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当研究室で受け入れ可能な解析一覧です
当研究室で受け入れ可能な解析一覧です
※筑波大学学内者と学外者で料金が異なります
※筑波大学学内者と学外者で料金が異なります
2025年度委託解析料金表.pdfシーケンシング関連メニューのサンプル提出ガイドライン
RNAもしくはDNAを当ラボに郵送する際は、分解を防ぐためにドライアイス詰め、冷凍便でお送りください。また、サンプルチューブの破産がないように緩衝材を詰める等十分ご留意願います。
2025年10月より、ライブラリー調整やシーケンシングは当ラボと連携を結びましたNovogenes社のオートメーション化された大規模シーケンシングプラットフォームにて実施されます。これにより、高いクオリティーと短納期と低価格が実現可能となりました。今後納期はさらに短縮され、価格も随時ディスカウントでる見込みです。
RNAシーケンス解析-1：RNA抽出・精製～データ解析までのフルプラン 納期：5～7週間
（学内33000円/検体; 学外45810円/検体）
mRNA-seqを適用します。
組織や血液の状態で受け付けます。
また、QIAZOL（当ラボで推奨しております）、TRIZOLなどの有機溶剤系抽出試薬でホモジナイズしたサンプルも受け付けます。
サンプル採取の際はRNAの分解を防ぐために、RNAlatarに浸漬するか、液体窒素で瞬時に凍結されることをおすすめします。
RNA抽出・精製、RNAのクオリティー確認、ライブラリー作成、データ解析を含むフルプランです。
RNAの分解（RIN<6）が認められる場合mRNA-seqを適用するとシーケンシングデータ取得の際にバイアスがかかる可能性があります。そのため、Total RNA-seqを適用するかどうか依頼者様に一度確認を行います。この場合1検体当たり15000円の追加試薬代（リボソーマルRNA除去試薬）が発生します（リード数の変更はありません）。
必要に応じリード数を2倍に増やすことも可能です。その場合は追加試薬代10,000円が発生します。
RNAシーケンス解析-2：精製RNAを提出、データ解析込み 納期：3～5週間
（学内27500円/検体; 学外37240円/検体）
mRNA-seqを適用します。
抽出・精製されたRNAをご提出いただきます。
NanoDropなどの分光光度計であらかじめクオリティーの確認をお願いします（260/230, 260/280が共に1.7以上を推奨）。
50もしくは100ng/ul以上の濃度で、30ul以上ご提出ください。
こちらでは、濃度を調整後RNAのクオリティー確認から実施します。
データ解析込みです。
RNAの分解（RIN<6）が認められる場合mRNA-seqを適用するとシーケンシングデータ取得の際にバイアスがかかる可能性があります。そのため、Total RNA-seqを適用するかどうか依頼者様に一度確認を行います。
Total RNA-seqを適用の場合1検体当たり15000円の追加試薬代（リボソーマルRNA除去試薬）が発生します（リード数の変更はありません）。
必要に応じリード数を2倍に増やすことも可能です。その場合は追加試薬代10,000円が発生します。
RNAシーケンス解析-3：クオリティー確認済みのRNAを提出、データ解析込み（中級者向け）
（現在受け入れを中止しています）
mRNA-seqを適用します。
NanoDropなどの分光光度計であらかじめクオリティーの確認をお願いします（260/230, 260/280が共に1.7以上を推奨）。
電気泳動もしくはフラグメントアナライザーでリボソーマRNAのバンド（18S, 28Sの2本）がしっかり見え、スメアがない事もご確認ください。
RNAの分解が認められる場合はTotal RNA-seqをおすすめします。この場合1検体当たり15000円の追加試薬代（リボソーマルRNA除去試薬）が発生します（リード数の変更はありません）。
必要に応じ、リード数を2倍に増やすことも可能です。その場合は追加試薬代10,000円が発生します。
RNAは50もしくは100ng/ulに合わせ、総量で30ul以上ご提出ください。
こちらでは、RNAの分解度の確認は実施しません、ライブラリー作成から実施します。
データ解析込みです。
RNAシーケンス解析-4：クオリティー確認済みのRNAを提出、Fastq dataを納品（上級者向け）
（現在受け入れを中止しています）
NanoDropなどの分光光度計であらかじめクオリティーの確認をお願いします（260/230, 260/280が共に1.7以上を推奨）。
電気泳動もしくはフラグメントアナライザーでリボソーマRNAのバンド（18S, 28Sの2本）がしっかり見え、スメアがない事もご確認ください。
RNAの分解が認められる場合はTotal RNA-seqをおすすめします。この場合1検体当たり15000円の追加試薬代（リボソーマルRNA除去試薬）が発生します（リード数の変更はありません）。
必要に応じ、リード数を2倍に増やすことも可能です。その場合は追加試薬代10,000円が発生します。
RNAは50もしくは100ng/ulに合わせ、総量で30ul以上ご提出ください。
こちらでRNAの分解度の確認は実施しません、ライブラリー作成から実施します。
データ解析は行わず、Fastq fileの納品になります。
ChIP シーケンス解析-1：ChIP DNAを提出、データ解析込み
（現在受け入れを中止しています）
濃度測定済みの、ChIP DNAをご提出ください。
こちらではライブラリー作成～データ解析まで実施いたします。
ChIP シーケンス解析-2：クロマチン調整、免疫沈降～データ解析まで含むフルプラン
（現在受け入れを中止しています）
凍結された組織や細胞をご提出いただきます。
クロマチン調整、免疫沈降、ライブラリー作成、データ解析まで含むプルプランです。
バイオインフォマティクス解析支援
Fastqファイルをご提出ください。
全ゲノムシーケンス、アンプリコンシーケンス、全エクソンシーケンス、RNAシーケンス、ChIPシーケンス等に対するバイオインフォマティクス解析が可能です。
その他、カスタムでご要望に応じた解析も可能です。
シングルセルRNAシーケンスのデータ解析をトライアルで実施しております。詳しくはお問い合わせお願いいたします。
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