お役立ちサイト

研究活動などに役立つWebサイト・ソフトをまとめています。ひっそりと書き溜めていましたが、リクエストでweb上に公開することになりました。あくまでも個人用のまとめです。

AI関連

2023年から爆発的に生まれた数々のプロダクト。進化が早すぎて、時々でベストなものが変わる。自分で色々試してみるしかない。

• 天秤AI　複数のAIの出力を比較→好きなモデルを吟味できる。

• Chat GPT

• Genspark

• Gemini

• NotebookLM

• Naplin AI

• Elict

• perplexity

• Dataset Search (google.com) 

• Manus AI

• Skills: Research Paper Writing　各AIのプロンプト

• AutoResearchClaw

• OpenClaw

分析・解析

• 前処理

  • EmEditor – Windows用テキストエディター ：csvファイルの編集など

  • Powerpointで作った図を高画質で出力する方法

  • DPI Converter — Change DPI of Image Online, Instantly :写真やイラストのDPIを変更できる。DPIを減らしたい時に便利。

  • 切り取りアプリ / ラスタデータ配信サービス (affrc.go.jp) : 研究対象地域のDEMデータを切り出せる。サクッと処理したいときに便利。

• 地理情報システム/空間統計学

  • ジオグラフィカ(geographica.biz) : スマホの位置情報データを記録する。低精度で問題なければこれが一番便利。

  • Google Earth：位置データの展開と閲覧 

  • QGIS

    • Web経由でタイルをQGIS上に描画する方法

    • 地理院地図

    • 全国森林資源メッシュマップタイル　20mメッシュ単位の森林情報

    • MERIT DEM　標高補正したDEMデータタイル

  • GS＋:有料（2万円くらい）だが、モラン統計量、セミバリオグラム、クリキング作成ができる。

  • Point Process Analysis (takenaka-akio.org)：点群データの空間分布パターン解析プログラム 

  • GeoDa: Excel like UIな地理情報解析ソフト。フリー。モラン統計量を地区ベースかつ地図化して出力できる。

    • 空間分析におけるスケール · GIS実習オープン教材 (gis-oer.github.io) 

• 画像処理・画像解析

  • Fiji (imagej.net) ：画像解析全般。

  • .Metafile to EPS Converter：epsファイルへの変換

    • PowerPoint上に図を添付→「図として保存」→.emfで保存→ ソフト介してepsに変換　※ジェネリックな作り方です。GSviewとか使うのが一番確実です。

  • 樹冠/葉形態分析

    • lia32 (nagoya-u.ac.jp) : LMAやLAIなど分析できる。日本語なのが嬉しい。

    • Gap Light Analyzer (GLA) (caryinstitute.org) : lia 32と同じ林冠・葉分析ソフト。2021年現在アップデートされているので、lia 32の動作が不安な時はこっち。

• 数理統計/解析/グラフィックソフト

  • RStudio | Open source & professional software for data science teams - RStudio ：Rの実行環境。

    • GitHub - krzjoa/awesome-r-dataviz: Curated resources about Data Visualization, Drawing & Publishing in R :データ可視化に特化したパッケージ集

      • spatstatパッケージ：樹木分布パターンの解析

    • 最近は、基礎的な文法は抑えつつも生成AIに聞くほうが早いかも。

      • R Markdown クックブック (gedevan-aleksizde.github.io) 

      • The Complete ggplot2 Tutorial - Part1 | Introduction To ggplot2 (Full R code) (r-statistics.co) :ggplotのレシピ

      • From data to Viz | Find the graphic you need (data-to-viz.com) 

  • Rに習熟してから下のソフトは使用しなくなった。

    • • tableau：長データ（時間データ等）の取り扱いに長けている印象がある。特にtableau prepを使うとで視覚的にデータをフィルタリングできるので便利。学生は無料なのも良い。まずこれで簡単にグラフ作成をして、本格的に作図をする場合は別のソフトで行うのが良いかも。

      • jamovi：RをベースにしたExcel likeソフト。扱える分析の数や図の編集など痒い所に手が届いていないが、Rでの分析をExcel風に扱えるため非常にわかりやすく、今後のアップデートに期待。

      • JASP - A Fresh Way to Do Statistics (jasp-stats.org) :図表をリサイズ可能。SEM分析できるのもありがたい。jamoviが超絶アップデートされるまではJASPのほうが良いかも。

      • HAD:Excelマクロで作成された統計解析ソフト。出力した図の微調整をエクセルベースでできる点に強みがある。 

      • KyPlot ：Excel like UIで、かつExcelにない統計検定やグラフ作成ができる。まずこれで簡単に検定やグラフ作成をしてみて、本格的に検定や作図をする場合は別のソフトで行うのが良いかも。

統計・ソフトのお勉強

• 統計

  • 「データ分析のための統計学入門」和訳 ：http://www.kunitomo-lab.sakura.ne.jp/2021-3-3Open(S).pdf 

  • 統計学 2 - 矢内 勇生 (yukiyanai.github.io) 

  • Chapter.0 疫学のための確率の基礎（『Causal Inference: What If』勉強会） - YouTube 

  • 数値データの取り扱い (uribo.github.io) 

• ソフト

  • LiDRパッケージ（https://r-lidar.github.io/lidRbook/）点群データの処理

  • 卒業論文のためのR入門 (tomoecon.github.io) 

  • Kyoto University Research Information Repository: プログラミング演習 Python 2019 (kyoto-u.ac.jp) 

• その他

  • 森林の流量推定ツール　https://shinrin-seminar.jp/