〇Yuika Ueda and Shinji Deguchi. "Adaptive flexibility of cytoskeletal structures through nonequilibrium entropy production" arXiv preprint arXiv:2411.14291 (2024). [link]
〇Yuika Ueda and Shinji Deguchi. "Intracellular order formation through stepwise phase transitions." arXiv preprint arXiv:2408.14242 (2024). [link]
〇Yuika Ueda and Shinji Deguchi. "Nonthermal driving forces in cells revealed by nonequilibrium fluctuations." arXiv preprint arXiv:2408.06683 (2024). [link]
〇Yuika Ueda and Shinji Deguchi. "Adaptive flexibility of cytoskeletal structures through nonequilibrium entropy production" BioSystems (2025): 105594. [link]
〇Yuika Ueda, Daiki Matsunaga, and Shinji Deguchi. "Asymmetric response emerges between creation and disintegration of force-bearing subcellular structures as revealed by percolation analysis." Integrative Biology 16, zyae012, 2024 [link]
〇Yuika Ueda and Shinji Deguchi. "Emergence of multiple set-points of cellular homeostatic tension" Journal of Biomechanics 151 (2023): 111543 [link]
〇Yuika Ueda, Daiki Matsunaga, and Shinji Deguchi. "A statistical mechanics model for determining the length distribution of actin filaments under cellular tensional homeostasis" Scientific Reports 12 (2022): 14466. [link]
〇上田唯花,中島桜太,塩飽大翔,齋藤匠,出口真次.”非平衡ゆらぎ解析に基づく細胞内動的駆動力・適応機能の定量測定法 ”,第64回日本生体医工学会,2025年6月5日-7日(OS「細胞機能の最前線解析技術」招待講演)
〇Yuika Ueda. "Thermodynamics and statistical mechanics approach to cellular homeostasis and adaptability." The 16th HOPE Meeting with Nobel Laureates, March 9-13, 2025.(審査あり・ノーベル賞受賞者達との1週間の国際会議・22名の日本側代表の一人として参加)
〇上田唯花,出口真次.” Thermodynamics and statistical mechanics approach to cellular homeostasis and adaptability” , 2024年11月26-29日.(公募シンポジウム"システム生物学大反省会"採択)
〇Yuika Ueda, "Thermodynamics and statistical mechanics approach to cellular homeostasis and adaptability", Biophysical seminar ISSP, University Tokyo. Nov. 22th 2024(招待講演)
〇Yuika Ueda, Shinji Deguchi. “Thermodynamics and statistical mechanics approach to cellular tensional homeostasis” The 52nd Naito Conference, October 1-4 2024 (審査有り,nominated by the organizing committee as a short talk speaker)
〇上田唯花,出口真次.”細胞の適応的相転移に関する熱統計力学” 2024年度日本数理生物学会年会,2024年9月11-13日
〇Yuika Ueda, ”Thermodynamics and Statistical Mechanics on Cellular Adaptation and Homeostasis ” 1st CHILE-JAPAN Mechanobiology Workshop, July 30th-August 8th, 2024
〇Yuika Ueda, Shinji Deguchi. “Physics of ECM-mediated cellular phase transitions and its implication in EMT” 3rd Multimodal ECM Meeting,July 24-26 , 2024
〇Shinji Deguchi, Yuika Ueda, ”Statistical mechanics approach to cell-substrate interactions”, IUPAB 2024 – 21st IUPAB & 62nd BSJ Joint Congress 2024, Kyoto International Conference Center, June 24-28, 2024
〇上田唯花,出口真次.“生命階層のマクロとミクロを繋ぐ熱統計力学” 第36回バイオエンジニアリング講演会,2024年5月11-12日.(シンポジウム招待講演)
〇上田唯花,出口真次.“細胞の相転移現象に関する熱統計力学” 第34回バイオフロンティア講演会,2023年12月16-17日
〇出口真次,上田唯花,松永大樹.“細胞張力ホメオスタシスの熱・統計力学” 第34回バイオエンジニアリング講演会,2022年6月25-26日
〇出口真次,上田唯花,松永大樹.“細胞張力ホメオスタシスの熱・統計力学” 第34回バイオエンジニアリング講演会,2022年6月25-26日
〇上田唯花,松永大樹,松井翼,出口真次.“細胞内における張力ホメオスタシスのメカニズムに関する理論的考察” 第33回バイオエンジニアリング講演会,2021年6月25-26日
〇出口真次,上田唯花,松井翼,松永大樹.“ストレスファイバーの熱力学” 第33回バイオエンジニアリング講演会,2021年6月25-26日
〇Yuika Ueda, Daiki Matsunaga, Tsubasa S. Matsui, Shinji Deguchi. “Theoretical consideration of homeostasis in stress fibers” 第58回日本生物物理学会年会,2020年9月16-18日
〇上田唯花,松永大樹,松井翼,出口真次.“ストレスファイバーにおける張力ホメオスタシスのメカニズムに関する研究” 第33回バイオエンジニアリング講演会,2020年6月13-14日(新型コロナウイルス流行により同講演会第33回は2021年と併せて開催された.2020年の採択原稿は公式に「査読あり発表」扱いとされた)
〇上田唯花,松永大樹,松井翼,出口真次.“ストレスファイバーにおける張力ホメオスタシスに関する考察” 日本機械学会関西学生会卒業研究発表会,2020年3月10日
〇上田唯花,松永大樹,松井翼,出口真次.“ストレスファイバーにおける張力ホメオスタシスのメカニズムに関する熱力学的考察” 第32回バイオエンジニアリング講演会,2019年12月20-21日
第16回 日本学術振興会 育志賞
2026 Biophysical Society Annual Meeting, Travel Award
日本機械学会第37回バイオエンジニアリング講演会優秀ポスター表彰
The 52nd Naito Conference Poster Award for Excellence, 〇Yuika Ueda, Shinji Deguchi, October 2024
2024年度日本機械学会女性未来賞 (The Japan Society of Mechanical Engineers), "Mechanisms of cellular mechanical homeostasis and adaptation ", 2024
2025年6月~12月,University College London, London Centre for Nanotechnology, Visiting reseacherとして研究留学
2025年3月,日本学術振興会16th HOPE Meetings with Nobel Laureates Fellow
2024年12月,内藤記念財団115号時報寄稿
2024年12月,University College London Mechanical Engineering Ultrasonics Groupにて短期研究留学
〇上田唯花,ハンダイ理工系女子フェア講演,2020年11月
〇上田唯花,ハンダイ理工系女子フェア講演,2019年11月