Argomenti previsti in questo laboratorio: 24 ore totali, 12 Incontri, 5 Moduli tematici (per ora):
[modulo 1] Argomenti: Genomica: cos’è? come nasce? Risorse utili in rete.
[modulo 2] Argomenti: ABC di Shell scripting
[modulo 3] Argomenti: Analisi di espressione differenziale: scopi e modalità
[modulo 4] Argomenti: Esplorazione dei genomi: UCSC genome browser
[modulo 5] Argomenti: Analisi di reti in ambito genomico: esempi di applicazione
Obiettivi formativi di questo ciclo di attività
Lo studente che abbia frequentato questo ciclo di attività dovrebbe:
Descrivere cos'é la Bioinformatica genomica: ambiti conoscitivi, scopi e modalità operative
Descrivere diversi tipi di dati oggetto di studio della bioinformatica
Conoscere le basi del linguaggio di programmazione bash
Elencare e saper usare alcune banche dati e risorse di interesse bioinformatico
Visualizzare in un browser una specifica regione del genoma umano
Saper scegliere e interrogare le risorse in rete più adatte a risolvere problemi ricorrenti (esempio: mappatura tra identificativi diversi)
Descrivere gli scopi e le modalità generali di una analisi di espressione genica differenziale
Descrivere almeno due esempi di rete biologica di interazioni funzionali
Modalità di valutazione
il superamento con profitto di questo laboratorio verrà valutato mediante test scritto (domande) e breve colloquio orale di commento al test svolto
Sia all'orale che allo scritto, le domande verteranno su argomenti trattati in questo corso, secondo la tipologia di piccoli problemi, sfide e domande che verranno via via incontrate nello svolgimento delle attività a lezione
Contatti
Teresa Colombo, Consiglio nazionale delle Ricerche (CNR)
Istituto di Biologia e Patologia Molecolari (IBPM - CNR)
email: teresa.colombo@cnr.it
