自行開車

（一）中山高：內湖成功路交流道出口下，往內湖方向往北走，直行至民權東路與成功路交叉口後，右轉約500公尺左側至本學院。

（二）北二高：汐止系統接中山高南下（臺北、內湖）方向，在內湖成功路交流道出口下，往內湖方向往北走，直行至民權東路與成功路交叉口，右轉約500公尺左側至本學院。

搭乘鐵路或高鐵

（一）臺北站（台鐵、高鐵）：可搭乘捷運板南線（藍線）至昆陽站，下車後搭乘計程車前往國防醫學院（車資約100元）； 或於昆陽站轉乘藍36路線公車至本學院、284、藍20路線公車至三軍總醫院。

（二）松山站（台鐵）：可於八德路四段搭乘28路線公車，或於松山路上搭乘284、286路線公車至三軍總醫院。

（三）南港站（台鐵、高鐵）：可於南港路一段搭乘民權幹線（原紅32）公車至本學院。

搭乘公車

（一）國防醫學院周邊公車：民權幹線（原紅32）、藍36、284直、617、645、903（於「國防醫學院（網球中心）」下車，步行 約5分鐘）。

（二）三軍總醫院周邊公車：市民小巴10、小3、藍20、藍27、棕9、214、256、278、284、551、617、630、645、652、903（請於「國防醫學中心」下車，步行約10分鐘）。

（三）進入三軍總醫院公車：市民小巴10、藍20、藍27、紅29、0東、28、278、284、521、551、617、645（請於「三總內湖站」下車，繞駛時間為0800-2130時）。 

搭乘飛機（松山機場）

可搭乘617路線公車至三軍總醫院。