Resident Evil 2

Dans le tunnel situé sous l'entrée du commissariat, Claire Redfield rencontre un zombie, particulièrement coriace (qui s'avère être Brad Vickers, le pilote de l'hélicoptère de l'équipe Alpha des S.T.A.R.S comme nous pourrons le découvrir dans Resident Evil 3). Elle l'élimine et parvient à pénétrer dans le commissariat. Dans le bureau principal de l'aile ouest du commissariat, Claire Redfield rencontre Marvin Branagh, un policier blessé qui lui raconte que son frère ainsi que d'autres membres du S.T.A.R.S ont tenté de découvrir la vérité, suite aux évènements survenus au manoir, mais que personne ne les as cru. 

Pendant ce temps, Léon S. Kennedy arrive par l'aile est du commissariat. Tout à coup, un hélicoptère apparaît, un survivant parvient à lui faire signe avant d'être attaqué par des zombies. L'hélicoptère s'écrase sur l'héliport provoquant une forte explosion. Alors que Léon S. Kennedy parvient à éteindre l'incendie, un second hélicoptère arrive et lâche quatre containers sur le commissariat avec à l'intérieur Mister X. Léon S. Kennedy l'affronte et parvient à le mettre à terre, mais lorsqu'il quitte la pièce, la créature se relève et continue sa route. 

Claire Redfield parvient au bureau des S.T.A.R.S où elle lit le journal de son frère. Elle découvre qu'il a tenté de raconter l'histoire du virus T au sein de la police mais tout le monde a refusé de le croire. Il a obtenu une information : Umbrella travaille actuellement sur une variante du virus T, le virus G ce qui l'a poussé à partir au quartier général d'Umbrella en Europe. Un fax arrive alors, c'est un rapport de Brian Irons, le Capitaine de Police qui révèle qu'il reçoit des pots-de-vin de la part d'Umbrella qui a demandé qu'on étouffe l'affaire du manoir, affaire dans laquelle Umbrella était directement impliquée. En sortant du bureau, Claire Redfield tombe sur une petite fille, qui s'enfuit en voyant Léon S. Kennedy. Claire Redfield et Léon S. Kennedy conviennent de retrouver cet enfant avant de s'échapper. 

En parcourant le commissariat et les autres zones, ils découvrent plusieurs documents permettant de comprendre la chronologie des évènements : 

• Le 20 septembre 1998 : un individu suspect est détecté à proximité des égouts avec des explosifs. 

• Le 23 septembre 1998 : les agents d'Umbrella lance l'attaque contre William Birkin pour récupérer le virus G ce qui entraîne la contamination de la ville. 

• Du 26 au 28 septembre 1996 : une bande de zombies attaque la ville au sein du commissariat, tous les policiers finissent par être contaminés. 

Au sous-sol, Léon S. Kennedy évite les balles d'une femme prénommée Ada Wong, à la recherche d'un journaliste Ben Bertolucci, qui devrait se trouver dans une cellule de la prison. Elle prend la fuite. Alors que Léon S. Kennedy tente de la retrouver, il tombe sur Ben Bertolucci emprisonné. Ada Wong les rejoint. Le journaliste refuse de révéler ses informations. Ada Wong explique les raisons de sa présence : son petit ami, John qui travaille pour la branche des bureaux d'Umbrella à Chicago a disparu depuis 6 mois et il aurait été aperçu à Raccoon City. Tous entendent un affreux cri, Ada Wong décide de s'enfuir, Léon S. Kennedy court après elle, Ben Bertolucci refusant de les suivre s'enferme dans sa cellule. Léon S. Kennedy entre dans le réseau d'égouts sous la ville, au sein de l'usine de traitement des eaux. 

