Hvert år gis det ut to deltakermerker for JOTA-JOTI: Det nordiske merket og det internasjonale merket. Det vanligste i Norge er å bruke det nordiske merket, men det er valgfritt. Du kan gjerne kjøpe begge om du vil! Begge speiderbutikkene (både Speiderbutikken og Speider-sport) har det nordiske merket, så hvis den ene skulle bli utsolgt kan det hende at den andre har noen igjen. Per nå er det kun Speider-sport som fører det internasjonale merket.
Nedenfor er eksempler på det nordiske (til venstre) og det internasjonale (til høyre) deltakermerket. Merket kan også kjøpes som en takk til de som hjelper til med arrangementet, for eksempel radioamatøren!
Det finnes en hel del aktivitetsmerker som speiderne kan ta - helt eller delvis - i forbindelse med JOTA-JOTI, litt avhengig av om du er medlem av Norges Speiderforbund (NSF) eller Norges KFUK-KFUM-speidere (KM). Klikk på merkene under for å komme direkte til merkekravene.
Det finnes også et internasjonalt aktivitetsmerke for ScoutLink, som er beregnet for speidere fra 10 år og oppover. Kravene til ScoutLink Activity Badge finner du her. Dette merket selges ikke av speiderbutikkene, men kan bestilles direkte fra ScoutLink.