Journal Articles
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5. T. Ishida, W-C. Chu, J-K. Yu*, Y. Satou*, Multipotent tail bud cells originated with the chordate common ancestor. bioRxiv 2026.10.25.761592 https://doi.org/10.64898/2026.10.25.761592 [preprint]
論文[2]の続きの相当する論文です。脊椎動物・被嚢動物の姉妹群であるナメクジウオを用いて、ナメクジウオが神経中胚葉前駆細胞を持つかどうかを検証しました。特に、フロリダナメクジウオ(Branchiostoma floridae)の初期胚を用いて尾芽の細胞系譜を追跡し、尾芽から体節・脊索・神経索が生じることを示しました。台湾・中央研究院の游智凱(Jr-Kai Yu)博士・朱韋臣(Wei-Chen Chu)博士との共同研究です。
4. T. Ishida*, Y. Satou, The tripartite neural plate border is a common trait of vertebrates and tunicates. bioRxiv 2026.07.29.740271. https://doi.org/10.64898/2026.07.29.740271 [preprint]
論文[2]の続きの論文です。ホヤの外胚葉全体(神経板・表皮・神経板境界)を対象として高精度かつ網羅的に転写因子遺伝子の発現様式を解析することで、ホヤの神経板境界が前方(anterior)・側方内側(inner lateral)・側方外側(outer lateral)の三つのドメインに分かれることを見出しました。また、ゼブラフィッシュの単一細胞トランスクリプトーム・空間トランスクリプトームデータとの比較を行うことで、ホヤの前方・側方内側・側方外側神経板境界のそれぞれが、脊椎動物の頭部プラコード・神経堤/尾芽・正中膜ヒレ(median fin fold, MFF)とよく似ていることを明らかにしました。
3. Y. Nagahata*, Y. Nishimura, R. Kaitani, J.C.K. Leong, I. Oda-Ishii, H. Kohtsuka, S. Abe, T. Ishida, M. Carmona-Rivas, S.R. Najle, E. Casacuberta, K. Ikuta, T. Miura, M. Ogasawara, N. Irie, Y. Satou, I. Ruiz-Trillo*, & H. Kawamoto*, Animals have expanded the evolutionary legacy of unicellular ancestors in blood cells, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 123 (23) e2528110123, (2026). https://doi.org/10.1073/pnas.2528110123
2. T. Ishida, Y. Satou*, Ascidian embryonic cells with properties of neural-crest cells and neuromesodermal progenitors of vertebrates. Nat. Ecol. Evol. 8, 1154–1164 (2024). https://doi.org/10.1038/s41559-024-02387-8
1. Y. Satou*, M. Tokuoka, I. Oda-Ishii, S. Tokuhiro, T. Ishida, B. Liu, & Y. Iwamura, A Manually Curated Gene Model Set for an Ascidian, Ciona robusta (Ciona intestinalis type A), Zool. Sci., 39, (2022). https://doi.org/10.2108/zs210102
ホヤの遺伝子モデルを手作業でアップデートしたという論文です。
Journal Articles [2] の解説記事(の番外編)です。論文の内容に加えて、将来的に神経堤細胞・神経中胚葉前駆細胞(NMPs)を対象とする研究がどのように進んでいくと嬉しいかということも書いています。
1. Evolutionary origin of vertebrate neural crest and neuromesodermal cells. Nat. Ecol. Evol. (2024). https://doi.org/10.1038/s41559-024-02388-7
2. Y. Uchida, T. Ishida, S. Ono, S. Kuroda, A. Kobayashi, N. Konno, Y. Tanaka, T. Nishizawa, J. Yoshida, K. Yoshimoto, M. Yoneda, “ Meeting Report: The First Evo-Devo Young Researchers Meeting.” Dev. Growth Differ. (2025). https://doi.org/10.1111/dgd.70016.
1. 石田祐,「神経堤細胞と神経中胚葉前駆細胞が単一の進化的起源 をもつことを示唆するホヤ胚の神経板境界細胞」,日本進化学会ニュースvol.24 No.3