มีจำนวน 2 โครงการ ดังนี้

1. โครงการส่งเสริมความสามารถและทักษะทางวิชาการของนักเรียน

2. โครงการส่งเสริมระบบบริหารจัดการคุณภาพสถานศึกษา สำนักงานหลักสูตรและพัฒนาการเรียนรู้

มีจำนวน 6 โครงการ ดังนี้

1. โครงการส่งเสริมระบบบริหารจัดการคุณภาพสถานศึกษา สำนักงานส่งเสริมคุณภาพการศึกษา 

2. โครงการ ส่งเสริมความสามารถในการอ่าน การเขียน การสื่อสาร ด้านภาษา ( ห้องสมุด )

3. โครงการ ส่งเสริมให้ผู้เรียนมีคุณลักษณะและค่านิยมที่ดี ตามที่สถานศึกษากำหนด กิจกรรมพัฒนาผู้เรียน

4. โครงการ วิทยาศาสตร์พลังสิบ ศูนย์โรงเรียนมุกดาหาร

5. โครงการจัดซื้อหนังสือเรียนสาระการเรียนรู้พื้นฐาน 8 กลุ่มสาระการเรียนรู้

6. โครงการส่งเสริมยกระดับผลสัมฤทธิ์ทางการเรียนนักเรียนโครงการห้องเรียนประกายมุก