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Exploring the Biodiversity of Marine Invertebrates from the Shallow to Deep
Prof. Jose Lopez
Halmos College of Arts and Sciences. Northwestern University of Florida, USA
26 Giugno 2024
ore 16.00-17.00
AULA MAGNA
- Seminario ad accesso libero, raggiungibile dal link di partecipazione all'evento (organizzato su piattaforma Zoom)
- registrazione video dell'evento disponibile sul canale YouTube di UPO Dottorato di Ricerca in Chemistry and Biology
Questo intervento descriverà la biodiversità marina legata non solo dal loro habitat condiviso collegato dall'acqua del mare, ma anche dalla loro dipendenza dalla simbiosi, che è la coesistenza di più organismi in una singola entità. Le barriere coralline sono un'eccellente vetrina per le interazioni simbiotiche, rappresentano solo una piccola percentuale dell'area totale dell'oceano e tuttavia detengono la maggior parte della biodiversità. Le barriere coralline costruite biologicamente dipendono dall'accumulo paziente e costante di vita degli invertebrati. Al contrario, i regni pelagici degli oceani profondi rappresentano gli habitat più vasti del pianeta, sono stati a malapena studiati e quindi probabilmente produrranno anche grandi riserve di biodiversità. La ricerca del Prof. Jose Lopez si basa su molti di questi punti, utilizzando i moderni metodi di "-omica" molecolare. Ha applicato la genomica molecolare per caratterizzare diversi sistemi marini: confini di specie fratelli nei coralli chiave (Orbicella) e comunità simbiotiche in spugne, altri invertebrati e rane pescatrici. Il valore e l'efficacia dell'applicazione di tecniche genomiche per caratterizzare la biodiversità marina possono essere esemplificati nell'attuale progetto Aquatic Symbiosis Genome accessibile al seguente link:
https://www.sanger.ac.uk/collaboration/aquatic-symbiosis-genomics-project.Il seminario è promosso dal Prof. Francesco Dondero (francesco.dondero@uniupo.it). LOCANDINA SEMINARIO DiSIT 26-06-2024
https://www.sanger.ac.uk/collaboration/aquatic-symbiosis-genomics-project.Il seminario è promosso dal Prof. Francesco Dondero (francesco.dondero@uniupo.it). LOCANDINA SEMINARIO DiSIT 26-06-2024
Genomics and Biodiversity tales: a decade of comparative genomics research on Brazilian wildlifeg
Prof. Francisco Prosdocimi
Universidade Federal do Rio de Janeiro, RJ, Brazil
04 Giugno 2024
ore 16.00-17.00
AULA 204
- Seminario ad accesso libero, raggiungibile dal link di partecipazione all'evento (organizzato su piattaforma Zoom)
- registrazione video dell'evento disponibile sul canale YouTube di UPO Dottorato di Ricerca in Chemistry and Biology
Durante la conferenza, il professor Francisco illustrerà i 13 anni di ricerche innovative condotte presso il "Laboratorio di Genomica e Biodiversità" dell'Università Federale di Rio de Janeiro. La sua presentazione sarà incentrata sull'affascinante biodiversità molecolare presente in uno dei Paesi con la maggiore biodiversità al mondo: Brasile. Il professor Francisco e il suo gruppo di ricerca hanno dedicato i loro sforzi a svelare gli intricati genomi di vari organismi della fauna e della flora brasiliana. Utilizzando tecniche all'avanguardia nel sequenziamento dei genomi, i ricercatori hanno sequenziato con successo diversi genomi mitocondriali di animali e piante, insieme a nuovi strumenti bioinformatici sviluppati per svelare le loro sequenze e fornire informazioni evolutive. Questi risultati hanno migliorato la nostra comprensione della biologia evolutiva di cladi animali e vegetali distinti, unici in Brasile e nelle Americhe. Utilizzando metodi innovativi di inferenza ancestrale, hanno fatto luce sulle origini delle tartarughe nel Giurassico, strettamente legate all'epoca della scissione di Pangea. Inoltre, l'utilizzo di approcci ddRNA-seq ha permesso di osservare l'affascinante evoluzione di nuovi meccanismi di impollinazione nelle bromeliacee. Attraverso un'analisi approfondita dei genomi dei pappagalli, il team di ricerca ha scoperto nuovi geni associati alla longevità e alla cognizione. Inoltre, il loro lavoro sulla filogenomica degli uccelli ha contribuito a far progredire la nostra comprensione dell'albero evolutivo completo degli uccelli. Attualmente, il suo team sta per completare l'analisi completa dell'intero genoma della "Banisteriopsis caapi" e della "Psychotria viridis", due piante maestre utilizzate nella preparazione della “ayahuasca", un infuso psichedelico ed enteogeno radicato nelle tradizioni amerindie. Sfruttando i long reads del sequenziamento PAC-BIO, questi ricercatori brasiliani stanno spingendo i confini della ricerca genomica, fornendo cromosomi completi per questi esemplari particolari, da telomero a telomero (T2T). Questa conferenza promette di essere un viaggio attraverso le recenti scoperte e conquiste nel campo della genomica, della biodiversità e della biomedicina.Il seminario è promosso dal Prof. Francesco Dondero (francesco.dondero@uniupo.it). LOCANDINA SEMINARIO DiSIT 04-06-2024
