1. 論文(査読あり)*: corresponding
- Yoshida, T., Furihata, H.Y., To, T.K., Kakutani, T., Kawabe, A.* (2019) Genome defense against integrated organellar DNA fragments from plastids into plant nuclear genomes through DNA methylation. Scientific Reports 9: 2060 https://doi.org/10.1038/s41598-019-38607-6.
- Kawabe, A.*, Furihata, H.Y., Tsujino, Y., Kawanabe, T., Fujii, S., Yoshida, T.(2018) Divergence of RNA editing among Arabidopsis species. Plant Science 280: 241-247 https://doi.org/10.1016/j.plantsci.2018.12.009
- Yoshida, T.*, Tarutani, Y., Kakutani, T., Kawabe, A. (2018) DNA methylation Diversification at the Integrated Organellar DNA-Like Sequences. Genes 9 (12) 602 doi:10.3390/genes9120602
- Yoshida, T., Kawanabe, T., Bo, Y., Fujimoto, R., Kawabe, A.* (2018) Genome-wide analysis of parent-of-origin allelic expression in endosperms of Brassicaceae species, Brassica rapa. Plant Cell & Physiology 59 (12): 2529-601 doi:10.1093/pcp/pcy178.
- Kawanabe, T., Nukii, H., Furihata, H.Y., Yoshida, T., Kawabe, A.* (2018) The complete chloroplast genome of Sisymbrium irio. Mitochondrial DNA Part B Resources 3 (2):488-9.
- Yoshida, T., Furihata, H.F., Kawabe, A.* (2017) Analysis of nuclear mitochondrial DNAs and factors affecting patterns of integration in plant species. Genes & Genetic Systems 92(1):27-33.
- Furihata, H.Y., Suenaga, K., Kawanabe, T., Yoshida, T., Kawabe, A.* (2016) Gene duplication, silencing and expression alteration govern the molecular evolution of PRC2 genes in plants. Genes & Genetic Systems 91(2):85-95.
- Yoshida, T.*, Tamekuni, M., Yahara, T., Inomata, N., Tachida, H. (2014) Demographic history of a common pioneer tree, Zanthoxylum ailanthoides, reconstructed using isolation-with-migration model. Tree Genetics and Genomes 10(5):1213-22.
- Yoshida, T., Furihata, H.Y., Kawabe, A.* (2014) Patterns of Genomic Integration of Nuclear Chloroplast DNA Fragments in Plant Species. DNA Research 21(2):127-40.
- Yoshida, T., Kawabe, A.* (2013) Importance of Gene Duplication in the Evolution of Genomic Imprinting Revealed by Molecular Evolutionary Analysis of the Type I MADS-Box Gene Family in ArabidopsisSpecies. PLoS ONE 8(9):e73588.
- Ito, H., Yoshida, T., Tsukahara, S., Kawabe, A.* (2013) Evolution of the ONSENretrotransposon family activated upon heat stress in Brassicaceae. Gene 518(2):256-61.
- Yoshida, T., Nagai, H., Yahara, T., Tachida, H.* (2010) Genetic structure and putative selective sweep in the pioneer tree,Zanthoxylum ailanthoides. Journal of Plant Research 123(4):607-16.
- Nagai, H., Yoshida, T., Kamiya, K., Yahara, T., Tachida, H.* (2009) Development and characterization of microsatellite markers in Zanthoxylum ailanthoides (Rutaceae). Molecular Ecology Resources 9(2):667-9.
- Kamiya, K., Moritsuka, E., Yoshida, T., Yahara, T., Tachida, H.* (2008) High population differentiation and unusual haplotype structure in a shade intolerant pioneer tree species, Zanthoxylum ailanthoides(Rutaceae) revealed by analysis of DNA polymorphism at four nuclear loci. Molecular Ecology 17(10):2329-38.
