Kegiatan atau aktivitas ekstrakurikuler merupakan kegiatan atau aktivitas yang diselenggarakan di luar jam pelajaran yang tercantum di dalam susunan program sesuai dengan keadaan serta kebutuhan sekolah, serta dirancang dengan secara khusus supaya sesuai dengan faktor minat serta bakat siswa. UPTD SMPN 2 Mojo juga berusaha mewadahi bakat dan minat siswa-siswinya dalam kegiatan ekstrakurikuler. Kegiatan ekstrakurikuler siswa yang ada di SMPN 2 Mojo antara lain :
OSIS
Pramuka
Pencak Silat
PIK-R
