L’organo decisionale della Cooperativa Pegaso è il Consiglio di Amministrazione (CDA), che attua le direttive dell’assemblea.
La Direzione Generale, composta da membri del CDA e non, coordina i servizi attraverso un dialogo costante con i responsabili.
Il Presidente Andrea Cristalli ha deleghe finanziarie, rappresenta la cooperativa e coordina tutte le attività, affiancato dal Vicepresidente Niccolò Balducci.
I Responsabili di Servizio sono anche referenti operativi.