ffmpeg は言わずと知れた動画変換アプリケーション。
macの人はhomebrewから。
これで、ImageJ(Fiji)で開けるaviを作れる。
"ffmpeg -i 入力ファイル -an -vcodec rawvideo -y 出力.avi"
入力ファイルと出力は適当に。
参考 www.researchgate.net/post/How_to_convert_videos_to_analyse_in_ImageJ