本校自民國62年即成立心理衛生中心，自67學年度奉教育部令，指定本校為『北區大專院校輔導工作推展示範學校』，由國立師範大學教育心理系協助與輔導，因此本中心又成立輔導工成委員會，並改名為『健康輔導中心』以加強各項輔導工作，後來經過教育部訓育委員員會開會決定（71.5.13台（71）訓字第15654號），正式更名為『學生輔導中心』並延用至今。

民國92年依據「教育部大專校院輔導身心障礙學生實施要點」成立資源教室，服務領有身心障礙手冊或鑑輔會鑑定為身心障礙者之本校學生，提供適應輔導服務，由學生輔導中心主任擔任督導工作。

依據服務對象本中心分設兩組：

學輔中心：負責本校學生心理衛生健康促進及心理諮商輔導工作。

資源教室：負責本校特教生之校園生活適應、考試課程調整及轉銜輔導等支持服務。

自99學年度起，為配合校內行政組織整合，原新竹校區學務組之輔導業務整併至學生輔導中心統籌兩校區學生之心理輔導工作，俾利兩校區輔導人力及資源更能彈性及專業的運用。