研究業績

査読つき論文

1. Yamada, Toshihiro; Aiba, Shin-ichiro; Okubo, Kumiko; Suzuki, Eizi; Maenaka, Hisayuki; Nagano, Masahiro; Nakajima, Yoshinori; Nagano, Toru; Ishihara, Masae; Yasumatsu, Hiroki; Sawada, Yoshimi; Kawashima, Kazuyoshi; Takami, Kunio  (in press)  Grow or die: A 49-year growth history of a Japanese warm-temperate tree species. Ecosphere

2. Sakaguchi, Shota*; Fukumoto, Shigeru; Masuda, Kazutoshi; Setoguchi, Hiroaki; Hirota, Shun; Suyama, Yoshihisa; Fujiki, Daisuke; Miura, Reiichi; Yamamoto, Kazuki; Ota, Misyo; Ishihara, Masae (in press) Evaluating the potential of interpopulation outbreeding to rescue plant populations facing reproductive failures. Ecological Research

3. Yoshikawa T, Totsu K, Takeuchi Y, Kadoya T, Enoki T, Fujii S, Fukamachi AS, Hirota M, Hoshizaki K, Iiyama N, Ishikawa Y, Itô H, Kobayashi H, Kohyama TS, Konno Y, Makita A, Mori AS, Nagamatsu D, Nakashizuka T, Namikawa K, Noguchi M, Sakimoto M, Ozaki Y, Seino T, Sugita H, Suzuki J-I, Suzuki RO, Suzuki SN, Takahashi K, Tateno R, Watanabe R, Yamashita T, Yoshida T, Ishihara MI, Kenta T, Nakamura M, Hiura T (2024.3) Forest monitoring data of 45 plots across the Japanese archipelago during 1980–2021. Ecological Research n/a. https://doi.org/10.1111/1440-1703.12457

4. Masuda K, Setoguchi H, Nagasawa K, Hirota SK, Suyama Y, Sawa K, Fukumoto S, Ishihara MI, Abe H, Tsuboi H, Tango T, Mori S, Sakaguchi S (2024.2) Genetic consequences of Last Glacial–Holocene changes in snowfall regime in Arnica mallotopus populations—a plant confined to heavy-snow areas of Japan. American Journal of Botany

5. Kadowaki K, Honjo M, Nakamura N, Kitagawa Y, Ishihara MI, Matsuoka S, Tachiki Y, Fukushima K, Sakaguchi S, Mizuki I, Fujiki D, Sakai M, Takayanagi A, Yamasaki M, Tokuchi N, Takahashi D, Nagasawa K, Masuda K. (2023.11). eDNA metabarcoding analysis reveals the consequence of creating ecosystem-scale refugia from deer grazing for the soil microbial communities. Environmental DNA.

6. Masuda K, Setoguchi H, Fukumoto S, Ishihara MI, Sakaguchi S (2023.2) A New Flower Color Variant of Hemerocallis middendorffii var. esculenta (Asphodelaceae). Acta Phytotaxonomica et Geobotanica 74:33–37. https://doi.org/10.18942/apg.202218

7. Masuda K, Setoguchi H, Nagasawa K, Ishihara MI, Sawa K, Horie K, Tsuboi H, Fukumoto S, Tango T, Sakaguchi S (2023.3). Rear-edge daylily populations show legacies of habitat fragmentation due to the Holocene climate warming. Journal of Biogeography 50: 551–563. https://doi.org/10.1111/jbi.14552 

8. Toda M, Ishihara MI, Doi K, Hara T (2022.10) Determination of species-specific leaf angle distribution and plant area index in a cool-temperate mixed forest from UAV and upward-pointing digital photography. Agricultural and Forest Meteorology 325: 109151

9. Nagasawa K, Fukumoto S, Setoguchi H,  Ishihara MI, Masuda K, Hiratsuka K, Sakaguchi S (2022.4) Genetic purity of a rear-edge population of Carex podogyna Franch. et Sav. (Cyperaceae) maintained under interspecific hybridization. Genes & Genetic Systems 97: 93-99. DOI: 10.1266/ggs.21-00087

10. Nakamura M , Terada C ,  Ito K , Matsui K , Niwa S , Ishihara M, Kenta T, Yoshikawa T, Kadoya T, Hiura T, et al. (2022.2). Evaluating the soil microbe community-level physiological profile using EcoPlate and soil properties at 33 forest sites across Japan Ecol. Res. 37: 432-445. DOI: 10.1111/1440-1703.12293 

11. Fibich P, Ishihara M, Suzuki S, Dolezal J, Altman J (2021.9) Contribution  of conspecific negative density dependence to species diversity is increasing towards low environmental limitation in Japanese forests. Scientific Report. 11: 18712. https://doi.org/10.1038/s41598-021-98025-5

12. Hagiwara T, Ishihara MI, Hiura T, Takabayashi J, Shiojiri K. (2021.8) Effective distance of volatile cues for plant–plant communication in beech. Ecology and Evolution 11:12445-12452.doi: 10.1002/ece3.7990 

13. Masuda K, Setoguchi H, Nagasawa K, Fukumoto S, Ishihara MI, Miura R, Mizusawa L, Hiratsuka K, Sakaguchi S. (2021.6) Identification of management units in the threatened populations of Arnica mallotopus Makino (Asteraceae), using novel EST-SSR markers. Genes & Genetic Systems.  96: 159-164 doi: 10.1266/ggs.21-00021

14. 榊原朱望, 鳥丸猛, 赤田辰治, 石原正恵, 石井弘明, 東若菜, 戸田求. (2021.5) ブナの乾燥関連性遺伝子における一塩基多型の探索と地域間の遺伝的文化. 中部森林研究 = Chubu For. Res. 69: 5–8.

15. 阪口翔太、鶴田憲次、光田重幸、福本繁、瀬戸口浩彰、石原正恵.(2021.5) 京都大学芦生研究林にてアキタスズムシソウを記録する. 森林研究  81: 1-4.