2. 解説
- 津田吉晃・木村恵・井上みずき・内山憲太郎・三嶋賢太郎・富田基史・吉田貴徳・兼子信悟・三村真紀子・亀山慶晃(2009) 第一回森林遺伝学関連若手勉強会の報告,林木の育種231 pp26-28
3. 学会発表 *: presenter
3-1. 招待講演
- 吉田貴徳*・河邊昭「植物のゲノムインプリンティングとその分子進化」、『遺伝研研究集会:理論分子進化学の新機軸』、招待講演、三島、2018年11月
- 吉田貴徳*「核内オルガネラ様配列の分子進化とDNAメチル化の解析」、『国立遺伝学研究集会:オルガネラゲノムに支配される生命現象』、三島、2014年11月
- 吉田貴徳*「典型的パイオニア種カラスザンショウの分子集団遺伝学的研究」、『私立大学戦略的 研究基盤形成支援事業セミナー』、招待講演、京都、2011年2 月
3-2. 国際学会・会議
- Yoshida, T.*, Bo, Y., Kawabe, A. “Genome-wide analysis of parent-of-origin allelic expression in the triplicated genome of Brassica rapa.”, Cold Spring Harbor Asia 2016, Poster, 2016年11月
- Yoshida. T.*, Furihata, H.Y., Kakutani, T., Kawabe, A. “Epigenetic modification and molecular evolution of nuclear integrated organelle DNA fragments in plant species.” The 27th International Conference on Arabidopsis Research 2016, Poster, 2016年7月
- Yoshida, T.*, Furihata, HY., Kakutani, T., Kawabe, A., “Epigenetic modification and molecular evolution of nuclear integrated organelle DNA fragments in plant species” Poster, The 38th Naito Conference: Molecular-based biological systems, 2014年10月
- Yoshida, T.*, Kawabe, A. “Importance of gene duplication in the evolution of genomic imprinting revealed by molecular evolutionary analysis of the type I MADS-box gene family in Arabidopsis species.” Society for Molecular Biology and Evolution satellite meeting: The causes of genome evolution, Poster, 2014年3月
- Yoshida, T.*, Tamekuni, M., Yahara, T., Inomata, N., Tachida, H., “Elucidation of the demographic history of a common pioneer tree, Zanthoxylum ailanthoides using multilocus sequence data” Annual Conference of Society for Molecular Biology and Evolution 2011, Poster, 2011年7月
3-3. 国内学会
- 吉田貴徳* 「エピジェネティクスとゲノム・遺伝子進化の接点 ー植物を用いた研究からー」、第1回日本遺伝学会春季分科会、ポスター発表、2019年3月
- 吉田貴徳*、川邊隆大、河邊昭「Brassica rapaにみられるインプリント遺伝子とその分子進化」、日本遺伝学会第90回大会、口頭発表、2018年9月
- 吉田貴徳*、薄伊納、河邊昭「アブラナ科植物Brassica rapaにおけるゲノムインプリンティング」、日本進化学会第18回大会、ポスター発表、2016年8月
- 吉田貴徳*、河邊昭「アブラナ科植物ハタザオのゲノム解析」、日本遺伝学会第88回大会、口頭発表、2016年9月
- 薄伊納*、吉田貴徳、河邊昭「Brassica rapaにおけるゲノムインプリンティング候補遺伝子の探索」、日本遺伝学会第87回大会、口頭発表、2015年9月
- 河邊昭*、降旗初佳、吉田貴徳「シロイヌナズナ属における葉緑体のRNAエディティングの種間変異」、日本遺伝学会第87回大会、口頭発表、2015年9月
- 吉田貴徳*・降旗初佳・樽谷芳明・角谷徹仁・河邊昭「核内オルガネラ様配列のDNAメチル化修飾とその遺伝様式」、『日本遺伝学会第86回大会』、1B-01、長浜市、2014年9月
- 吉田貴徳*・降旗初佳・角谷徹仁・河邊昭「核に移行した葉緑体ゲノム断片のエピジェネティックな修飾と分子進化」、『日本遺伝学会第85回大会』、2B-11、横浜、2013年9月
- 吉田貴徳*・河邊昭「ゲノムインプリンティングされるtype I MADS-box遺伝子の遺伝子重複と分子進化」、『日本進化学会第15回大会』、3D-03、筑波、2013年8月
- 吉田貴徳*・河邊昭「ゲノムインプリンティングされるtype I MADS-box遺伝子の分子進化」、『日本遺伝学会84回大会』、1A-12、福岡、2012年9月
- 吉田貴徳*・河邊昭「ゲノムインプリンティングがtype ⅠMADS-box遺伝子の分子進化に及ぼす影響」『日本遺伝学会第83回大会』、3E-10、京都、2011年9月
- 吉田貴徳*・為国愛・矢原徹一・猪股伸幸・舘田英典「Elucidation of the Demographic History of a Common Pioneer Tree, Zanthoxylum ailanthoides Using Multilocus Sequence Data」、『日本進化学会第13回大会』、P050、京都、2011年7月
他9報
4. 企画運営
- 日本遺伝学会第87回大会、ワークショップ「エピジェネティクスと進化学の結びつきを再考する」共同企画者(企画:吉田恒太、吉田貴徳)2015年9月
- 九州大学生物学科一般公開シンポジウム、「九州大学生物科学専攻の大学院生が選ぶ、今最も話を聞きたい研究者08’」共同企画者 (企画:新海陽一、井上明俊、平島剛志、吉田貴徳)2008年3月
5. 科研費等の競争的資金の取得状況
- 平成30年度〜32年度 若手研究「エピジェネティックな機構と植物ゲノムの共進化:DNA脱メチル化酵素の進化解析」
- 平成27年度~29年度 特別研究員奨励費(PD)「RNAi非依存的DNAメチル化とゲノム防御機構:核内オルガネラ様配列を用いた解析」
6. 海外渡航
- 2017.11 ~ 2018.2 オーストラリア連邦産業科学研究機構(CSIRO、キャンベラ) 雑種強勢研究グループ(Ian Greaves博士) 訪問研究者
7. 査読の記録
publons : Takanori Yoshida