1. Через gnome-tweak-tool
2. "Традиционный" способ, который можно быстро найти в Гугле: от рута открываем файл /usr/share/X11/xkb/symbols/ru, находим в нем строку include "kpdl(comma)" и заменяем commaна dot. После чего перезапускаем Иксы.
Недостатки метода: после обновления системы (если обновлялись компоненты Иксов) операцию приходится повторять.
источник: https://www.altlinux.org/%D0%A2%D0%BE%D1%87%D0%BA%D0%B0_%D0%BD%D0%B0_%D1%86%D0%B8%D1%84%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%BE%D0%B9_%D0%BA%D0%BB%D0%B0%D0%B2%D0%B8%D0%B0%D1%82%D1%83%D1%80%D0%B5