16. Masuda K, Setoguchi H, Nagasawa K,  Ishihara M and  Sakaguchi S (2021.2) Development and characterization of EST-SSR markers for Amur daylily, Hemerocallis middendorffii Trautv. et C.A.Mey. (Asphodelaceae). Acta Phytotaxonomica et Geobotanica, 72: 73-78.

17. 阪口翔太、福本繁、長澤耕樹、増田和俊、髙橋大樹、瀬戸口浩彰、古田卓、岸本泰典、平塚健一、舩津慧、石原正恵.（2020.12） 京都府芦生にてフガクスズムシソウ (ラン科）を記録する. 植物地理・分類研究, 68: 81-87.

18. Nakagawa H, Hasegawa A, Hayashi D, Furuta M, Kishimoto Y, Miyagi Y, … Ishihara MI (2020.8). Long-term monthly climate data at the forest stations of Kyoto University. Ecological Research, (November 2019), 733–741. doi: 10.1111/1440-1703.12116

19. Mizuki I, Itô H, Yamasaki M, Fukumoto S, Okamoto Y, Katsuki M, Fukushima K, Sakai M, Sakaguchi S, Fujiki D, Nakagawa H, Ishihara MI and Takayanagi A  (2020.6) Seasonal and annual fluctuations of deer populations estimated by a Bayesian state–space model.  PLoS One 15 e0225872 Online: https://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0225872

20. Toda M, Doi K, Ishihara MI Azuma W A and Yokozawa M (2020.2) A Bayesian inversion framework to evaluate parameter and predictive inference of a simple soil respiration model in a cool-temperate forest in western Japan Ecol. Modell. 418 108918 Online: https://doi.org/10.1016/j.ecolmodel.2019.108918

21. Kattge J, Bönisch G, Díaz S, Lavorel S, ..Ishihara MI  et al (2020.1) TRY plant trait database – enhanced coverage and open access Glob. Chang. Biol. 26: 119–188 Online: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/gcb.14904

22. Brati MQ, Ishihara MI, Higashi O (2019) Groundwater level reduction and pollution in relation to household water management in Kabul, Afghanistan. Sustain Water Resour Manag. doi: 10.1007/s40899-019-00312-7

23. Ishihara MI, Konno Y, Umeki K, Ohno Y, Kikuzawa K (2016) A new model for size-dependent tree growth in forests. PLoS ONE, 11(4): e0152219. DOI:10.1371/journal.pone.0152219

24. 松山周平, 福島慶太郎, 白澤紘明, 向昌宏, 平井岳志, 境慎二朗, 石原正恵, 岩井有加, 八木弥生, 谷鑫, 立岩沙知子, 長谷川尚史, 吉岡崇仁 (2016) 間伐とシカ排除柵設置がスギの幹成長に及ぼす直接的・間接的影響 −芦生の未間伐スギ人工林における事例−. 森林研究, 79: 1-9.

25. 柴田 英昭, 石原 正恵, 渡辺 悌二, 氷見山 幸夫, 甲山 隆司, 占部 城太郎, 吉村 暢彦 (2015) 変動下における陸域変化研究の歩みと将来. 地球環境, 20(2): 143-150.

26. Ishihara MI, Utsugi H, Tanouchi H, Aiba M, Kurokawa H, Onoda Y, Nagano M, Umehara T, Ando M, Miyata R, Hiura, T. (2015) Efficacy of generic allometric equations for estimating biomass: a test in Japanese natural forests. Ecological Applications, 25: 1433-1446.

27. Falster DS, Duursma RA, Ishihara MI, Barneche DR et al. (2015) BAAD: a Biomass And Allometry Database for woody plants. Ecology, 96: 1445.

28. Suzuki SN, Ishihara MI and Hidaka A (2015) Regional-scale directional changes in abundance of tree species along a temperature gradient in Japan. Global Change Biology, 21: 3436–3444. DOI: 10.1111/gcb.12911.

29. Watanabe T, Shibata H, Ishihara M, Yoshimura N and Kohyama T. (2014) Global Land Project Sapporo Nodal Office Addressing Land System Studies on Resilience, Sustainability and Vulnerability in Asia. Global Environmental Research, 18(2): 105-112.

30. Ishihara MI (2013). Role of axis reversal from the short-shoot to long-shoot habit for crown maintenance in slow-growing Betula maximowicziana trees. American Journal of Botany 100:346-356.

31. Suzuki SN, Ishihara MI, Nakamura M, Abe S, Hiura T, Homma K, Higa M, Hoshino D, Hoshizaki K, Ida H, Ishida K, Kawanishi M, Kobayashi K, Kuraji K, Kuramoto S, Masaki T, Niiyama K, Noguchi M, Nomiya H, Saito S, Sakai T, Sakimoto M, Sakio H, Sato T, Shibano H, Shibata M, Suzuki M, Takashima A, Tanaka H, Takagi M, Tashiro N,  Tokuchi N, Yoshida T, and Yoshida Y. (2012). Nation-wide litter fall data from 21 forests of the Monitoring Sites 1000 Project in Japan.  Ecological Research 27: 989-990.

32. 石原 正恵, 今西 亜友美, 阪口 翔太, 福澤 加里部, 向 昌宏, 吉岡 崇仁. (2012). 芦生研究林におけるシカ排除柵によるススキ群落の回復過程. 森林研究 78: 39-56.

33. Ishihara MI, Suzuki SN, Nakamura M, Enoki T, Fujiwara A, Hiura T, Homma K, Hoshino D, Hoshizaki K, Ida H, Ishida K, Itoh A, Kaneko T, Kubota K, Kuraji K, Kuramoto S, Makita A, Masaki T, Namikawa K, Niiyama K, Noguchi M, Nomiya H, Ohkubo T, Saito S, Sakai T, Sakimoto M, Sakio H, Shibano H, Sugita H, Suzuki M, Takashima A, Tanaka N, Tashiro N, Tokuchi N, Yoshida T, and Yoshida Y. (2011). Forest stand structure composition and dynamics in 34 sites over Japan. Ecological Research 26: 1007–1008.

