外在環境對於生物分子的結構動態影響是此研究計畫的重點。例如,生物分子的結構或是運動模式會因為光學激發、溫度變化、酸鹼度、或是電場效應而改變,這些分子的改變量相對應於環境變化量呈現複雜的關係。利用這些相對的變化,可以推測出不同生物分子的各項物理、化學特性,進而瞭解如何以環境因素來控制目標分子。例如,研究如何將生物分子在氣相中進行快速且有規則的裂解,可以幫助結構鑑定。
我們以質譜技術為基底,並引入雷射激發、分子碰撞等技術,來研究生物分子複和體的解離能。配合量子力學計算各項能量與解離特性,許多複和體的化學性質都可以很詳細地被研究出來。這些技術以往都只適用於小分子系統,通常都侷限在分子量在 150 amu 以下的樣品。對於大型的生物分子,我們的研究範圍已經能夠擴大近一個數量級以上。