¿Quienes Somos?

M.C. Alejandra Guadalupe Chávez Meléndrez

Profesora Asociada

Estrategias computacionales y experimentales para el estudio de fosfatasas de interes biomédico y biotecnológico.

Dr. Pablo Alfonso Madero Ayala

Profesor Asociado

Estrategias computacionales y experimentales para el desarrollo de sustratos fluorescentes e inhibidores competitivos de enzimas con interés biomédico

QFB. Miriam Valenzuela Becerra

Estudiante de Maestría en Ciencias

TESIS: Producción recombinante y caracterización funcional de NfPDIA1L, una proteína de N. fowleri similar a las disulfuro oxidorreductasas del tipo PDIA1.

Descripción breve: Esta tesis se enfoca en la  caracterización de la NfPDIA1L recombinante, el análisis de sus propiedades y la evaluación de su función en el plegamiento oxidativo de proteínas. Asimismo, se pretende comprender la operatividad de esta enzima PDI en la biología y la patogenicidad de Naegleria fowleri. El objetivo es aportar conocimiento sobre su relevancia biotecnológica o biomédica.

QFB. Silvia Berenice Santana Anguiano

Estudiante de Maestría en Ciencias

Tesis: Desacoplamiento del compromiso estabilidad actividad en la quitinasa amibiana (EhCHT1c): Rediseño racional de nodos estructurales críticos para la optimización de biocatalizadores térmicamente robustos

Descripción breve: Esta tesis busca mejorar la termoestabilidad de la quitinasa EhCHT1c sin comprometer su actividad catalítica mediante ingeniería racional de proteínas. Integrará análisis in silico, mutagénesis dirigida, expresión heteróloga y caracterización biofísica y cinética para generar variantes estructuralmente robustas, funcionales y con potencial de aplicación como biocatalizadores.

QFB. Carlos Alberto Rodríguez Robles

Estudiante de Maestría en Ciencias

Tesis: Producción heteróloga y replegamiento oxidativo de la neurotoxina Ts1 de Tityus serrulatus mediante coexpresión con disulfuro oxidorreductasas 

Descripción breve: Esta tesis propone optimizar la producción recombinante de la neurotoxina Ts1 de T.  serrulatus mediante la coexpresión de oxidorreductasas en el citosol de Escherichia coli SHuffle. Se evaluará su efecto sobre el plegamiento oxidativo, la solubilidad y el rendimiento proteico, estableciendo una plataforma para producir péptidos ricos en enlaces disulfuro de interés biomédico.

pQFB. Sahín Zamira Flores Valdez

Estudiante de Licenciatura

TESIS: Expresión de EhCP1 en el periplasma bacteriano, efecto del ambiente redox sobre su actividad proteolítica y plegamiento oxidativo asistido por la oxidorreductasa EhPDIp38.

Descripción breve: Esta tesis aborda la expresión de la cisteína proteasa 1 de E. histolytica (EhCP1) en el periplasma bacteriano como estrategia para favorecer su plegamiento oxidativo correcto. Se analizará el efecto del ambiente redox sobre su estabilidad estructural y su actividad catalítica. Además, se evaluará el papel de EhPDIp38 en el plegamiento de EhCP1. El objetivo es comprender los mecanismos bioquímicos y biofísicos que regulan su funcionalidad.

pQFB.  Michel Alejandra Martínez Marroquín

Estudiante de Licenciatura

Tesis: Producción de un biocatalizador que exprese a una PETasa en superficie bacteriana y análisis de la actividad enzimática en célula completa o fracciones membranosas.

Descripción breve: Esta tesis se enfoca en la producción de un biocatalizador que exprese una PETasa, enzima que degrada el tereftalato de polietileno, en la superficie bacteriana. Se evaluará la actividad enzimática (esterasa) tanto en células completas como en fracciones de la membrana externa. El objetivo es explorar su potencial para la degradación de microplásticos y sus aplicaciones biotecnológicas.

pQFB. Alejandro Peinado Ornelas

Estudiante de Licenciatura

Tesis: Producción recombinante y caracterización funcional de una pirofosfatasa amibiana fusionada al dominio Trx-a de EhPDIp38.

Descripción breve: Esta tesis se centra en la caracterización funcional de una pirofosfatasa amibiana (EhIPP), expresada en fase con el dominio Trx-a de la EhPDIp38 como péptido de fusión para mejorar su plegamiento y estabilidad. Se evaluarán las propiedades bioquímicas de EhIPP, incluyendo su actividad y estabilidad, así como su respuesta ante diferentes condiciones fisiológicas experimentales. El objetivo es comprender su función biológica y su potencial de aplicación en el diseño de agentes terapéuticos.

pQFB. Hanssel Ballesteros Colmenares

Estudiante de Licenciatura

Tesis: Expresión de EhHAPp49 en el periplasma bacteriano, efecto del ambiente redox sobre su actividad pirofosfatasa y plegamiento oxidativo asistido por la oxidorreductasa EhPDIp38.