34. Ishihara MI and Hiura T. (2011). Modeling leaf area index from litter collection and tree data in a deciduous broadleaf forest. Agricultural and Forest Meteorology 151: 1016–1022

35. Motohka T, Shimada M, Isoguchi O, Ishihara MI, Suzuki SN. (2011). Relationships between PALSAR backscattering data and forest above ground biomass in Japan. Proceedings of Geoscience and Remote Sensing Symposium (IGARSS), 2011 IEEE International: 3518–3521.

36. Ishihara MI and Kikuzawa K. (2009). Annual and spatial variation in shoot demography associated with masting in Betula grossa: comparison between mature trees and saplings. Annals of Botany 104: 1195–1205.

37. Ishihara MI, Yamasaki M and Yoshikawa J. (2007). Spatial distribution and abundance of bud galls caused by eriophyoid mites among host trees Carpinus tschonoskii. Journal of Applied Entomology 131: 585–587.

38. Miyazawa Y, Ishihara M, Suzuki M, Fukumasu H, and Kikuzawa K. (2006).Comparison of the physiology, morphology, and leaf demography of tropical saplings with different crown shapes. Journal of Plant Research 119: 459–467.

39. Ishihara M. and Kikuzawa K. (2004). Species-specific variation in shoot production patterns of five birch species with respect to vegetative and reproductive shoots. Botany (前誌Canadian Journal of Botany) 82: 1393–1401.

著書

1. 石原 正恵・赤石 大輔・徳地 直子 編 （2024.1）『「大学の森」が見た森と里の再生学－京都芦生・美山での挑戦』, 京都大学学術出版会, 420p., ISBN: 9784814005048
   シカの食害・地球温暖化により変わる森、過疎・高齢化に直面する里。日本各地が直面するこれらの課題は互いにつながっている。だから、学問の垣根を越えて、研究者と社会の垣根を越えて、一緒に考え行動しよう。こうした視点に基づき、100年続く大学の森である芦生研究林とが、地元美山町を舞台に、理系から文系までの研究者が、の地域住民・行政・企業などと、森と里の共再生を目指し本気の超学際研究に取り組んだ。本書では、研究成果の紹介だけでなく、「言うは易く行うは難し」の超学際研究の始まりから展開の裏側を描く。多様な価値観と立場が交錯する中での協働のコツや苦労、研究者の変化、継続のヒントまで。

2. Ishihara MI, Utsugi H, Tanouchi H, Hiura T. (2014) Evaluating relationships between biodiversity and ecosystem functions in forests using forest inventory and allometry data. In: Asia-Pacific Biodiversity Observation Network: Integrative Observations and Assessments (Eds. Nakano, S., Yahara, T., Nakashizuka, T.). Springer Japan, pp. 351-365, ISBN: 978-4-431-54783-9.

3. 石原正恵 (2014) 成長段階によって変わる冬芽や枝の伸ばし方―カバノキ属の例. 冬芽と環境（編集：八田洋章）, 北隆館, pp.224-236, ISBN: 978-4-8326-0760-6.

解説・総説

1. 林 真智, 田殿 武雄, 落合 治,  濱本 昂,  Ake Rosenqvist, 日浦 勉, 石原 正恵, 齋藤 英樹, 髙橋 正義, 鷹尾 元 (2022.2) 森林バイオマス観測をとりまく動向. 日本リモートセンシング学会誌 42:14-20.

2. 石原正恵, 石田健, 井田秀行, 伊東明, 榎木勉, 大久保達弘, 金子隆之, 金子信博, 倉本惠生, 酒井武, 齋藤哲, 崎尾均, 嵜元道徳, 芝野博文, 杉田久志, 鈴木三男, 高木正博, 高嶋敦史, 武生雅明, 田代直明, 田中信行, 徳地直子, 並川寛司, 新山馨, 西村尚之, 野口麻穂子, 野宮治人, 日浦勉, 藤原章雄, 星野大介, 本間航介, 蒔田明史, 正木隆, 吉岡崇仁, 吉田俊也. (2010). モニタリングサイト1000 森林・草原調査コアサイト・準コアサイトの毎木調査データの概要. 日本生態学会誌 60:111–123.

3. 石原正恵, 豊田鮎, 中村誠宏. (2007). モニタリングサイト1000(森林調査) (<連載2>野外研究サイトから(8)). 日本生態学会誌 57: 438–442.

その他出版物

1. 石原正恵(2024. 1)芦生研究林長の美山日記 ～外と内の視点から～. 北桑時報 292: 30-37

2. 石原正恵(2020) 豊かな芦生の森の回復を目指して. あうる京北友の会だより, 174, 4-5

3. 石原正恵, 吉村 暢彦, Min Fan, 井上 貴央, 三島 啓雄, 北條 愛, 長坂 晶子, 大野 泰之, 津田 高明, 辻 宣行, 柴田 英昭 (2015) 石狩川流域市町村における生態系サービス間の関係. 北方森林研究（旧 日本森林学会北海道支部論文集） 63: 5-6.

4. Ishihara MI, Shibata H (2014) Event report: GLP International Winter School. GLP Sapporo Nodal Office News. 1:8-9.

5. 石原正恵, 柴田英昭, 津久井成美，渡辺悌二. （2012） 全球陸域研究計画（GLP）札幌拠点オフィスの取り組み．北方森林保全技術 30：25-28．

6. Watanabe T and Ishihara MI. (2012) GLP Nodal Office on Vulnerability, Resilience and Sustainability of Land Systems, Sapporo. GLP News 8: 33–35.

7. 石原正恵, 豊田鮎, 中村誠宏. （2008）. モニタリングサイト1000（森林調査）の現状と課題. 「長期生態系モニタリングの現状と課題－温暖化影響と生態系応答｣, pp. 73–74, 国立環境研究所地球環境研究センター, つくば.

