O Núcleo de Estudos Afro-brasileiros e Indígenas no Colégio Pedro II (NeabiCP2) foi fundado no ano de 2013, instituído pela portaria 1934, de 8 de novembro de 2013 do Colégio, e é vinculado à Pró-Reitoria de Pós-Graduação, Pesquisa, Extensão e Cultura do Colégio Pedro II (PROPGPEC/CPII) pela portaria 3.764, de 11 de junho de 2014.
O NeabiCP2 é composto por docentes dos Departamentos de Anos Iniciais do Ensino Fundamental, Educação Física, Educação Infantil, Educação Musical, Filosofia, Geografia, História, Informática Educativa, Português e Literaturas de Língua Portuguesa, entre outros, e por técnicos em assuntos educacionais que atuam na Assistência Estudantil, no Setor de Orientação Educacional e Pedagógica, entre outros, desenvolvendo suas atividades nos diferentes campi do Colégio.
O NeabiCP2 desenvolve atividades de ensino, pesquisa, extensão e cultura. Realiza a Especialização em Educação das Relações Étnico-Raciais no Ensino Básico (Ererebá) e, em parceria com o Departamento de História, a Especialização em Ensino de História da África, cursos de pós-graduação lato sensu. Também participa e desenvolve atividades de formação docente e de ensino nos campi do Colégio.
Sua atuação também se destaca na proposição de políticas de ações afirmativas e de propostas institucionais de combate ao racismo.