土佐南中学校には部活動が５つ（野球部・バレーボール部・男子バスケットボール部・女子バスケットボール部・吹奏楽部）ありますので紹介します。
土佐南中学校部活動活動方針はこちら ⇒ 部活動活動方針
野球部は、３年生が５名、１年生が１名の合計６名で活動しています
バレーボール部は、３年生３名、２年生１名 １年生３名の合計７名で活動しています。
男子バスケットボール部は、３年生４名、２年生３名、1年生３名の合計１０名で活動しています。
女子バスケットボール部女子は、３年生３名、１年生２名の合計５名で活動しています。
吹奏楽部は、3年生２名、２年生３名、１年生３名の計８名で活動しています。