学位論文

Masae Ishihara. (2006) Canopy Development in Adult Birch Trees for Reproduction and Maintenance of Foliage. 博士論文, 京都大学, 京都.

学会発表

1. 萩原幹花, 塩尻かおり, 鹿島誠, 石原正恵. 乾燥ストレス下でVOCsを介した植物間コミュニケーションは駆動するのか？2024年3月17日. 日本生態学会第71回全国大会、横浜市.

2. 杉本廉, 石原正恵, 東若菜. 森林生態系内において樹幹着生性地衣類のリター量に影響を与える要因. 2024年3月16日. 日本生態学会第71回全国大会、横浜市.

3. 井上みずき, 伊東宏樹, 山崎理正, 福本繁, 岡本勇貴, 甲木勝也, 福島慶太郎, 境優, 阪口翔太, 藤木大介, 中川光, 石原正恵, 高柳敦. 2023年10月. 芦生冷温帯林における3種類の断片的シカ情報を利用した個体群変動パタンの解析. 個体群生態学会大会, 北海道大学, 札幌市.

4. Shota IZUMI, Kaori SHIOJIRI, Shunsuke MATSUOKA, Masae I. ISHIHARA, Inoue MIZUKI,  Shota SAKAGUCHI, Masaru SAKAI, Daiki TAKAHASHI, Atsushi TAKAYANAGI,　Koki NAGASAWA, Keitaro FUKUSHIMA, Daisuke FUJIKI, Kazutoshi MASUDA, Michimasa YAMASAKI. 2023年9月23日. Comparison of seasonal variation and species of butterflies and dragonflies inside and outside deer fences. BITEX to CITEX：What we have learned and what we can transfer?, Ritsumeikan University, 草津市.

5. 門脇浩明, 本庄三恵, 中村直人, 北川陽一郎, 石原正恵, 松岡俊将, 立木佑弥, 福島慶太郎, 阪口翔太, 井上みずき, 藤木大介, 境優, 高柳敦, 山崎理正, 徳地直子, 高橋大樹, 長澤耕樹, 増田和俊. 2023年3月18日. シカによる過採食が土壌微生物群集に与える影響：広域シカ柵設置サイトにおける解析例. 日本生態学会第70回全国大会、オンライン.

6. 大塚裕斗, 井上みずき, 山崎理正, 高柳敦, 福島慶太郎, 阪口翔太, 藤木大介, 境優, 髙橋大樹, 長澤耕樹, 増田和俊, 石原正恵. 2023年3月17日.  機械学習LightGBMによるシカの目撃頻度予測. 日本生態学会第70回全国大会、オンライン.

7. 萩原 幹花, 日浦 勉, 長田 典之, 石原 正恵. 2022年3月29日. ブナにおけるVOCsと葉形質の地理的変異. 第133回日本森林学会学術大会, オンライン. ポスター賞受賞

8. 萩原幹花, 塩尻かおり, 陶山佳久, 松尾歩, 石原正恵. 2022年3月14日. 自然林におけるVOCsを介したブナの植物間コミュニケーション.日本生態学会第69回全国大会、オンライン.

9. 鮫島裕貴, 保坂哲朗, 石原正恵, 中林雅, 山田俊弘. 2022年3月. 東広島市におけるブナ種子食昆虫(ブナヒメシンクイ)の羽化消長と種子食害率. 日本生態学会第69回全国大会、オンライン.

10. 戸田求, 石原正恵, 土井一希.2022年3月15日.デジタル画像を用いた温帯混交林の葉傾斜角分布と葉面積指数の評価. 日本生態学会第69回全国大会、オンライン.

11. 赤石大輔, 石原正恵, 徳地直子. 2022年3月15日. 地域生物多様性保全に向けた市民との協働によるモニタリング型観察会の実施. 日本生態学会第69回全国大会、オンライン.

12. 東若菜, 駒田夏生, 小川裕也, 吉田智弘, 石原正恵. 2022年3月15日. 樹幹に着生するコケ類と懸垂土壌のバイオマスと分布特性の理解に向けて. 日本生態学会第69回全国大会、オンライン.

13. 増田和俊, 瀬戸口浩彰, 長澤耕樹, 廣田峻, 陶山佳久, 沢和浩, 福本繁, 石原正恵, 阿部晴恵, 坪井勇人, 丹後亜興, 森小夜子, 阪口翔太. 2022年3月. 歴史的な降雪変化が日本の多雪依存植物チョウジギクの個体群に与えた遺伝的影響. 日本生態学会第69回全国大会、オンライン.

14. Kadowaki K, Kitagawa Y, Ishihara M 2022年3月. Mycorrhizal types as a crucial factor driving seedling establishment: evidences from a cool temperate forest in Japan. 日本生態学会第69回全国大会、オンライン.

15. Fukushima K, Sakaguchi Shota, Sakai Masaru, Inoue M, Fujiki D, Nakagawa H, Yamasaki Michimasa, Ishihara M, Takayanagi A. 2022年3月. Deer overgrazing alters stream water chemistry in forested catchments; importance of understory vegetation in nutrient retention. 日本生態学会第69回全国大会、オンライン.

16. 増田和俊, 瀬戸口浩彰, 長澤耕樹, 沢和浩, 丹後亜興, 坪井勇人, 福本繁, 堀江健二, 平塚健一, 石原正恵, 阪口翔太. 2022年3月. ゼンテイカの分布末端集団における保全遺伝学的研究. 日本植物分類学会大会第21回

17. Shibata H, Ishihara MI 2021年9月15日.  Challenge to Use Online Digital Contents for Virtual Education on Forest Ecosystem and Biodiversity in Japan LTER Sites The 3rd Global Land Programme Asia Conferences. Online.

