利用核磁共振的機器去分析蛋白質結構。將蛋白質樣品放入儀器,並透過儀器所標定的各個點之間的距離分析蛋白質的結構。實驗室中共有三台不同頻率的核磁共振機器,儀器中氫原子核吸收及發射的頻率越高,則越利於分析蛋白質的結構。核磁共振光譜可分為一維、二維、三維,其中又可分為TOCSY(測量鍵結關係)和NOESY(測量距離關係)。
化學位移是指在各式各樣的有機分子中,質子受到的屏蔽效應之程度不同,使它們於核磁共振譜上的吸收峰位置不盡相同。通常,化學位移的位置和數量可以診斷分子的結構。化學位移也用於描述其他形式的光譜學中的信號,例如光電發射光譜學。然而,由於其受屏蔽效應所造成的影響過小,使測量其正確絕對值難以非常精確。
利用TOCSY和NOESY疊圖進行分析。
TOCSY顯示的是鍵結之間的關係,而胺基酸第一個N上的H常常被水解,因此在光譜上看不見第一個N上的H。
找出第一的標記後,水平或鉛直地向上下左右四個方向連接,以找出下一個標記的位置。
遇到較複雜的標記圖形時,須注意是否有標記重疊的情況,以免找不出正確的標記順序。
TOCSY是二維核磁共振頻譜表中的一種技術,也是歷史上第一項二維NMR實驗方法。
NOESY譜與TOCSY相似,皆擁有呈對角線的峰以及交叉峰。然,NOESY中的交叉峰反映出二個核音的空間距離關係而非通過化學鍵相連的關係,NOESY譜中通常還有多餘無用的軸峰,不過可藉由在差異實驗中反轉第一個脈衝的相來消除。