今日は、階層的クラスター分析について学びます。以下がRスクリプトとその実行結果です。最後に課題もあります。
前回までも使ってきた水質仮想データを用いて、ユークリッド距離でのPCoA(=PCAと一緒)による可視化、階層的クラスター分析による可視化を行うスクリプトを書いて提出すること
#///////////////////////////////load raw data////////////////////////////
{
meta_and_env <- read.csv("test_random_osaka.csv",header=T) #for metadata and environment
}