Introduction to single cell analysis

단일세포 전사체 데이터분석에 대한 개요

Single cell technology

단일세포 전사체 기술에 대한 개요

Preliminary Project presentation

팀별로 분석할 단일세포 전사체 데이터에 대한 발표 (생물학적인 의미)

Quality control and normalization

단일세포 전사체 데이터 품질관리와 정규화

Data correction and Integration

이질적인 단일세포 전사체 데이터 교정과 통합

Dimension reduction and visualization

차원축소와 시각화 (PCA, tSNE, UMAP)

Clustering and cell type annotation

클러스터링과 세포유형 확립

Trajectory inference I

다양한 세포궤적 분석방법 (Monocle, Slingshot, PAGA)

Trajectory inference II: RNA velocity

RNA velocity의 개념과 분석 및 활용방법

Gene regulatory network inference

다양한 유전자조절네트워크 추론방법

PIC-seq data analysis and cell-cell interaction

두세포 시퀀싱 데이터와 세포간 상호작용에 대한 분석방법

Spatial transcriptomics

공간전사체 (Slide-seq, seqFISH) 데이터에 대한 이해

Multimodal analysis

scATAC-seq, CITE-seq 등 단일세포 후성유전체, 단백질체에 대한 분석방법

Final project presentation I

최종 프로젝트 발표 I

Final project presentation II

최종 프로젝트 발표 II