Módulo Bioinformática Microbiana

Como parte del curso UNU-BIOLAC, en este módulo se pretende enseñar de manera sencilla a poder realizar los análisis bioinformáticos más comunes. No pretende al usuario enseñarle a manejarse dentro de un ambiente linux y es deseable tener nociones básica de línea de comandos.

Está diseñado para ser realizado en una imagen virtual disponible ya que ésta tiene precargados los programas, scripts y bases de datos que se utilizarán, por lo que hay primero que instalarla.

Este minicurso consta de tres tipos de análisis:

1. amplicons 16S

2. metagenomas y

3. ensamble del genoma del virus SARS-Cov2 de COVID.

Ejercicios

1. Instalación de la imagen virtual

2. Análisis de amplicones del gen ribosomal 16S región V4

3. Visualización y análisis de OTUs

4. Clasificación taxonómica de metagenomas

5. Análisis de metagenomas

6. Ensamble del genoma del virus SARS-Cov2 (COVID)