SD Negeri 3 Wanagiri semula bernama SD No. 3 Wanagiri. Sekolah ini berdiri pada tahun 1982 tepatnya pada tanggal 19 Juli 1982. SD Negeri 3 Wanagiri terletak di Banjar Dinas Bhuana Sari, Desa Wanagiri, Kecamatan Sukasada Kabupaten Buleleng, yang berlokasi cukup strategis karena berada di sekitar permukiman penduduk, akses dengan kendaraan mudah karena dapat dilalui kendaraan roda dua maupun roda empat. Saat ini SD Negeri 3 Wanagiri dipimpin oleh Ni Nengah Supleg Handayani, S.Pd selaku Kepala Sekolah terhitung sejak Tgl 22 Mei 2026. Pada tanggal 25 Oktober 2016, Sekolah ini telah diakreditasi oleh Badan Akreditasi Nasional dengan nomor akreditasi 536/BAP-SM/LL/X/2016 dengan nilai akreditasi B dan telah diakreditasi lagi tahun 2023 oleh Badan Akreditasi Nasional Pendidikan Anak Usia Dini, Pendidikan Dasar, dan Pendidikan Menengah (BAN PDM) dengan nomor akreditasi 097/BAN-PDM/SK/2023 dengan nilai akreditasi B berlaku dari 2023 - 2028.
File SK Pendirian dapat diunduh berikut ini:
sk_pendirian SD Negeri 3 Wanagiri
hak_guna_pakai tanah SD Negeri 3 Wanagiri
Nama : Ni Nengah Supleg Handayani, S.Pd.
Periode : 2026 -
Nama : I Wayan Sugita, S.Pd.,M.Pd.H
Periode : 2016-2025
Nama : I Wayan Suadi Adnyana, S.Pd.SD
Periode : 2011-2015
Nama : Gede Rawes Sarjana, S.Pd
Periode : - 2010
Nama : Nyoman Dana, S.Pd.SD
Periode : 2000-2006