El Programa Curricular Maestría en Psicología fue creado mediante el Acuerdo 008 de 2001 del Consejo Académico, y la apertura de su plan de estudios fue aprobada mediante Acuerdo 009 de 2001 de este mismo órgano. El programa vigente actualmente, aprobado mediante Acuerdo 072 de 2008 del Consejo Académico y modificado por el Acuerdo 071 de 2013 de esta misma instancia, es un programa de formación que tiene un alto grado de flexibilidad, es menos escolarizado y ofrece la posibilidad de elegir entre dos planes de estudios: uno en investigación en diversas áreas de la psicología y otro en profundización en psicología clínica. Independientemente del plan de estudios elegido, el programa comprende 61 créditos académicos distribuidos en cuatro semestres y otorga el título "Magíster en Psicología".
Tanto la Maestría en Psicología, plan de estudios de investigación, como el Doctorado en Psicología, tienen las siguientes cuatro líneas de investigación, cada una de las cuales agrupa varias sublíneas.
Esta línea de investigación, agrupa varias sublíneas:
Aprendizaje y Evolución del Comportamiento
Efectos del Estrés Sobre el Aprendizaje con Modelos Experimentales
Elección y Decisión
Métodos e Instrumentos en Ciencias del Comportamiento
Cognición Implícita
Memoria y metamemoria
Esta línea de investigación, agrupa varias sublíneas:
Cognición y Desarrollo Moral
Educación, Cognición Aplicada y Medios
Desarrollo Social en Contextos Adversos
Evaluación y Mejora de Procesos Educativos
Psicología de la Educación y Procesos de Aprendizaje-Enseñanza
Esta línea de investigación, agrupa varias sublíneas:
Transcurso de la Vida, Procesos Socioafectivos y Salud Mental Pública
Socialización y Crianza
Diversidad, Género e Inclusión (Disponible sólo para el nivel de Maestría)
Esta línea de investigación, agrupa varias sublíneas:
Neuropsicología clínica y cognoscitiva
Psicología Clínica, Bienestar y Procesos Relacionales (Disponible sólo para el nivel de Maestría)
Enfoque Psicosocial de la Relación Salud-Trabajo (Disponible sólo para el nivel de Maestría)
Psicología Jurídica
Psicología de la Salud
Psicología Organizacional Y Salud En El Trabajo