Analytic Resources

ネットワーク分析

TCS (http://darwin.uvigo.es/software/tcs.html)　

TCSBu (https://github.com/sairum/tcsBU) TCSで得た出力をこいつで整形

Network (http://www.fluxus-engineering.com/sharenet_rn.htm)　使いづらい（かも）

SplitsTree (http://www.splitstree.org/) 　機能が多様

PopArt (https://popart.maths.otago.ac.nz/download/)

空間的遺伝構造

空間分子分散分析　SAMOVA

Monmonierネットワークの作成　Monmonier algorithm

STRUCTURE

migrate

SpaGeDi

R package

BioGeoBEARS: 祖先種の分布域を推定　集団の分化プロセス(dispersal, vicariance)を加味できる。詳細な解説本が2023年春に出版予定。

Wombling

Delauney triangle

Voronoi diagram

GENELAND

ade4

集団遺伝学 Population Genetics

Executable programs

Arlequin

DNAsp

Popgene

R package

大規模データ処理

形態測定学 Morphometrics