18. Kadowaki K, Ishihara MI 2021年9月14日.  Deer Overbrowsing and Its Impact on Tree Communities. Insights from Long Term  Forest Dynamics and Deer Exclusion Experiment in the Ashiu Research Forest. The 3rd Global Land Programme Asia Conferences. Online.

19. 石原正恵, 坂野上なお. 2021年3月17日. トチノキをめぐる対立から地域知と科学知に基づく持続的利用へ.日本生態学会第68回全国大会、オンライン.

20. 坂野上なお, 石原正恵. 2021年３月23日.  トチモチ文化の伝承とトチノミの資源利用−京都府南丹市美山町を中心に. 第132回日本森林学会大会, オンライン.

21. 鷹尾 元, 日浦 勉, 石原 正恵, 落合 治, 田殿 武雄, 林 真智, 濱本 昂, 齋藤 英樹, 髙橋 正義. 2021 年3月広域森林バイオマス研究プラットフォーム 現場から衛星までを結んで.  第132回日本森林学会大会, オンライン.

22. Fujii T, Ishihara M, Sakaguchi S. 2021年3月17日.  シカにより衰退した植生の回復に不嗜好性植物の優占と種子供給量の減少が与える影響. 日本生態学会第68回全国大会、オンライン.

23. Doan TT, Sakaguchi S, Ishihara MI. 2021年3月17日.  Long-term effects of deer overgrazing and exclusion on soil seed bank: the change in abundance and species diversity. 日本生態学会第68回全国大会、オンライン.

24. 萩原幹花, 塩尻カオリ, 鹿島誠, 栗田悠子, 永野惇, 石原正恵.  2021年3月18日.トランスクリプトームからみるブナの傷害及び揮発性化学物質の受容応答. 日本生態学会第68回全国大会、オンライン.

25.  増田 和俊・瀬戸口 浩彰・長澤 耕樹・石原 正恵・阪口 翔太. 日本海側気候の変化が植物の集団動態に与えた影響：多雪依存種チョウジギクを用いた検証. 2021年3月8日. 日本植物分類学会第20回大会（オンライン）.

26. 増田 和俊・瀬戸口 浩彰・長澤 耕樹・廣田 峻・陶山 佳久・沢 和浩・福本 繁・石原 正恵・阿部 晴恵・坪井 勇人・丹後 亜興・森 小夜子・阪口 翔太. 日本海側気候の変化が植物の集団動態に与えた影響：多雪依存種チョウジギクを用いた検証. 2021年3月8日. 日本植物分類学会第20回大会（オンライン）.

27. 萩原幹花、石原正恵、鹿島誠、栗田悠子、永野惇、塩尻かおり. 2020年12月5日. トランスクリプトームからみるブナの傷害及び揮発性化学物質の受容応答. 第52回種生物学会、オンライン.

28. 坂野上なお, 石原正恵, 德地直子. 2020年3月.トチノミの利用と資源管理−京都大学芦生研究林と地域住民との協働−.第131回日本森林学会大会

29. 赤石大輔, 法理樹里, 清水夏樹, 石原正恵, 徳地直子. 2020年3月8日. これまでの研究者と社会との協働における成果と課題.  日本生態学会第67回全国大会  

30. 長澤耕樹, 瀬戸口浩彰, 福本繁, 石原正恵, 沢和浩, 堀江健二, 増田和俊, 阪口翔太. 2020年3月8日. 多雪環境の歴史変化が植物の集団動態に与える影響.  日本生態学会第67回全国大会

31. 萩原幹花, 塩尻かおり, 石原正恵, 日浦勉. 2020年3月5日.ブナにおける誘導反応の伝達経路 揮発性化学物質はCueになるのか？ 日本生態学会第67回全国大会  

32. 増田和俊, 瀬戸口浩彰, 長澤耕樹, 沢和浩, 丹後亜興, 坪井勇人, 福本繁, 堀江健二, 石原正恵, 阪口翔太. 2020年3月1日. 後氷期の気候温暖化がゼンテイカ群の末端集団動態の決定的要因である. 第19回日本植物分類学会 

33. 阪部拓海, 石原正恵, 嵜元道徳, 戸田求, 崎尾均. 2020年3月. 森林の炭素蓄積量推定の落とし穴：冷温帯天然林における生立木の腐朽の影響. 日本生態学会第67回全国大会  

34. 井上みずき, 伊東宏樹, 山崎理正, 福本繁, 岡本勇貴, 甲木勝也, 福島慶太郎, 境優, 阪口翔太, 藤木大介 , 中川光, 石原正恵, 高柳敦. 2020年. 状態空間モデルを用いたシカ個体群の季節変動と年変動. 日本森林学会大会

35. Ishihara MI 2019年11月11日. Biodiversity crisis due to deer overgrazing and long-term conservational research in Ashiu Forest Research Station. Symposium of Integrative Biology: World Tour    招待有り

36. Ishihara MI 2019年10月4日. Revealing the relationship between tree diversity and ecosystem functions through long term and nationwide datasets. AsiaFlux Workshop2019 & JaLTER OSM 

37. Ishihara MI 2019年5月13日. Ex-situ conservation of locally endangered plant species and collection of pine and bamboo species in Kyoto University Forests. International Symposium, Conservation of plant diversity in the East Asian islands: toward strengthen the effectiveness of ex-situ conservation 

38. 萩原幹花, 塩尻かおり, 石原正恵, 日浦勉. 2019年3月17日. ブナの植物間コミュニケーション. 日本生態学会第66回全国大会 、神戸国際会議場、神戸.

39. 山﨑理正, 金子隆之, 高柳敦, 石原正恵, 安藤信. 2019年3月18日. ナラ枯れが冷温帯林の長期動態に及ぼす影響 . 日本生態学会第66回全国大会 、神戸国際会議場、神戸.

40. Ishihara MI, Toda M. 2019年3月18日. Stand structure and productivity of a beech forest in Mt. Takanosu, Hiroshima. 日本生態学会第66回全国大会 、神戸国際会議場、神戸.

