มีจำนวน 9 โครงการ ดังนี้

1. พัฒนางานธุรการ

2. พัฒนางานอำนวยการ

3. การจัดทำข้อมูลสารสนเทศ

4. ทัศนศึกษา

5. พัฒนางานจัดระบบควบคุมภายใน

6. พัฒนาประสานงานการจัดการศึกษาในระบบ นอกระบบ และตามอัธยาศัย

7. ประสานงานจัดการส่วนราชการส่วนภูมิภาคและส่วนท้องถิ่น

8. ความสัมพันธ์กับชุมชน 

9. วันคล้ายวันสถาปนาโรงเรียนมุกดาหาร

มีจำนวน 8 โครงการ ดังนี้

1. พัฒนาระบบเครือข่ายอินเทอร์เน็ตไร้สาย

2. ซ่อมบำรุงระบบเครือข่ายอินเทอร์เน็ต 

3. พัฒนางานประชาสัมพันธ์โรงเรียนมุกดาหาร

4. พัฒนาแหล่งเรียนรู้และสิ่งแวดล้อม

5. จัดจ้างบุคลากรที่ปฏิบัติงานในสถานศึกษา

6. ส่งเสริมโภชนาการโรงอาหารและ อย.น้อย

7. การบริการสุขภาพ

8. พัฒนาอาคารโรงอาหาร