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ランチョン勉強会

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Are you a king? 星取表

Are you a king?

データ解析お役立ちリンク

PANTHER: 手軽なGO term analyses

NextBio/Correlation Engine: Illuminaが提供している高次解析ツール

GSEA: 発現変動エンリッチメント解析(少し面倒)

DAVID: 発現変動エンリッチメント解析(お手軽)

GeneMANIA: 遺伝子制御の相関解析(お手軽)

株式会社セルイノベーターによる遺伝子発現解析手法とツールの紹介

Heavy WatalさんのRの使い方スライド



超解像顕微鏡関連

FISHイメージの超解像顕微鏡観察のコツ (Japanese)

- FISH関連試薬・ツールのカタログ#など

- 高感度RNA FISHの簡易プロトコール

- カバーガラスの準備

- 超解像観察用の蛍光色素

- "Can Get Signals"によるシグナル増感

- TDEによるマウント法

- .cziファイルをMacOSで開く


サルでもできるなんちゃって次世代シークエンス解析

- NGSデータをIGVブラウザで見るまで

- bamファイルから塩基組成の割合をカウント


NGS関連/R関連有用外部サイト

- 基礎生物学研究所情報管理解析室のコマンド解説

- biopnpyrus生物統計学入門

- biopnpyrusバイオインフォマティックス入門

- Linuxコマンドラインの使い方

- Up-to-date RNA-Seq Analysis Training/Courses/Papers (Oct 2016) from Biostars

- わかりやすいRの使い方解説 (David Robinson)

- ggplotの解説

顕微鏡イメージ解析

- wndchrmの使い方(1)イントロ編

- wndchrmの使い方(2)インストール編

- wndchrmの使い方(3)実行編


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新学術領域ノンコーディングRNAネオタクソノミ公式HP (Japanese)

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