LIEN

scIDST (single-cell Identification of Disease progressive STages)

scIDST est developpé pour prédire des niveaux de progression de la maladie dans chaque cellule de l'ARN-seq unicellulaire (scARN-seq) avec l'apprentissage profond faiblement supervisé (Wehbe et al., submitted)

Organoid Atlas (UCSC Cell Browser)

Nous avons développé une interface web avec le navigateur cellulaire de l’Université de Santa Cruz de Californie (UCSC) et avons développé un puissant outil interactif pour explorer toutes les données de l'ARN-seq unicellulaire qui fournit les identités des amas de cellules, les gènes de référence pour chaque grappe, la composition des cellules pour chaque données et l’âge de l’organoïde parmi d'autres informations importantes. La matrice de l'Indentification Molecular Unique (UMI) brute, qui combine tous les profils de transcriptome unicellulaire est disponible sur notre site Mendeley repository (Tanaka et al., Cell Report, 2020).