Esta ciudad portuaria fue el asentamiento más occidental de la cultura maya y estuvo ocupada por un lapso de poco más de 1000 años. Su arquitectura de tierra se distingue por estar cubierta con ladrillos y estuco de cal de concha de ostión. 

• En Comalcalco se descubrió el entierro del sacerdote Aj Pakal Than, quien vivió en el sitio a finales del siglo VIII d.C. Su ofrenda incluía pendientes de hueso y espinas de cola de raya con 280 glifos incisos, en los que se refieren ceremonias a los dioses de la lluvia, datos únicos en la historia maya conocida hasta ahora.

• En la escalera central del Templo VI existe una escultura modelada en estuco que representa al dios Itzamná, creador del universo.

• Tres de sus templos tienen una cripta abovedada al interior del basamento sobre el que están edificados, mostrando su doble función de tumba y templo.