Puolevaltuusto toimii puoluekokousten välillä puolueen korkeimpana poliittisena linjanvetäjänä. Valtuusto hyväksyy periaateohjelmaa ja poliittista ohjelmaa lukuunottamatta kaikki Vihreiden poliittisia kantoja määrittävät ohjelmapaperit, joissa määritellään mitä mieltä puolue on ohjelman käsittelemästä aihepiiristä. Lisäksi puoluevaltuusto päättää puolueen budjetista ja toimintasuunnitelmasta, sekä hyväksyy puolueen uudet jäsenyhdistykset. Valtuuskunnan koko on 43 jäsentä ja se edustaa laajasti puolueen jäsenistöä.
Puoluevaltuusto kokoontuu vuoden aikana neljästi. Kokoukset ovat pääsääntöisesti yleisölle avoimia, joten paikallisia vihreitä ja kiinnostuneita voi kutsua seuraamaan kokousta. Valtuuskunnan kokouksia voi seurata netissä: www.vihreat.fi/live. Kokouksesta viestitään puolueen somessa ja niistä jää myös tallenteet em. osoitteeseen.
Ennen kokousta valtuuston edustajat järjestävät omilla alueillaan ja järjestöissään livenä tai netissä tilaisuuksia keskustella ja kommentoida valtuuston käsittelyssä olevia aiheita, ohjelmia ja linjauksia. Edustajat yleensä raportoivat myös kokousten jälkeen.
Kaikilla puolueen jäsenillä on oikeus tehdä muutosehdotuksia puolueen ohjelmiin, eli ehdottaa päivityksiä puolueen ajamaan politiikkaan, ennen valtuuston kokouksia. Muutosesityksiä ei voi tehdä puoluekokouksen linjauksiin, kuten periaateohjelmaan. Muutosesitykseen tarvitaan 4 puolueen jäsentä, ne tulee kohdistaa tiettyyn ohjelman kohtaan ja perustella mahdollisimman hyvin. Muutosehdotusaika alkaa kaksi kuukautta ja päättyy kuukautta ennen valtuuston kokousta.
Kokousten ajankohdat ja tarkempi asiasisältö päivitetään sivulle www.vihreat.fi/kalenteri.
Puoluehallitus johtaa puolueen käytännön toimintaa. Se ohjaa puoluetoimiston työtä, päättää taloudesta ja hallinnosta sekä ottaa kantaa päivänpoliittisiin kysymyksiin. Hallitus kokoontuu noin joka neljäs viikko. Kokousten jälkeen hallintopäällikkö toimittaa Vyyhti-jakelulla päätösluettelon kokouksen tekemistä päätöksistä.
Puoluehallitukseen kuuluu 16 jäsentä: puolueen puheenjohtaja, kolme varapuheenjohtajaa sekä 12 muuta jäsentä henkilökohtaisine varajäsenineen. Puoluehallituksen muut jäsenet edustavat omia piirijärjestöjään tai muita puolueen jäseniä laajasti yhdistäviä tahoja, kuten Vihreitä nuoria, Vihreitä naisia tai Viitteen (Tieteen ja teknologian vihreät) jäseniä.
Puoluehallituksen jäsenten lähin kontakti järjestökentällä on oma piiri- tai liittohallitus, jonka kautta tiedon pitäisi kulkea molempiin suuntiin. Oma puoluehallituksen jäsen kannattaa kutsua joskus kertomaan puolueen ja politiikan ajankohtaisista asioista omaan yhdistykseen, paikanpäälle tai etänä.
Puoluehallitus asettaa työryhmiä, joiden tehtävänä yleensä on toimia puoluejohdon työtä tukevina asiantuntijaryhminä mm. seuraamalla oman toimialansa ajankohtaisia politiikkakysymyksiä ja tarvittaessa valmistelemalla pohjapapereita puoluehallitukselle, -valtuustolle, eduskuntaryhmälle tai puolueen viestinnälle.
Kokousten ajankohdat päivitetään sivulle www.vihreat.fi/kalenteri.