陽明大學在籌建附設醫院的過程中，面臨諸多挑戰：

挑戰一：一砍再砍的經費

蘭陽院區籌設可謂一波三折，從最早編列63億預算，經行政院核定為49億，最後被立法院大幅刪減為20億，僅能維持區域教學醫院規模。2011年第一期工程啟動，建設期間又遇缺工問題導致工程延宕。在有限資源下，蘭陽院區在2016年終於完工啟用，提供急重症醫療服務。因預算刪減未能達成的醫學中心規模，計畫透過後續二期工程補足。

挑戰二：大病院拆除危機

2010年，立法院決議蘭陽院區完工後須關閉新民院區並歸還土地。為守護新民院區，第二任院長羅世薰積極奔走，針對宜蘭高齡長照需求，結合教研規劃四大中心：「弱勢與特殊需求者照護醫療中心」、「失智症照護及技術發展中心」、「科技輔具與科技照護訓練中心」、以及「銀髮健康管理暨專業人才培訓認證中心」，成功守住這塊代表宜蘭大病院歷史的土地。

陽明附醫在穩守根基的同時，亦持續推動蘭陽地區醫療進步，邁向新紀元。 

教學方面，有別於都會區醫學中心專科化訓練，陽明附醫提供整合性實習課程，讓學生在臨床訓練之餘，也能走出白色巨塔，深入偏鄉和原住民部落，找回行醫初衷。2012年起推動「健康活樂宜蘭市計畫」，由陽明大學學生組成「陽明十字軍宜蘭隊」，暑假期間與院內「社區天使隊」攜手關懷訪視65歲以上長者，投入社區預防醫學服務。歷經多年努力深耕蘭陽地區，2016年完成宜蘭市38個里第一次訪視，共拜訪11,268位長者，完成4,083份問卷。

陽明附醫後續依據追蹤資料進行社區醫學研究，並以「在地健康老化」為目標，規劃多元社區長照服務，如成立「宜蘭縣失智共同照護中心」、辦理社區樂齡健康促進活動「銀髮躍進、樂活宜蘭計畫」等。