Claire Redfield retrouve Marvin Branagh en pleine transformation. Elle l'abat rapidement. Elle retourne près de l'hélicoptère et le fait exploser afin d'accéder au bureau derrière. Le corps de la fille du maire est étendue sur le bureau, blessée par balle à l'abdomen. Derrière; se trouve Brian Irons, le Capitaine de Police. Il déclare qu'elle a été attaquée par un zombie, qu'elle devrait ressusciter d'ici une heure à moins de la décapiter ou de lui mettre une balle dans la tête pour stopper la transformation. Il demande à Claire Redfield de le laisser seul. Dans la pièce à côté, Claire Redfield entent des bruis de pas, elle trouve la petite fille accroupie dans le noir, qui se nomme Sherry Birkin. Ses parents travaillent à l'usine pharmaceutique d'Umbrella, sa mère lui a demandé d'aller au commissariat au début de la contamination afin qu'elle soit en sécurité. Depuis son arrivée, Sherry Birkin entend la voix de son père dans le bâtiment et le cherche, en vain. Soudain, un rugissement affreux retentit, Sherry Birkin a peur et s'enfuit. Claire Redfield retourne dans le bureau du Capitaine de Police, il a disparu emportant la fille avec lui, elle trouve son journal qui laisse entendre sa dépravation et ses trahisons. Elle entend Brian Irons crier, elle le retrouve alors qu'il est attaqué par une créature mutante. Enragé, il dénonce la personne à l'origine de la destruction de sa ville, William Birkin. Claire Redfield comprend le lien de parenté entre William Birkin et Sherry Birkin. Brian Irons explose, une créature sort de sa poitrine et s'échappe par une trappe. Claire Redfield suit la créature qui finit par se transformer en un bébé monstre horrible qui se prépare à l'attaquer, mais Claire Redfield s'en débarrasse rapidement pour retrouver Sherry Birkin au premier étage. 

Léon S. Kennedy est de retour dans le commissariat, à la recherche des clefs pour s'échapper. Faute de clefs, il trouve tombe sur le Tyran. Après l'attaque, il entend Ben Bertolucci hurler, il se précipite vers la prison pour tenter de le sauver, mais il est trop tard. Il remet avant de mourir à Léon S. Kennedy un document faisant état du rôle du capitaine dans la conspiration gouvernementale et de la présence d'un espion au sein d'Umbrella qui souhaite voler les recherches sur le virus. 

Léon S. Kennedy et Claire Redfield se rendent dans les égouts. Sherry Birkin est enlevée par la créature combattue par Léon S. Kennedy. Claire Redfield part à sa recherche mais tombe sur sa mère, Annette Birkin, la femme de William Birkin. William Birkin est un chercheur qui a travaillé sur le virus G. Face à des agents d'Umbrella qui ont tenté de s'emparer du virus, il s'est injecté sur lui-même le mutagène et s'est donc transformé en un monstre nommé G-Type puis a poursuivi les assaillants afin de se venger. Il a détruit les échantillons volés, les rats ont été infectés et ont ensuite répandu le virus dans toute la ville. Lorsqu'un G-Type est infecté, il cherche à se reproduire en injectant son embryon, raison pour laquelle William Birkin tente de retrouver Sherry Birkin pour la contaminer. 

Claire Redfield retrouve Sherry Birkin inconsciente, à proximité d'un embryon de la créature. Ada Wong poursuit Annette Birkin. Ada Wong indique être à la recherche de son fiancé. Annette Birkin comprend alors qu'elle parle de John Clémens, un scientifique du laboratoire du manoir. Elle lui indique qu'il s'est transformé en zombie et qu'il est mort lors de la destruction du manoir. Annette Birkin remarque le médaillon de Sherry Birkin autour de son cou et devient subitement agressive. Le médaillon renforme un échantillon du virus G. Annette Birkin croisera Léon S. Kennedy et lui indiquera qu'Ada Wong est une espionne qui travaille pour le compte d'Umbrella et qu'elle se sert de lui pour voler le virus G. 

Désormais, Léon S. Kennedy et Claire Redfield cherchent à soigner la petite Sherry Birkin afin de s'échapper de cet enfer. Mister X les retrouve, il projette Ada Wong qui meurt de ses blessures. William Birkin arrive à son tour pour lancer une attaque, il touche sa femme Annette Birkin. Grièvement blessée, elle donne les instructions à Claire Redfield pour créer un antidote pour sa fille. Claire Redfield et Léon S. Kennedy parviendront finalement à créer l'antidote pour sauver Sherry Birkin puis, après avoir vaincu les deux monstres, s'échapper à bord d'un train avant la destruction du laboratoire.