Virus yang merugikan dapat menyebabkan manusia, hewan, dan tumbuhan terserang penyakit. 

Virus sulit untuk menginfeksi sel tumbuhan karena dilindungi oleh dinding sel. Gejala penyakit tumbuhan yang disebabkan virus antara lain ukuran tanaman menjadi lebih kurus dan kerdil, timbul bintik atau bercak pada daun, bunga, atau buah dan hasil panen berikutnya.

Beberapa penyakit tumbuhan yang disebabkan oleh virus.

Influenza merupakan penyakit yang dapat menjalar dengan cepat dilingkunagan masyarakat. Penyebab Influenza adalah virus golongan Orthomyxovirus yang berbentuk seperti bola. Virus influenza ditularkan lewat udara dan masuk ke tubuh manusia melalui alat pernafasan. Virus influensa pada umumnya hanya menyerang sistem pernafasan terutama ditandai oleh demam, mengigil, sakit otot dan sakit kepala. Lamanya sakit berlangsung antara 2-7 hari dan biasanya sembuh sendiri. Yang paling penting menghadapi influenza adalah pencegahan dengan cara memberi kekebalan terhadap infeksi virus yang homoloq, kekebalan yang diperoleh melalui vaksin sekitar 70%.

Penyakit flu burung atau flu unggas (Bird Flu, Avian influenza) adalah suatu penyakit menular yang disebabkan oleh virus influenza tipe A dan ditularkan oleh unggas. Virus influenza termasuk famili Orthomyxoviridae.

Campak adalah infeksi saluran pernafasan yang disebabkan oleh virus, penyakit campak mudah menular dan sering menyerang anak-anak, terutama dengan kondisi kurang gizi. Penyakit campak disebabkan oleh virus paramyxovirus yang memasuki tubuh melalui saluran pernapasan bagian atas.

Penyakit cacar air atau yang dikenal dengan varisela biasanya ditandai dengan keluhan tubuh mendadak lemas, tak mau makan, demam, dan gatal-gatal, baru setelah muncul erupsi atau kelainan pada kulit, gejala khas penyakit cacar air mulai jelas. Penyebab cacar air adalah virus varicella-zoster. Virus ini ditularkan melalui percikan ludah penderita, bisa juga melalui kontak langsung dengan cairan dari lepuhan kulit penderita atau secara tidak langsung melalui bendabenda yang terkontaminasi oleh cairan lepuhan penderita. Masa inkubasi penyakit cacar air berlangsung 17-21 hari, pada penderita muda, stadium sebelum muncul kelainan kulit muncul (prodormal) jarang dijumpai.

Hepatitis (pembengkakan hati) disebabkan oleh virus hepatitis. Beberapa virus hepatitis yang telah dikenali adalah virus hepatitis A,B,C,D dan E. Gejala umumnya adalah demam, mual, dan muntah, serta perubahan warna kulit dan selaput lendir terlihat kuning.

Polio (poliomyelitis) disebabkan oleh virus polio. Serangan virus polio menyebabkan lumpuh jika virus menginfeksi selaput otak (meninges) dan sumsum tulang belakang. Virus ini menyerang anak-anak berusia 1-5 tahun. Virus polio dapat hidup di air selama berbulan-bulan, sehingga dapat menginfeksi melalui air yang diminum. Dalam keadaan beku, virus ini dapat bertahan hidup sangat lama. Polio dapat menyebar luas diam-diam karena sebagian besar penderita yang terinfeksi polio virus tidak memiliki gejala sehingga tidak tahu kalau mereka sendiri sedang terjangkit.

Penyakit gondong disebabkan oleh golongan paramyxovirus. Virus ini hanya memiliki RNA. Paramyxovirus dapat tumbuh di jaringan otak, pangkreas, testis, glandula, parotid, dan kadang di hati. Penyakit gondong ditandai dengan pembengkakan di belakang kelenjar parotid yang berdekatan dengan telinga karena peradangan akibat infeksi. Gejala lainnya adalah suhu badan 39.5oC, demam, sakit kepala, nyeri anggota gerak, dan nyeri otot Penularannya terjadi melalui kontak langsung dengan penderita, melalui ludah, urin, dan muntahan.

HIV adalah virus golongan retrovirus yang mempunyai 2 molekul RNA. Virus tersebut diduga kuat berasal dari virus kera Afrika yang telah mengalami mutasi. Acuguired immunodeficiency syndrome (AIDS) adalah penurunan sistem kekebalan tubuh yang disebabkan oleh human immunodeficiency virus (HIV).

Virus Ebola ditemukan pada tahun 1976 di Sudan dan Zaire. Habitatnya di alam di ketahui. Gejala yang ditimbulkan oleh Ebola mirip dengan gejala influenza, yaitu demam, menggigil, sakit kepala, nyeri otot, dan nafsu makan hilang. Gejala ini muncul setelah 3 hari terinfeksi. Pada hari ke-6, darah keluar dari mata, hidung dan telinga. Pada hari ke-9 biasanya penderita meninggal dunia. Ebola ditularkan melalui kontak langsung dengan cairan tubuh penderita ebola, misalnya darah, feses, urin, ludah, dan keringat. Sampai saat ini belum ada penyembuhnya.

Penyakit ini disebabkan oleh virus anggota famili Herpesviridae, yang menyerang kulit dan selaput lendir. Virus herpes simpleks dapat menyerang bayi, anakanak, dan orang dewasa. Penyakit ini biasanya mengenai mata, bibir, mulut, kulit, alat kelamin, dan kadang-kadang otak. Gejala utama adalah timbulnya gelembunggelembung kecil, kecuali pada mata dan otak.

Penyakit ini disebabkan oleh virus rabies, merupakan penyakit yang menyerang hewan, misalnya anjing, kucing, dan kelelawar penghisap darah. Hewan yang terkena gigitan rabies menunjukkan perilaku agresif atau kelumpuhan. Virus ditularkan kepada manusia melalui gigitan hewan yang terinfeksi.

Pernafasan akut parah Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) adalah penyakit saluran pernapasan yang disebabkan oleh virus Coronavirus (CoV).