Seminarios

Lugar/Horario: Salón 101, Ed. 6D (planta baja), 5:00 – 6:30 pm.

Cualquier cambio al programa se notificará con tiempo.

13/02/2024 -- Dr. Marco Ramos "Bienvenida, Proyectos, y Organización"

27/02/2024 -- QFB. Alejandra Chávez "Artículo Científico"

Biochemical characterisation of glycosylated and deglycosylated forms of phytase from Cronobacter turicensis expressed in Pichia pastoris.

Fuente: https://doi.org/10.1016/j.enzmictec.2022.110136 

Resumen:  En este artículo se reporta la expresión heteróloga en Pichia pastoris y la caracterización bioquímica de formas glicosiladas y desglicosiladas de una nueva fitasa de Cronobacter turicensis. Mediante mutagénesis dirigida a sitio, los investigadores construyeron y caracterizaron mutantes con sitios de N-glicosilación suprimidos (N136, N171, y N202). Los resultados demuestran que la desglicosilación modifica la resistencia a la proteólisis, al pH ácido, y a la temperatura, pero no afecta a otras propiedades. Además, indican que los cambios observados dependen del sitio de N-glicosilación modificado: la mutación del residuo N202 (situado en una región altamente flexible) tuvo el mayor efecto. De manera global, los investigadores resaltan que la enzima completamente glicosilada exhibe mayor resistencia a proteasas (pepsina y tripsina) y estabilidad a pH ácido y alta temperatura. Por lo anterior, concluyen que la N-glicosilación producida en P. pastoris aumentó las propiedades bioquímicas de la fitasa recombinante.

12/03/2024 -- M.C. Pablo Madero "Artículo Científico"

Multiple redox switches of the SARS-CoV-2 main protease in vitro provide opportunities for drug design.

Fuente: https://doi.org/10.1038/s41467-023-44621-0

Resumen: En este artículo se estudió a la proteasa principal del SARS-CoV-2, Mpro (una cisteína proteasa con funciones esenciales en la replicación viral, validada como diana terapéutica), la cuál está sujeta a regulación redox y cambia reversiblemente entre el dímero (enzimáticamente activo) y el monómero (inactivo) mediante modificaciones redox de residuos de cisteína. Los investigadores proponen que un cambio disulfuro-ditiol entre la cisteína catalítica (Cys145) y la cisteína 117, y la generación de un puente alostérico cisteína-lisina-cisteína (SONOS) son necesarios para la estabilidad en condiciones de estrés oxidativo. Además, identificaron moléculas reactivas homo- y heterobifuncionales que mimetizan el cambio redox e inhiben la actividad de Mpro. Por lo tanto, como los sitios redox propuestos se conservan en proteasas de otros coronavirus (estos son, MERS-CoV y SARS-CoV), concluyen que tienen potencial como sitios susceptibles a fármacos.

02/04/2024 -- M.C. Celina Terán (LNMA, Instituto de Biotecnología - UNAM, México) "Estudio nanométrico de la estructura del citoesqueleto de actina en el flagelo del espermatozoide de ratón empleando una estrategia de imagenología de alta resolución"

Transmitido vía Google Meet (https://meet.google.com/whn-hcoz-puy).

16/04/2024 -- Dra. Rosy Mares "Avance de Proyecto"

La quitinasa amibiana EhCHT1 desde la perspectiva del Grupo de Investigación de Biotecnología y Biociencias de la FCQI-UABC.

Resumen: Durante la charla de seminario, la Dra. Rosy Mares realizó en recorrido histórico sobre los avances en el estudio de la quitinasa amibiana (EhCHT1), desde la clonación molecular y expresión soluble en el periplasma bacteriano hasta la purificación y caracterización bioquímica de la proteína recombinante. De manera sencilla, resaltó las contribuciones de varios ex-participantes del proyecto que dejaron una muestra de su pasión por la ciencia, y algunas anécdotas compartidas en la vida académica, concluyendo con resultados que aportaron datos para varios artículos científicos. En la parte central de su exposición, enfatizó los resultados recientes de la expresión del dominio catalítico de EhCHT1 en superficie bacteriana como estrategia para el desarrollo de un sistema de biodegradación de quitina (y algunos de sus derivados) basado en un biocatalizador de célula entera con actividad endoquitinolítica. Además, expusó los avances en el diseño una versión mejorada de la EhCHT1 mediante ingeniería de disulfuros. Finalmente, aunque los resultados aún no son concluyentes, destacó que una variante que exhibe un enlace disulfuro adicional tiene potencial para mejorar la estabilidad térmica de la proteína sin afectar la función enzimática.