41. 鈴木智之, 石原正恵, 日野貴文.2019年3月16日. 全国レベルでの温度勾配に沿った樹種構成の変化.日本生態学会第66回全国大会 、神戸国際会議場、神戸.

42. 石原正恵.2019年3月16日.多様性と森林生産性の安定性との関係.日本生態学会第66回全国大会 、神戸国際会議場、神戸.

43. Ishihara MI, Szuzuki S, Hino T. 2018年10月15日. Relationship between biodiversity and stability of productivity in Japanese forests. ILTER EAP scientific conference, Lin Hotel & Banquet, Taichung.

44. 水谷あゆみ, 東若菜, 平井岳志, 石原正恵, 金子命, 高柳敦, 松山周平. 2018年03月15日. シカによる下層植生の食害がミズナラのシュート成長に及ぼす影響. 日本生態学会第65回全国大会, 札幌.

45. 石原正恵. 2018年3月28日.シカ生息地におけるオオバアサガラ林の成立と剥皮による枯死. 第129回日本森林学会、高知大学、高知.

46. Prayoto, Ishihara M, Nakagoshi N. 2017年3月15日. Relationship between land cover and peatlandfires in Riau, Indonesia. 日本生態学会第64回全国大会 、早稲田大学、東京.

47. Ishihara MI. 2016年11月13日. Intraspecific variation in masting behavior of deciduous tree Betula grossa. 5th Japan-Taiwan Ecology Workshop、龍谷大学、京都.

48. Brati MQ, Ishihara MI. 2016年3月17日. Groundwater crisis in relation to household water management in Kabul city, Afghanistan. 第50回日本水環境学会年会、アスティとくしま、徳島.

49. 菊沢喜八郎，石原正恵，梅木清，大野康之，紺野康夫. 2015年3月19日.  落葉広葉樹二次林構成樹種の胸高直径成長 第62回日本生態学会、鹿児島大学、鹿児島.

50. Ishihara MI, Yoshimura N, Fan M, Inoue T, Mishima Y, Hojo A, Nagasaka A, Ohno Y, Tsuda T, Tsuji N, Shibata H. 2014年9月25日. Synergies and tradeoffs among ecosystem services in Ishikari River watershed, Japan. 2014 Asia Global Land Project Conference, Taipei, A0162.

51. 石原正恵，宇都木玄，田内裕之，永野正弘，安藤信，宮田理恵，黒川紘子，饗庭正寛，小野田雄介，日浦勉.2013年3月7日. 亜熱帯林から亜寒帯林における現存量推定のための相対成長式. 第60回日本生態学会、グランシップ静岡、静岡.

52. Ishihara M, Hiura T, Shibata H, Kohyama T. 2012年5月21日. Evaluating human impacts on tree diversity and ecosystem functions in East Asia from forest inventory database. 日本地球惑星科学連合大会2012、幕張メッセ、千葉.

53. Ishii K, Fukushima K, Ishihara M, and Yoshioka T. 2012年3月19日. Soil carbon and nitrogen dynamics changes associated with vegetation recovery in a deer exclosure at a heavy grazed Miscanthus sinensis grassland. Joint Meeting of the 59th annual meeting of Ecological Society of Japan & the 5th East Asian Federation of Ecological Societies International Congress (第59回日本生態学会・第5回東アジア生態学会合同大会)、龍谷大学、大津.

54. 石原正恵. 2010年3月17日.樹木の肥大成長量と動態パラメータの地理パターン. 第57回日本生態学会、東京大学、東京.

55. 石原正恵・豊田 鮎. 2009年3月19日.モニタリングサイト1000（森林・草原調査）のデータベースの現状と展望. 第56回日本生態学会フォーラム「生態系機能の広域的理解のための情報基盤整備」、岩手県立大学、岩手.

56. 石原正恵. 2008年3月28日.ミズメにおける豊凶現象:7年間の年次変動と個体間同調. 日本森林学会大会発表データベース、119：309、東京農工大学、府中.

57. 石原正恵・山崎理正・吉川純平. 2006年3月28日.ソロメフクレダニによるゴールの植物個体間分布とその要因. 日本応用動物昆虫学会大会講演要旨集、50：119、筑波大学、つくば.

58. Ishihara M, Yamasaki  M, and Yoshikawa J. 2006年3月26日. Spatial distribution of bud galls caused by eriophyoid mites on Carpinus tschonoskii. The Second Scientific Congress of East Asian Federation of Ecological Societies (第2回東アジア生態学会)、朱鷺メッセ、新潟.

59. 石原正恵. 2006年3月27日. ウダイカンバ若齢・壮齢木における枝構造とその発達様式.第53回日本生態学会、朱鷺メッセ、新潟.

60. 石原正恵. 2005年3月29日.ウダイカンバにおける短枝の長枝化と樹冠構造上の意義. 日本生態学会大会講演要旨集,  52：663、大阪国際会議場、大阪.

61. 石原正恵・菊沢喜八郎. 2004年12月12日.カバノキ属における繁殖と枝の伸び方：種特異的なシュート生産パターンとシュート・デモグラフィー.第36回種生物学会シンポジウム「枝の伸び方から木の生き方が見える」、土浦国民宿舎水郷、土浦.

62. Ishihara M and Kikuzawa K. 2004年8月5日.Shoot dynamics in masting species Betula grossa at shoot, branch and individual levels. Ecological Society of America 89th meeting（第89回アメリカ生態学会）、Oregon Convention Center, Portland, Oregon, USA.

63. 石原正恵・菊沢喜八郎． 2002年3月26日. カンバ4種におけるシュート（長・短枝）の動態と繁殖． 第49回日本生態学会、東北大学、仙台．

シンポジウム・招待講演

1. 石原正恵(2023.11.19)「芦生研究林から見えてきた森里海連環学」フィールド科学教育研究センター創設20周年記念シンポジウム, 京都大学, 京都.

