Els bioindicadors són organismes (plantes, microorganismes, animals, etc.) utilitzats per avaluar o observar l'estat de l’ecosistema. Els canvis en la diversitat o la població poden reflectir l'existència o l'augment de la contaminació o qualsevol altre factor que pugui fer mal a l'equilibri de l'ecosistema natural.
Algunes vegades les puces d'aigua poden ser usades en certs ambients per provar els efectes de toxines a l'ecosistema, convertint-les en espècies indicadores, particularment útils a l'àrea, a causa del seu curt cicle de vida i capacitats reproductives. Com que els òrgans interns són pràcticament translúcids, són fàcils d'estudiar en espècimens vius i es poden apreciar els efectes de la temperatura en aquests organismes ectodèrmics. Les daphnies generalment són fetes servir en l'alimentació de capgrossos i altres espècies d'amfibis, com la granota nana africana (Hymenochirus biettgeri), i són també populars en l'alimentació de peixos tropicals i aquàtics.
La Daphnia és utilitzada com a bioindicador ambiental d'efluents dulciacuícoles en assajos ecotoxicològics, però els sistemes de cultiu tradicionals poden resultar costosos, per la qual cosa s'ha desenvolupat un nou mitjà de cultiu.