Para el correcto funcionamiento del centro, este se divide en diferentes departamentos repartidos en un total de cuatro áreas según las diferentes competencias educativas, así como otra área transversal que da servicio a la estructura orgánica de la institución mediante diferentes órganos de coordinación docente. Con todo ello, podemos encontrar:
Departamento de Lengua Castellana y Literatura
Departamento de Inglés
Departamento de Francés
Departamento de Cultura Clásica, Latín y Griego
Departamento de Ciencias Sociales, Geografía e Historia
Departamento de Filosofía
Departamento de Matemáticas
Departamento de Biología y Geología
Departamento de Física y Química
Departamento de Tecnología
Departamento de Educación Plástica
Departamento de Música
Departamento de Educación Física
Departamento de Economía y Formación y Orientación Laboral
Departamento de Actividades Físicas en el Medio Natural
Departamento de Actividades Agrarias
Departamento de Informática y Comunicación
Departamento de Orientación
Departamento de Formación, Evaluación e Innovación Educativa
Departamento de Prevención, Seguimiento y Control del Absentismo Escolar