La Institució Vil·la Joana compta amb un equip interdisciplinar. 

L’equip d’atenció interna està format per educadors, mestres d’educació especial amb una funció tutorial, mestres especialitzats en diferents disciplines que donen un suport específic i, en molts casos, de forma individual (psicomotricista, mestra d’audició i llenguatge, mestra de música, mediadora artística, mestres individuals i un mestre de fusteria). 

El CEE Vil·la Joana compta amb diversos psicòlegs amb formació clínica d’orientació psicodinàmica, tres dels quals són referents de les Unitats d’Atenció Interna. A més comptem amb una psicòloga que ofereix sessions de psicoteràpia individual a alguns alumnes.

Per altra banda molts dels alumnes i les seves famílies presenten la necessitat d’un treball social intensiu, es per això que comptem amb un Equip d'intervenció social que s'encarrega de dur a terme un acompanyament integral en la recerca d’eines i recursos fora de la institució, als diferents barris de cada alumne intentant facilitar la integració de l'infant en el seu entorn.  També s'encarreguen de crear una xarxa de recursos i de donar a conèixer la situació dels nostres infants.

També formen part de l’equip el personal d’administració i serveis, i el personal de cuina i de neteja.

Els alumnes i les seves famílies tenen a la seva disposició un servei extern gratuït de monitors d’acompanyament per aquells que vulguin, puguin i ho necessitin entre el Baixador de Vallvidrera i la Plaça Catalunya, fent servir la xarxa dels Ferrocarrils de la Generalitat. Si bé ve aquest servei és extern al centre, hi ha una coordinació intensa amb l’equip educatiu, clínic i directiu del centre.