Fundado dia 23 de agosto de 2007, o CAEM foi criado com o intuito de representar os alunos de Medicina da Universidade Federal do Tocantins, defender seus interesses e incentivar uma melhoria na estrutura e qualidade do ensino médico. O Centro Acadêmico foi nomeado de Eduardo Manzano, em homenagem a um expoente médico da região.

O Dr. Eduardo Manzano juntamente com sua esposa Dra. Heloísa Manzano, ambos da mesma turma da USP, tinham um imenso sentimento social e queriam ajudar comunidades realmente necessitadas. Em 1968, Porto Nacional no Tocantins era assolado por doenças infecciosas e carecia de uma assistência médica adequada. Assim, o casal decidiu vir para Porto, fundaram a ONG Comsaúde, e mantêm vários projetos: um ambulatório, com serviço de referência para hanseníase, um hospital de câncer, uma escola agrícola, o centro de recuperação nutricional e projetos de resgate de cultura popular. Tudo com a ajuda de parceiros do mundo inteiro: Itália, Alemanha, Noruega. Um centro de artes e artesanatos foi construído com recursos de uma única família da Noruega. É a sede do grupo Tambores do Tocantins. Hoje, somos orgulhosos de ter tamanha história por trás do nosso curso de Medicina.