30/04/2024 -- pLBG. Jesua Ramos "Artículo Científico"

High-Yield Expression and Purification of Scygonadin, an Antimicrobial Peptide, Using the Small Metal-Binding Protein SmbP.

Fuente: https://www.mdpi.com/2076-2607/12/2/278

Resumen: En este artículo los autores proponen una alternativa para producir péptidos antimicrobianos activos. Mediante ingeniería genética, fusionaron a SmbP (una proteína pequeña de unión a metales) con el péptido antimicrobiano Escigonadina y así favorecer la expresión soluble en el citoplasma de Escherichia coli y la posterior purificación mediante cromatografía de afinidad a metales. Como estrategia metodológica, se diseñaron dos construcciones: una monomérica (SmbP-Escigonadina) y otra conteniendo una repetición en tándem (SmbP-Escigonadina-FLEX-Escigonadina), usando como sistema de expresión al vector comercial pET30a(+). Ambas construcciones se expresaron en E. coli SHuffle T7 y se purificaron mediante cromatografía de afinidad a níquel. La actividad antimicrobiana se determinó usando a Staphylococcus aureus como bacteria susceptible. Los resultados obtenidos les permitieron concluir que SmbP (como proteína de fusión) y la cepa SHuffle (como biofábrica) funcionaron de manera apropiada para producir y purificar a Escigonadina como péptido antimicrobiano activo.

07/05/2024 -- M.C. Pablo Madero "Avance de Tesis"

Estrategias computacionales y experimentales para el desarrollo de sustratos fluorescentes e inhibidores competitivos de enzimas con interés biomédico: la serina proteasa MarP de Mycobacterium tuberculosis como modelo de estudio.

Resumen: Durante la presentación, el M.C. Pablo Madero expuso los fundamentos teóricos y prácticos que respaldan su proyecto de tesis doctoral. De manera breve, recapituló los antecedentes que apoyan la hipótesis de trabajo. Enseguida, explicó los detalles considerados para el diseño in silico de un sustrato fluorescente específico para la serina proteasa MarP de M. tuberculosis, basado en la tecnología FRET y usando dos proteínas fluorescentes: CyPet y YPet, separadas por un linker que contiene un octapéptido identificado en RipA (sustrato natural de MarP), el cual se nombró CRY. Así mismo, describió los retos que se presentaron durante el desarrollo de la estrategia experimental para la producción de CRY recombinante y la manera como logró superarlos. Dentro de los avances más relevantes, destacó la implementación de un bioensayo para valorar la actividad proteolítica de esta enzima micobacteriana. Finalmente, discutió el impacto de los componentes y la optimización del método fluorométrico propuesto para valorar el efecto de inhibidores sobre la función enzimática de la serina proteasa MarP de M. tuberculosis.

21/05/2024 -- QFB. Alejandra Chávez "Avance de Tesis"

Análisis biocomputacional y mutagénesis dirigida a sitio como estrategia para recuperar la actividad fosfatasa/fitasa de EhHAPp49, una enzima amebiana atípica.

Resumen: Durante la presentación, la QFB. Alejandra Chávez expuso los aspectos teóricos que respaldan su proyecto de tesis de maestría. De manera breve, repasó los antecedentes que apoyan la hipótesis de trabajo, enfatizando las preguntas que surgieron a partir de un estudio previo. Enseguida, explicó los detalles bioinformáticos considerados para el diseño y generación de dos mutantes sencillas (W48A y Y242A) y una doble (W48A/Y242A) de la proteína EhHAPp49, las cuales tienen como objetivo aumentar la apertura de entrada del sustrato y ampliar el bolsillo catalítico de esta enzima amibiana. En sus avances, expuso los resultados que indican la obtención exitosa de todas las mutantes mediante una estrategia experimental de mutagénesis dirigida a sitio. Además, describió los retos presentados durante los procesos de purificación de la mutante sencilla Y242A y la doble (W48A/Y242A), las cuales muestran bajo rendimiento, y planteó las metodologías que está implementando para superarlos. Como avance relevante, destacó que los resultados preliminares sugieren que la mutante W48A exhibe una mayor actividad pirofosfatasa, comparada con la enzima silvestre, aunque no muestra cambios (aparentes) en otras actividades catalíticas.

04/06/2024 -- M.C. Alexis Minchaca (Children's Cancer Institute, Australia) "Tema Libre" 

Será transmitido vía Google Meet (https://meet.google.com/whn-hcoz-puy).