มีจำนวน  2 โครงการ ดังนี้

1.พัฒนาระบบงานบุคคล

2. พัฒนาผู้บริหาร  ครูและบุคลากรทางการศึกษาสู่มาตรฐานสากล

มีจำนวน  9 โครงการ ดังนี้

1.พัฒนาสำนักงานกิจการนักเรียน 

2. ประกันคุณภาพการบริหารจัดงานระบบดูแลช่วยเหลือนักเรียน 

3. ป้องกันและแก้ไขปัญหายาเสพติดในสถานศึกษา

4. ส่งเสริมประชาธิปไตยในโรงเรียน

5. ส่งเสริมกิจกรรมนักเรียน

6. สร้างความรู้ความเข้าใจป้องกันอุบัติเหตุ อุบัติภัย ความปลอดภัยในการจราจร

7. รณรงค์ป้องกันและแก้ไขปัญหายาเสพติด TO BE NUMBER ONE

8. พัฒนาคุณธรรม จริยธรรม คุณลักษณะอันพึงประสงค์ ด้วยคุณธรรม “รักเหนือรัก”ในระดับศีล 5 บนพื้นฐานตามหลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียง

9. ขับเคลื่อนศูนย์ครอบครัวพอเพียง โรงเรียนมุกดาหาร สู่สถานศึกษาและชุมชน