Descripción breve: Esta tesis aborda la expresión de EhHAPp49, una fosfatasa amibiana atípica con actividad pirofosfatasa, en el periplasma bacteriano. Se evaluará la dependencia de la actividad catalítica y de la estabilidad estructural respecto de las condiciones redox. Asimismo, se analizará la operatividad de la enzima EhPDIp38 como asistente en el plegamiento de EhHAPp49. El objetivo es comprender los mecanismos que regulan su funcionalidad y vislumbrar su potencial como diana terapéutica.

pQFB. Jahzyel Moisés Ramírez Medina

Estudiante de Licenciatura

Tesis: Caracterización funcional de un homólogo de BiP/Hsp70 de Entamoeba histolytica: actividad ATPasa y su papel como chaperona molecular.

Descripción breve: Esta tesis aborda la caracterización bioquímica de una BiP amibiana, evaluando su actividad de ATPasa y su función como chaperona. Se usará la GFP desnaturalizada en condiciones ácidas como sustrato modelo, lo que permitirá analizar el plegamiento y la recuperación de la fluorescencia. El objetivo es comprender los mecanismos de proteostasis en este organismo de interés biomédico.

pQFB.  Ana Sofia Pimentel Rivera

Estudiante de Licenciatura

Tesis: Desarrollo de un sistema antimicrobiano basado en el reconocimiento célula–célula mediado por un nanobody anti-GFP acoplado al péptido LL-37.

Descripción breve: Esta tesis propone el desarrollo de un sistema AMC basado en el reconocimiento célula–célula mediante un nanobody anti-GFP acoplado al péptido antimicrobiano LL-37. Se evaluará la capacidad del sistema para dirigir y potenciar la actividad bactericida de manera específica. Asimismo, se analizarán los parámetros de eficiencia, selectividad y estabilidad. El objetivo es desarrollar una estrategia innovadora y prueba de concepto con potencial terapéutico. 

pQFB. Arin Aner Moran Urias

Estudiante de Licenciatura

Tesis: Reposicionamiento in silico de fármacos contra LmxM.31.0660 de Leishmania mexicana mediante modelado estructural, análisis de accesibilidad farmacológica, tamizado virtual y evaluación dinámica

Descripción breve: Esta tesis propone identificar fármacos con potencial de interacción inhibitoria con la proteína LmxM.31.0660 de Leishmania mexicana mediante un enfoque computacional. Se desarrollará un flujo de trabajo integrado que incluirá desde la caracterización de secuencias hasta la evaluación dinámica. El objetivo es generar una prueba de concepto para el reposicionamiento racional de fármacos y la exploración de blancos terapéuticos contra la leishmaniasis.

pQFB. Diana Berenice Pérez Cano

Estudiante de Licenciatura

Tesis: Estandarización y validación analítica de una plataforma de qPCR con SYBR Green I para la cuantificación del gen mcr-1 en matrices líquidas

Descripción breve: Esta tesis aborda la estandarización de un ensayo de qPCR con SYBR Green I para cuantificar el gen mcr-1, con énfasis en efluentes de hospitales y de  plantas de tratamiento de aguas residuales. Se desarrollará un flujo de trabajo que incluirá la verificación de iniciadores, la optimización de las condiciones de amplificación y la evaluación de la especificidad, la sensibilidad, la eficiencia, el rango dinámico y la inhibición por matriz. El objetivo es desarrollar una herramienta molecular reproducible y aplicable para la vigilancia de genes de resistencia antimicrobiana desde un enfoque One Health.

pQFB. Bianca Lizette Caldera Gaucín

Estudiante de Licenciatura

Tesis: Genotipificación del polimorfismo rs2289669 en el gen SLC47A1 (MATE1) mediante qPCR-HRM como herramienta molecular para predecir la respuesta terapéutica a la metformina en pacientes con DMT2.

Descripción breve: Esta tesis propone estandarizar un ensayo qPCR-HRM para genotipificar el SNP rs2289669 del gen SLC47A1, con énfasis en su utilidad para predecir la respuesta terapéutica a la metformina. Se desarrollará un flujo de trabajo que incluirá la verificación de primers, la optimización de la amplificación, el análisis de curvas HRM, la discriminación de genotipos y la validación frente a un método de referencia. El objetivo es desarrollar una herramienta molecular para estudios farmacogenómicos orientados a la medicina de precisión en el manejo de la DMT2.

pQFB. Daryan Alexia Isaza Serrano

Estudiante de Licenciatura

Tesis: 

Descripción breve: 

pQFB. Jennifer López Guzmán

Estudiante de Licenciatura

Tesis: 

Descripción breve: 

pQFB. Carlos  Jahir Contreras Lopez

Estudiante de Licenciatura

Tesis: 

Descripción breve: 

pQFB. Emely Gallardo Anguiano

Ayudante de Investigación

Tesis: Evaluación de la actividad oxidasa e isomerasa de la proteína EhPDIp59, utilizando RNasa A como sustrato modelo.

Descripción breve: Este proyecto propone estudiar la función de EhPDIp59, una proteína disulfuro isomerasa de Entamoeba histolytica, mediante la evaluación de sus actividades oxidasa e isomerasa utilizando RNasa A como sustrato modelo. Se emplearán la proteína recombinante y ensayos bioquímicos para determinar su capacidad de catalizar la formación y el rearreglo de los enlaces disulfuro durante el plegamiento proteico.