Página Web del Grupo de Investigación en Biotecnología y Biociencias de la FCQI (UABC)
Profesores-Investigadores
Dr. Marco Antonio
Ramos Ibarra
Dra. Rosa Elena
Mares Alejandre
Dra. Patricia Lilián Alejandra
Muñoz Muñoz
Dr. Samuel Guillermo
Meléndez López
Profesores Asociados
M.C. Guadalupe Alejandra Chávez Meléndrez
Profesora Asociada
Estrategias computacionales y experimentales para el estudio de fosfatasas de interes biomédico y biotecnológico.
PUBLICACIONES
Mares-Alejandre RE, Chávez-Meléndrez GA, Muñoz-Muñoz PLA, Madero-Ayala PA; Meléndez-López SG, Ramos-Ibarra MA. Structural Analysis of Histidine Phosphatase (HP)-like Proteins from the Pathogen Entamoeba histolytica: A Bioinformatics Approach to Acid Phosphatase/Phytase Homologs. Manuscript in preparation.
Estudiantes
M.C. Pablo Alfonso Madero Ayala
Estudiante de Doctorado en Ciencias
TESIS: Estrategias computacionales y experimentales para el desarrollo de sustratos fluorescentes e inhibidores competitivos de enzimas con interés biomédico: la serina proteasa MarP de Mycobacterium tuberculosis como modelo de estudio.
PUBLICACIONES
Mares-Alejandre RE, Chávez-Meléndrez GA, Muñoz-Muñoz PLA, Madero-Ayala PA; Meléndez-López SG, Ramos-Ibarra MA. Structural Analysis of Histidine Phosphatase (HP)-like Proteins from the Pathogen Entamoeba histolytica: A Bioinformatics Approach to Acid Phosphatase/Phytase Homologs. Manuscript in preparation.
Madero-Ayala PA, Mares-Alejandre RE, Muñoz-Muñoz PLA, Meléndez-López SG, Ramos-Ibarra MA. Structural insights from in silico analysis of Fowlerpain-1, a cysteine protease secreted by Naegleria fowleri, and perspectives for stefin-mediated inhibition. Pharmaceuticals. Submitted; Under Review.
Muñoz-Muñoz PLA, Terán-Ramírez C, Mares-Alejandre RE, Márquez-González AB, Madero-Ayala PA, Meléndez-López SG, Ramos-Ibarra MA. Surface Engineering of Escherichia coli to Display Its Phytase (AppA) and Functional Analysis of Enzyme Activities. Curr Issues Mol Biol. 2024; 46(4): 3424-3437. DOI: 10.3390/cimb46040215. PMID: 38666945.
Madero-Ayala PA, Mares-Alejandre RE, Ramos-Ibarra MA. In Silico Structural Analysis of Serine Carboxypeptidase Nf314, a Potential Drug Target in Naegleria fowleri Infections. Int J Mol Sci. 2022; 23(20): 12203. DOI: 10.3390/ijms232012203. PMID: 36293059.
Madero-Ayala PA, Mares-Alejandre RE, Ramos-Ibarra MA. A Molecular Dynamics Approach on the Y393C Variant of Protein Disulfide Isomerase A1. Chem Biol Drug Des. 2020; 96(6): 1341-1347. DOI: 10.1111/cbdd.13700. PMID: 32352225.
QFB. Miriam Valenzuela Becerra
Estudiante de Maestría en Ciencias
TESIS: Producción recombinante y caracterización funcional de NfPDIA1L, una proteína de Naegleria fowleri parecida a disulfuro oxidorreductasas tipo PDIA1.
pQFB. Jhonatan Hazael Osuna Leal
Estudiante de Licenciatura
TESIS: Análisis funcional de un biocatalizador de células completas que exhibe actividad endoquitinolítica: aumento de la estabilidad estructural mediante ingeniería de disulfuros y efecto de la temperatura sobre la función proteica.
pQFB. Sahín Zamira Flores Valdez
Estudiante de Licenciatura
TESIS: Expresión de EhCP1 en el periplasma bacteriano, efecto del ambiente redox sobre su actividad proteolítica y plegamiento oxidativo asistido por la oxidorreductasa EhPDIp38.
pLBG. Eveling Amelia Díaz Lugo
Estudiante de Licenciatura
Prácticas Profesionales: Evaluación de la actividad proteolítica de la proteasa MarP de Mycobacterium tuberculosis usando una variante de GFP (split GFP) como sustrato fluorescente para emisión Switch-On.
pQFB. Aylin Itziar Chávez Jaimes
Estudiante de Licenciatura
Ayudantía en Investigación: Activación del sistema Ire1-Hac1 y expresión de LacZ como gen reportero del mecanismo de estrés-respuesta a proteínas desplegadas en el reticulo endoplásmico de Saccharomyces cerevisiae.
Alumni
Doctorado
En construcción. Disculpe las molestias.
Maestría
Guadalupe Alejandra Chávez Melendrez. Análisis Biocomputacional y Mutagénesis Dirigida como Estrategia para Recuperar la Actividad Fitasa/Fosfatasa Ácida de EhHAPp49, una Enzima Amibiana Atípica. Maestra en Ciencias (UABC-Tijuana). Junio de 2025.
Licenciatura
Cristian Osvaldo Armenta Montoya. Producción recombinante de alfa-sinucleína de humano e implementación de un bioensayo para determinar microagregados proteicos. Químico Farmacobiólogo (UABC-Tijuana). Marzo de 2025.
Sarahí Jesua Ramos Melchor. Producción recombinante y caracterización funcional de una proteína amebiana parecida a disulfuro oxidorreductasas del tipo P4HB/PDIA1. Licenciatura en Biotecnología Genómica (UAS-Culiacán). Noviembre de 2024.
Ayudantías
Enoc Guevara Benítez. Caracterización funcional de la actividad oxidasa de enzimas del tipo PDIA1 mediante replegamiento oxidativo de lisozima. Químico Farmacobiólogo (UABC-Tijuana). Ayudante de Investigación, 2025-1.
Daniela Nohemí Menchaca Rodríguez. Desarrollo de un sistema bacteriano para la producción recombinante de una PETasa y evaluación de su actividad enzimática sobre sustratos solubles. Químico Farmacobiólogo (UABC-Tijuana). Ayudante de Investigación, 2025-1.
Jese Francisco Machuca Guerrero. Mejoramiento de la estabilidad de un biocatalizador de células completas con actividad endoquitinasa mediante ingeniería de enlaces disulfuro. Químico Farmacobiólogo (UABC-Tijuana). Ayudante de Investigación, 2024-2.
Itzel Salinas Hernández. Evaluación de la dependencia del estado oxidativo sobre la actividad cisteína proteasa de la enzima amibiana EhCP1. Químico Farmacobiólogo (UABC-Tijuana). Ayudante de Investigación, 2024-2.
Sarahí Jesua Ramos Melchor. Producción recombinante y caracterización funcional de una proteína amebiana parecida a disulfuro oxidorreductasas del tipo P4HB/PDIA1. Licenciatura en Biotecnología Genómica (UAS-Culiacán). Practicas Profesionales, 2024-1.
Eveling Amelia Diaz Lugo. Producción recombinante de un nanobody contra GFP y análisis de expresión mediante inmunoreconocimiento. Licenciatura en Biotecnología Genómica (UAS-Culiacán). Verano de Investigación, 2024-1.