NAZARET, en esta etapa los seminaristas reciben herramientas de discernimiento vocacional, teniendo como referencia la infancia de Jesús. Académicamente los seminaristas estudian la preparatoria. 

Duración 3 años

JORDÁN, en esta etapa los seminaristas asumen su identidad de bautizados y ponen los ojos en Jesús, aprenden a vivir en comunidad fortaleciendo su identidad personal, de grupo y poniendo las bases académicas para el estudio filosófico.

Duración 1 año 

GALILEA - JERUSALÉN, esta instancia se divide en dos etapas: Galilea donde los seminaristas responden a su llamado de discípulos  y Jerusalén donde teniendo clara una opción de vida se van configurando con Jesucristo Buen Pastor. Académicamente hablando estudian filosofía y teología.

Duración: Galilea 3 años, Jerusalén 4 años.