ReCHERCHE

Étant donné la disponibilité limitée des échantillons du cerveau tumoral de patients, des modèles animaliers ont été utilisés pour étudier les mécanismes moléculaires de la progression de la tumeur. Toutefois, les modèles animaliers ne reproduisent pas adéquatement les pathologies des maladies du cerveau humain du point de vue moléculaire et génétique. Récemment, des organoïdes et sphéroïdes ont été développés à partir de cellules souches pluripotentes humaines ou de cellules cancéreuses dans le système de culture en 3D. Les organoïdes reflètent le micro-environnement du cerveau in-vivo et offrent des applications pour les modélisations des maladies et des tests de médicament. Nous sommes en train d'utiliser les systèmes des organoïdes et sphéroïdes pour explorer les mécanismes pathogénétiques et les réponses des tumeurs du cerveau humain aux médicaments.

L’avancée récente des technologies de séquençage génomique nous permet de quantifier le niveau de l’expression de gène à une résolution unicellulaire. Nous avons ensuite appliqué ce séquençage à des échantillons du cerveau tumoral de patients, à des organoïdes du cerveau et à d’autre modèles cancéreux. Dans notre laboratoire, nous sommes en train d'analyser des données internes et publiques de l’ARN-seq et l’ATAC-seq unicellulaire des échantillons de cerveaux et des organoïdes pour comprendre comment l’expression des gènes et la structure de la chromatine sont changées avec lors de la progression de la maladie.

Les cellules cancéreuses présentent des propriétés semblables à celles des cellules souches, tel que l’état indifférencié et la croissance immortelle et partagent plusieurs programmes moléculaires avec des cellules souches embryonnaires. Grâce à une analyse approfondie des données l’ARN-seq, nous avons identifié une nouvelle isoforme d’épissage de gène Cyclin E1 (pCCNE1) qui est exprimée uniquement dans des cellules souches embryonnaires, mais pas dans des cellules somatiques normales. De façon intéressante, pCCNE1 est également exprimée dans le cancer, cependant son rôle fonctionnel dans la progression du cancer est complètement inconnu. Dans notre laboratoire, nous étudions la relation entre le pCCNE1 et les phénotypes du cancer.