近年來，在基督教協進會的推動以及眾教會的努力之下，看見教會合一、城市轉化的契機，有愈來愈多跨教會、跨宗派的合作，要對這是待產生影響力，就要讓「基督文化」深植人心。
由市府號召的聖誕點燈活動，逐年跨大規模，在台灣文學館旁，古色古香的建築風情， 彰顯了台南文化古都的特色，聖誕點燈是台南眾教會聯合舉辦的盛事，精彩的節目吸引許多民眾駐足聆賞，豐富創意的市集是孩子的最愛，讓城市充滿聖誕的溫馨與歡樂。
基督的文化要翻轉城市，億載金城象徵著城市的歷史，從過去直到如今，神眷顧此地，千人的讚美與舞蹈，留下上帝恩典的痕跡。
OM福音船LOGOS HOPE首次停泊安平港，台南安平港創下福音船四十四年來的歷史紀錄，單天造訪人數近兩萬九千人！台南聖教會接待福音船的宣教士，也一同配搭福音船的招待工作和晚會演出。
禱告的祭壇是基督徒得勝的關鍵，台南區的全球禱告日，跨越宗派的讚美和禱告，同心為城市、國家守望。2016年於成功大學中正堂舉辦，參與人數約5000人。
2016年3月13日，別開生面地由四個台南在地原住民教會（歸農教會、古華福山門分會、南原教會、南凱教會，另加遠自屏東獅子鄉的上內獅教會，五個原住民教會齊來與本會聯合主日，從一開始的敬拜就點燃大家的熱情，一同在主裡歡唱，讚美的歌聲更加嘹亮。
聖教會來談九十周年，不改變初入台灣的福音使命，秉持四重福音的原則，帶給這塊土地祝福。