Biodiversity Identification at Scale in a Large Hydroelectric Reservoir Using eDNA and Metabarcoding
Prof. Mauro Rebelo
Universidade Federal do Rio de Janeiro, RJ, Brazil
09 Maggio 2024
ore 14.30-15.30
AULA 204
- Seminario ad accesso libero, raggiungibile dal link di partecipazione all'evento (organizzato su piattaforma Meet)
Identifying biodiversity remains an unresolved challenge as traditional taxonomic methods fail to scale effectively. This seminar presents innovative DNA-based methodologies, specifically environmental DNA (eDNA) and metabarcoding, as scalable alternatives to conventional approaches. Although these methods deviate from traditional taxonomy by not always providing species-specific names, they offer a substantial opportunity to catalog biodiversity comprehensively. Our research established a robust biodiversity baseline in an 800 km² hydroelectric reservoir, utilizing principal component analysis (PCA), discriminant analysis of principal components (DAPC), and rarefaction and saturation curves to ensure data representativeness. This baseline is currently being replicated in two additional reservoirs, each covering 1000 km². Furthermore, we conducted the largest eDNA sampling campaign along the Brazilian coast, spanning from Recife to Arvoredo over 45 days and collecting nearly 100 samples. Preparations are underway for an unprecedented scale of biodiversity monitoring in an oil field, involving over 1000 eDNA samples. Our findings highlight the reliability and cost-effectiveness of eDNA and metabarcoding, setting the stage for a new era in ecological research that is more robust and scalable.Il seminario è promosso dal Prof. Francesco Dondero (francesco.dondero@uniupo.it). LOCANDINA SEMINARIO DiSIT 09-05-2024
Sequencing All Life for the Future of Life: the Darwin Tree of Life Project and its Contributions to Molecular Evolution and Conservation
Prof. Marcela Uliano da Silva
Wellcome Sanger Institute, Cambridge, UK & Nord University, Bodø, Norway
02 Maggio 2024
ore 14.30-15.30
AULA 204
- Seminario ad accesso libero, raggiungibile dal link di partecipazione all'evento (organizzato su piattaforma Zoom)
- registrazione video dell'evento disponibile sul canale YouTube di UPO Dottorato di Ricerca in Chemistry and Biology
The Darwin Tree of Life Project (DToL) is part of a global effort under the umbrella of the Earth BioGenome Project to sequence all complex life on Earth. It is delivering at-scale genome sequences of unprecedented quality for all eukaryotes of Britain and Ireland, which holds substantial biodiversity, encompassing more than 70,000 eukaryotic species corresponding to over 40% of documented families. The genomes are 100% public for the use of all. DToL is a massive collaborative enterprise with scientists and institutions enabling sample collection, taxonomy assignment, genome sequencing and assembly. In this talk you will hear about our ‘genome engine’ that has already produced more than 1395 genomes, and the scientific innovations that are coming out of these genomes.Il seminario è promosso dal Prof. Francesco Dondero (francesco.dondero@uniupo.it). LOCANDINA SEMINARIO DiSIT 02-05-2024
Piante, ambiente e cambiamenti climatici: vivere senza acqua dolce
Prof.ssa Cristina Pagliano
Dipartimento di Scienze e Innovazione Tecnologica (DiSIT)
05 Aprile 2024
ore 15.00-17.00
AULA 207
Le piante glicofite ed alofite, due diverse strategie per vivere in ambienti poveri di acqua dolce o in ambienti con soltanto disponibilità di acqua salata. La straordinaria capacità di adattamento delle piante ai cambiamenti climatici che comportano siccità e salinizzazione del suolo.
Membrane tilacoidali: dalla struttura e funzione alle applicazioni biosensoristiche in campo ambientale
Prof.ssa Cristina Pagliano
Dipartimento di Scienze e Innovazione Tecnologica (DiSIT)
05 Aprile 2024
ore 9.00-11.00
AULA 301
- Seminario ad accesso libero, raggiungibile dal link di partecipazione all'evento (organizzato su piattaforma Meet)
Le membrane tilacoidali sono il sito delle reazioni fotosintetiche dipendenti dalla luce, dove avviene il trasporto elettronico fotosintetico. Il fotosistema II è un enzima multimerico incorporato nelle membrane tilacoidali che, nelle reazioni fotosintetiche dipendenti dalla luce, ossida l'acqua, trasferendo gli elettroni estratti a molecole di plastochinone coinvolte nel trasporto elettronico fotosintetico. Nella prima parte, ci concentreremo sui determinanti molecolari dell'impilamento delle membrane tilacoidali nei grana delle piante e sulla loro dinamica indotta da variazioni di luce decifrate utilizzando analisi proteomiche e di microscopia crioelettronica. Nella seconda parte, ci concentreremo su un biosensore elettrochimico amperometrico che incorpora membrane tilacoidi per il rilevamento di erbicidi fotosintetici.
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