2. 石原正恵(2023.9.2)　「生物多様性と森林バイオマスのモニタリング観測におけるディジタル技術の活用と多様なステークホルダーとの協働」日本学術会議環境学委員会・地球惑星科学委員会合同FE・WCRP合同分科会 公開シンポジウム「陸域システムの持続性研究におけるGLPとディジタル技術の役割」, オンライン.

3. 石原正恵(2023.8.26) 「ブナ林に迫る危機と協働による保全」国天然記念物指定 100周年 記念シンポジウム 「和泉葛城山ブナ林 これまでの100年 これからの100年」, 大阪市立博物館, 大阪.

4. 石原正恵(2023.3.29)　「みんなで取り組む長期観測・データ公開・データ解析」森林計画学会春季シンポジウム「森林の長期計測とその課題」, ABO　HALL （ハイブリット), 名古屋市.

5. 石原正恵(2022.11.24)　「100年間、教育研究拠点を続けることから見えてきたこと―芦生研究林の事例―」, 小川試験地35周年記念シンポジウム「長期試験地を維持していく意味 ―小川試験地、これまで、これから―」, 東京大学 弥生講堂一条ホール（ハイブリッド開催）, 文京区.

6. 石原正恵(2022.2.28)　「研究者・市民・企業による生物多様性モニタリングと生物資源の持続的利用」京都市生物多様性プラン(2021-2030)の推進に係る活動交流会,京都信用金庫QUESTION 7F CREATIVE COMMONS, 京都市.

7. 石原正恵(2021.7.19)　「物言わず変わる森」京都大学カーボン・ニュートラル推進フォーラム　キックオフ・シンポジウム　－地球社会の調和ある共存に向けてー, 京都大学, 京都市.

8. Ishihara MI (2017.12.08) Pros and Cons of Ecotourism at the Ashiu Forest Research Station, Kyoto University. International Symposium on Utilization of Field Sites in Research and Education, Kyoto University, Kyoto.

9. 石原正恵 (2014.10.17) 石狩川流域46市町村における生態系サービスの歴史的変遷. 第63回北方森林学会シンポジウム「生態系サービスの評価を可視化・地図化する：理論から実践へ」，札幌コンベンションセンター，札幌.

10. Watanabe T, Ishihara MI, Shibata H. (2014.9.23) Drivers and Consequences of Changing Land Systems - Introduction to the Current Research at Hokkaido University. Taiwan-Japan-Thailand Pre GLP Asia 2014 Meeting, 国立東華大学, 台湾.

11. Ishihara MI, Yoshimura N, Fan M, Inoue T, Mishima Y, Hojo A, Nagasaka A, Ohno Y, Tuda T, Tsuji N, Shibata H. (2014.9.20) Synergies and tradeoffs among ecosystem services in Ishikari River watershed, Japan. “Symposium of comparative studies on social and environmental movements in Japan and Taiwan”, 国立中興大学, 台湾.

12. Ishihara MI (2014.6.3) EML document application-cases: Data paper. The 4th ILTER-EAP Information Management Training Workshop, University of the Philippines Diliman, Quezon city, Philippines .

13. Kassim AR, Ishihara MI (2014.6.4) Data Analysis Tool-R. The 4th ILTER-EAP Information Management Training Workshop, University of the Philippines Diliman, Quezon city, Philippines.

14. 石原正恵. (2013年4月17日). あなたも書けるデータペーパー. 北海道立環境科学研究センター講習会. 北海道立環境科学研究センター、札幌市.

その他発表

1. 石原正恵. 2024年5月16日. 「企業と大学の関係「協働・共創」は「連携」と何が違うのか？」. KDDI株式会社生物多様性勉強会、KDDI関西総支社、大阪市. 

2. 石原正恵. 2024年3月3日. 第4回美山×研究つながる集会 「地域を元気にするタネをみつける〜人口減少社会における担い手不足と向き合う〜」、京都丹波高原国定公園ビジターセンター 、南丹市（ハイブリット）.

3. 石原正恵. 2023年8月27日. 「芦生研究林でのシカによる生態系改変と回復に向けた取り組み」. 京都府立植物園・芦生生物相保全プロジェクト・京都大学フィールド科学教育研究センター芦生研究林 講演会「シカの食害による芦生の変化ときのこ相〜新たなモニタリングと協働」、京都府立植物園、京都市.

4. 石原正恵. 2023年4月23日.「芦生研究林の現状」. 芦生もりびと協会新人ガイド研修会、京都丹波高原国定公園ビジターセンター 、南丹市（オンライン）.

5. 石原正恵. 2023年2月28日.「人と自然のつながりを学ぶ森林フィールド」美山×研究つながる集会 大学と地域をつなぐッ！(第3回)（オンライン）

6. 石原正恵. 2023年1月18日.「芦生の森の生態系と保全にむけた超学際研究」. パナソニック・京都大学 「森里海連環学　基礎講座」、オンライン.

7. 石原正恵. 2022年12月10日.「豊かな森と里をめざして京都芦生における超学際研究」. シニア自然学校、此花会館、大阪市.

8. 石原正恵. 2022年9月2日.「芦生の森の生態系と保全」. 日本水環境学会流域物質動態とノンポイントソース研究委員会「ワークショップ in 京都・芦生研究林」、芦生研究林、南丹市.

9. 石原正恵. 2022年8月27日.「芦生の森の生態系と保全」. 緑の地球ネットワーク（GEN）なんでも勉強会、オンライン.

10. 石原正恵. 2022年8月21日. 「芦生研究林の概要と生物多様性モニタリング」. 芦生生物相保全プロジェクト・京都府立植物園・京都大学フィールド科学教育研究センター講演会「芦生の天然林と着生植物 －芦生の森を未来につなぐために－」、京都府立植物園、京都市.

11. 石原正恵. 2022年4月24日.「芦生研究林の現状」. 芦生もりびと協会新人ガイド研修会、京都丹波高原国定公園ビジターセンター 、南丹市.

