壹、課程簡介
精準醫療 Precision Medicine
根據個體差異(snp),施以個人化的醫療措施。例如:將腫瘤細胞進行基因定序,分析,對病患對症下藥。同時,預測疾病風險,將低患病機率。
人類基因計畫 Human Genome Project
人類基因體的定序以「人類基因體計畫」為名正式開始於1990年,此計畫是由大學研究機構的科學家們在跨國性政府資助下成立,總共涉及6個國家的20家大型定序中心以及著力於一些小型計畫的其他實驗群。
在人類基因體定序於2003年大致完成之後,每一染色體的序列被仔細分析並描述於一系列的論文。
本次課程實驗為DNA萃取與qPCR及酒精代謝檢測。
貳、實驗樣本與器材
口腔棉棒
Eppendorf
室溫PBS
Proteinase K
Lysis Buffer
100%EtOH
Spin Column
GW Buffer
Wash Buffer
Elution Buffer
參、實驗原理
SYBR Green I是與雙股DNA的minor groove結合釋放出螢光,因此在PCR過程中可在每一cycle的extension步驟結束時測量螢光的強弱,就可知每PCR cycle中產生了多少PCR product。
肆、實驗步驟
Sample Preparation
取1個Eppendorf,加入1 ml PBS備用。
使用1支口腔棉棒,分別刮取兩側臉頰內口腔黏膜。
浸入PBS中用力攪拌30秒以上 → 取出丟棄。
離心:5000g;5min。
抽除上清液(保留沉澱細胞)
以200μl PBS將沉澱細胞重新懸浮。
Lysis
加入20μl Proteinase K
加入200μl BG Buffer 混合均勻
放入60°C 乾浴中15min → 離心把蓋子上的液體去除(期間每4分鐘vortex混合均勻一次)
DNA Binding
加入200μl 100% EtOH混合均勻
將所有Eppendorf中的液體移入Spin Column
離心:6000g;1min
抽除廢液
Wash
加入400μl Wash Buffer 1
離心:16000g;1min → 抽除廢液
加入750μl Wash Buffer 2
離心:16000g;1min → 抽除廢液
離心:16000g;3min → 將Spin Column套入新的Eppendorf中
DNA Elution
加入50μl Elution Buffer→放入離心機靜置3min
離心:16000g;2min
將處理好的樣品拿去做PCR,加入40X custom SNP ASSAYS
伍、實驗結果
陸、參考資料來源