 10.1007/s007050050586
卒論の時から始めた研究内容をまとめたもの.最終的にはBmNPV変異体6株の変異領域と表現型との関係をシークエンス解析と組換えウイルスの作成により証明することができた.この研究で使っている立方体の多角体を形成する#220株のポリヘドリン遺伝子を使って,初めて遺伝子組換えバキュロウイルスを作成した.好きな変異株の一つであり,ウイルス研究にはまるきっかけとなったウイルスである.20年経った2020年の現時点でも多角体の形とウイルス粒子の包埋メカニズムには興味を持っている.(勝間)
Katsuma S, Noguchi Y, Zhou CE*, Kobayashi M, Maeda S. Characterization of the 25K FP gene of the baculovirus Bombyx mori nucleopolyhedrovirus: implications for post-mortem host degradation. J Gen Virol. 1999: 80, 783-791. DOI: 10.1099/0022-1317-80-3-783
記念すべき最初の原著論文.当時,埼玉県試験場の野口洋子博士が突然変異誘起剤の処理により単離した5株のカイコ核多角体病ウイルス(BmNPV)のFew polyhedral (FP)変異体を解析する過程で,原因遺伝子であるfp25Kが死後溶解に関わる新規遺伝子であることを見出した.最初,JVI誌に投稿しリジェクトされたため,初リジェクトを受けた論文でもある.(勝間)
Suzuki MG, Shimada T*, Yokoyama T, Kobayashi M. The influence of triploidy on gene expression in the silkworm, Bombyx mori. Heredity. 1999: 82, 661-667. DOI: 10.1046/j.1365-2540.1999.00526.x
Suzuki MG, Terada T, Kobayashi M, Shimada T*. Diapause-associated transcription of BmEts, a gene encoding an ETS transcription factor homolog in Bombyx mori. Insect Biochem Mol Biol. 1999: 29, 339-347. DOI: 10.1016/S0965-1748(99)00008-9
Suzuki MG, Shimada T*, Kobayashi M. Bm kettin, homologue of the Drosophila kettin gene, is located on the Z chromosome in Bombyx mori and is not dosage compensated. Heredity. 1999: 82, 170–179. DOI: 10.1038/sj.hdy.6884570
勝間進 教授
Tanaka T, Katsuma S, Adachi T, Koshimizu TA, Hirasawa A, Tsujimoto G*. Free fatty acids induce cholecystokinin secretion through GPR120. Naunyn Schmiedebergs Arch Pharmacol. 2008: 377, 523-527. DOI: 10.1007/s00210-007-0200-8
Ruike Y, Katsuma S, Hirasawa A, Tsujimoto G*. Glucocorticoid-induced alternative promoter usage for a novel 5’ variant of granzyme A. J Hum Genet. 2007: 52, 172-178. DOI: 10.1007/s10038-006-0099-9
Herath CB, Ishiwata H, Shiojima S, Kadowaki T, Katsuma S, Ushizawa K, Imai K, Takahashi T, Hirasawa A, Takahashi S, Izaike Y, Tsujimoto G, Hashizume K*. Developmental aberrations of liver gene expression in bovine fetuses derived from somatic cell nuclear transplantation. Cloning Stem Cells. 2006: 8, 79-95. DOI: 10.1089/clo.2006.8.79
Katsuma S, Ruike Y, Yano T, Kimura M, Hirasawa A, Tsujimoto G. Transcriptional regulation of connective tissue growth factor by sphingosine 1-phosphate in rat cultured mesangial cells. FEBS Lett. 2005: 578, 2576-2582. DOI:
Katsuma S, Hatae N, Yano T, Ruike Y, Kimura M, Hirasawa A, Tsujimoto G. Free fatty acids inhibit serum deprivation-induced apoptosis through GPR120 in a murine enteroendocrine cell line STC-1. J Biol Chem. 2005: 280, 19507-19515. DOI:
Yamada M, Katsuma S, Adachi T, Hirasawa A, Shiojima S, Kadowaki T, Okuno Y, Koshimizu T, Fujii S, Sekiya Y, Miyamoto Y, Tamura M, Yumura W, Nihei H, Kobayashi M, Tsujimoto G. Inhibition of protein kinase CK2 prevents the progression of glomerulonephritis. Proc Natl Acad Sci USA. 2005: 102, 7736-7741. DOI:
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Takagaki K, Katsuma S, Kaminishi Y, Horio T, Nakagawa S, Tanaka T, Ohgi T, Yano J. Gene-expression profiling reveals down-regulation of equilibrative nucleoside transporter 1 (ENT1) in Ara-C-resistant CCRF-CEM-derived cells. J Biochem. 2004: 136, 733-740. DOI:
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Nakamura T, Shiojima S, Hirai Y, Iwama T, Tsuruzoe N, Hirasawa A, Katsuma S, Tsujimoto G. Temporal gene expression changes of adipogenesis in human mesenchymal stem cells. Biochem Biophys Res Commun. 2003: 303, 306-312. DOI:
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Hashizume K, Ishiwata H, Kizaki K, Yamada O, Takahashi T, Imai K, Patel OV, Akagi S, Shimizu M, Takahashi S, Katsuma S, Shiojima S, Hirasawa A, Tsujimoto G, Todoroki J, Izaike Y. Implantation and placental development in somatic cell clone recipient cows. Cloning Stem Cells. 2002: 4, 197-209. DOI:
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木内隆史 准教授
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