12. 石原正恵. 2022年3月22日.「芦生研究林の概要」. 芦生研究林Open Science Meeting、オンライン.

13. 石原正恵. 2022年1月12日.「芦生の森の生態系と保全に向けた超学際的研究」. あいだの生態系研究所、オンライン.

14. 石原正恵、坂野上なお. 2021年12月19日. 「トチノキの保全と利用の両立を目指した芦生研究林と地域との対話」. ワークショップ「豊かな森と里の再生ー芦生の森と京・美山における地域と研究者の協働ー」、芦生研究林・京都丹波高原国定公園ビジターセンター・京都大学フィールド科学教育研究センター会議室・オンライン. 

15. 石原正恵. 2021年11月7日. 「芦生の森の恵み」. 森の京都「なんたん」カレッジ 公開講座、南丹市国際交流会館、南丹市.

16. 石原正恵. 2021年8月29日. 「芦生の森の100年間の変化」. 芦生生物相保全プロジェクト・京都府立植物園・京都大学フィールド科学教育研究センター講演会「芦生の森を未来につなぐために」、オンライン.

17. 石原正恵. 2021年8月12日. 「未来へつなぐ芦生研究林」. 京都大学芦生研究林１００周年記念「未来へつなぐ 写真展 講演会」、京都丹波高原国定公園ビジターセンター、南丹市.

18. 石原正恵. 2021年7月29日. 「シカの過採食を長期間うけた森林生態系の回復にむけて」. シカの脅威と次世代型森林再生のロードマップ研究集会、オンライン.

19. Ishihara M. 2021年6月10日. "Interdiciprinary and transdisciplinary approach to protect and restore degraded forest ecosystems from deer overgrazing." 55th FEFCO　第55回森林生態系機能コロキウム、オンライン.

20. 石原正恵. 2021年3月15日.「森と人：100年を振り返る 」. 研究林100周年記念式典・講演会、オンライン.

21. 石原正恵. 2020年9月8日.「芦生研究林の実情」. もりびと協会新人ガイド研修会、京都丹波高原国定公園ビジターセンター 、南丹市.

22. 石原正恵. 2020年6月28日.「森と台風，そして私達」 . 京都伝統文化の森推進協議会　文化的価値発信事業第28回公開セミナー「災害と森林」 、オンライン、京都市.

23. 石原正恵. 2018年11月10日.「長い目で森を観る」. 京都大学森林科学公開講座「森の達人・木の匠」、京都大学、京都市.

24. 石原正恵. 2018年8月26日.「芦生研究林について」. 芦生生物相保全プロジェクト公開成果報告会、京都府立植物園、京都市.

25. 石原正恵. 2018年8月25日.「芦生研究林の自然と教育研究」. 現代教育研究会、京都ゼミナールハウス、京都市.

26. 石原正恵. 2018年4月17日.「芦生研究林の実情」. もりびと協会新人ガイド研修会、京都大学芦生研究林、南丹市.

27. 石原正恵. 2018年3月28日.「産みっぱなし論文術」. 第129回日本森林学会、高知大学、高知.

28. 石原正恵. 2018年3月4日.「芦生研究林の概要」. 芦生研究林の植物写真展関連講演会、京都府立植物園、京都市

29. 石原正恵 2017年9月29日. 「芦生研究林の自然」放送大学京都学習センター「京都丹波高原国定公園」に関する公開講座「森の京都カレッジ、美山町自然文化村、南丹市.

30. 石原正恵 2016年11月19日. 「長期観測から見えてきた森の時間」京都大学フィールド科学教育研究センター・周南市連携講座、京都大学フィールド科学教育研究センター徳山試験地.

31. 石原正恵 2015年3月19日. 男女共同参画ランチョンフォーラム「 研究者のDual career 、何が問題？何が必要？」， 第62回日本生態学会、鹿児島大学、鹿児島.

32. Ishihara MI. & Suzuki SN. (2014.11.15) Inter- and intra-specific latitudinal variation in demographic rates. Forth Japan-Taiwan Ecological Workshop, Dong Hwa University, Taiwan.

33. Ishihara M (2014.11.6) Temporal and spatial variation in ecosystem services in Ishikari River watershed, Japan. 2nd Hiroshima International Symposium on Stainability Sciences, Hiroshima University, Higashi-Hiroshima, P9, Poster.

34. Ishihara MI, Kurokawa H, Aiba M, Onoda Y, Hiura, T. (2014.6.6) Species diversity and ecosystem functions in Japanese forests: examples using forest inventory, allometry, and functional trait databases. 2014 International Long Term Ecological Research East Asia Pacific Regional Network 10th Biennial Meeting, University of the Philippines Diliman, Quezon city, Philippines.

35. Ishihara MI, Utsugi H,Tanouchi H, Kurokawa H, Aiba M, Onoda Y, Hiura T. 2012年11月26日. Evaluating species diversity and ecosystem functions in Japanese forests from forest inventory and allometry database. Third Japan-Taiwan Ecological Workshop, Hokkaido University, Sapporo.

36. Ishihara M. 2011年11月5日. β diversity of tree species in Japan. 研究集会「森林、そして生態学の未来を描く～フィールドから理論への出発点～」、石川県立大学、野々市.

37. 石原正恵. 2009年10月6日. モニタリングサイト1000森林・草原調査における落葉広葉樹林の葉面積指数（LAI）の時空間変異. JaLTER All Scientist Meeting、プチホテル・ゾンタック、上田.

38. 石原正恵・豊田鮎. 2008年8月22日. 苫小牧研究林での生物多様性の長期観測 100年間の森林の変化をみつめよう.北海道大学苫小牧研究林市民講演会、北海道大学、苫小牧.

39. 石原正恵・豊田鮎. 2007年12月21日. モニタリングサイト1000森林分野. ワークショップ「生態学関連データベースにおける最近の動向と今後の展望」、総合地球環境学研究所、京都.