Publications

Articles

In preparation,

<<2023>>

• Akamatsu Y., Nakao R., Motozawa H., Furukawa K., Kurita Y. (2023) Application of a quantitative PCR method for monitoring of geosmin‑producing Anabaena spp. in a Japanese reservoir. Landscape and Ecological Engineering, 19: pages87–93.

• Saito M., Tsuji S., Nakao R., Miyazono S., Akamatsu Y. (2023) Comparative study on nuclear and mitochondrial DNA of Ayu Plecoglossus altivelis for environmental DNA-based spawning evaluation. Landscape and Ecological Engineering, 19: 55–67.

• Miyazono S., Kodama T., Akamatsu Y., Nakao R., Miyahira H. (2023) Application of environmental DNA analysis for detecting potential sources of invasive aquatic plant Egeria densa in a riverine network. Landscape and Ecological Engineering, 19: 45–54.

• Nakao R., Miyata R., Nakamura N., Muramatsu M., Okamura H., Imamura F., Akamatsu Y. (2023) Development of environmental DNA chip for monitoring the invasive alien fishes in dam reservoirs. Landscape and Ecological Engineering, 19: 33–41.

• Nishizawa R., Nakao R., Ushimaru A., Minamoto T. (2023) Development of environmental DNA detection assays for snakes in paddy fields in Japan. Landscape and Ecological Engineering, 19: 3–10.

<<2022>>

• Tsuji S., Inui R., Nakao R., Miyazono S., Saito M., Kono T., Akamatsu Y. (2022) Quantitative environmental DNA metabarcoding shows high potential as a novel approach to quantitatively assess fish community. Scientific Reports, 12: 21524.

• 平野荘太郎, 中尾遼平, 赤松良久, 岡 紗也佳, 関口一平, 久米元 (2022) 分布南限である屋久島におけるアユの現在の生息状況と初期生活史. 魚類学雑誌, 69: 225–233.

• 関根雅彦, 加藤琢己, 中尾遼平, 赤松良久 (2022) 環境DNAの河川横断面での分布と流下に伴う減少速度の検討. 土木学会論文集G(環境), Vol.78, No. 7: III_401-III_408.

• 滝山路人, 赤松良久, 宮園誠二, 中尾遼平, 今村史子, 加藤靖広 (2022) 環境DNA定量メタバーコーディング法を用いた流域網羅的な魚類多様性評価. 土木学会論文集B1 (水工学) Vol.78, No.2:  I_835–I_840.

• 宮平秀明, 宮園誠二, 児玉貴央, 赤松良久, 中尾遼平 (2022) 環境DNAを用いた中国地方一級水系におけるオオカナダモ繁茂要因の基礎的検討. 河川技術論文集, 第28巻: 157–162.

• 宮園誠二, 児玉貴央, 赤松良久, 中尾遼平, 辻 冴月, 宮平秀明 (2022) 環境DNA定量メタバーコーディング法を用いた江の川土師ダム下流における魚類多様性の把握. 河川技術論文集, 第28巻,:169–174.

• 赤松良久, 中尾遼平, 横山良太, 太田宗宏, 乾 隆帝 (2022) 環境DNA定量メタバーコーディングを用いた九州北部豪雨直後の筑後川の魚類相調査～回復過程のモニタリングに向けて～. 河川技術論文集, 第28巻: 157–162.

• Tsuji S., Nakao R., Saito M., Minamoto T., Akamatsu Y. (2022) Pre-centrifugation before DNA extraction mitigates extraction efficiency reduction of environmental DNA caused by the preservative solution (benzalkonium chloride) remaining in the filters. Limnology, 23: 9-16.

• Kodama, T., Miyazono, S., Akamatsu, Y., Tsuji, S.,  Nakao, R. (2022) Abundance estimation of riverine macrophyte Egeria densa using environmental DNA: effects of sampling season and location. Limnology, 23: 299–308. 

<<2021>>

• 宮園誠二, 児玉貴央, 赤松良久, 中尾遼平, 齋藤 稔, 辻 冴月 (2021) 環境 DNA 分析による江の川支流のアユ生息場としての評価. 応用生態工学, 259–266.

• 中尾遼平, 赤松良久, 齋藤稔, 宮園誠二, 稲葉愛美 (2021) 環境 DNA 定量メタバーコーディングを用いた魚類相の量的および質的な日周変動の把握. 土木学会論文集B1(水工学), Vol.77, No.2, I_541-I_546.

• 小林勘太, 赤松良久, 中尾遼平 (2021) 河川物質動態シミュレーションに基づく環境 DNA 濃度にて魚類の生物量を把握し得る空間的範囲の検討. 土木学会論文集B1(水工学), Vol.77, No.2, I_553-I_558.

• 宮園誠二, 児玉貴央, 赤松良久, 中尾遼平, 辻 冴月, 宮平英明 (2021) 環境DNA定量メタバーコーディングによる河川支流の魚類群集に影響を与える環境要因の検討. 土木学会論文集B1(水工学), Vol.77, No.2, I_547-I_552.

• 花岡拓身, 齋藤 稔, 赤松良久, 宮園誠二, 中尾 遼平, 辻 冴月, 小林勘太 (2021) 江の川浜原ダム下流における置土が河川環境に与える影響. 土木学会論文集B1(水工学), Vol.77, No.2, I_979-I_984.

• Tsuji, S., Nakao, R., Saito, M. , Minamoto, T., Akamatsu, Y. (2021) Pre-centrifugation before DNA extraction mitigates extraction efficiency reduction of environmental DNA caused by the preservative solution (benzalkonium chloride) remaining in the filters. Limnology. https://doi.org/10.1007/s10201-021-00676-w

• Nakao, R., Inui, R., Akamatsu, Y., Goto, M., Doi., H., Matsuoka, S. (2021) Illumina iSeq 100 and MiSeq exhibit similar performance in freshwater fish environmental DNA metabarcoding. Sci. Rep.11: 15763 https://doi.org/10.1038/s41598-021-95360-5

• Inui, R., Akamatsu, Y., Kono, T., Saito, M., Miyazono, S., Nakao, R. (2021) Spatiotemporal Changes of the Environmental DNA Concentrations of Amphidromous Fish Plecoglossus altivelis altivelis in the Spawning Grounds in the Takatsu River, Western Japan. Front. Ecol. Evol. 9: 622149. doi: 10.3389/fevo.2021.622149

• Hoshino, T., Nakao, R., Minamoto, T., Doi, H. (2021) Quantitative sequencing enables simultaneous absolute quantification and sequencing of environmental DNA of fish species. Sci. Rep. 11: 4372 https://doi.org/10.1038/s41598-021-83318-6

• 児玉貴央, 宮園誠二, 赤松良久, 中尾遼平, 齋藤稔 (2021) 土師ダム下流における本川のオオカナダモ繁茂に影響を及ぼし得る支川の把握，河川技術論文集, 第27巻, 379-384.

• 宮園誠二, 児玉貴央, 赤松良久, 辻冴月, 中尾遼平 (2021) 環境DNA定量メタバーコーディング法による堰が河川魚類群集構造に及ぼす影響の評価. 河川技術論文集第27巻, 329-334.

•  辻冴月, 赤松良久, 中尾遼平, 都築隆禎, 内藤太輔, 横山良太, 畔上正樹, 乾隆帝 (2021) 河川水辺の国勢調査による魚類調査と環境DNA定量メタバーコーディングの比較検討. 河川技術論文集第27巻, 341-346 .

<<2020>>

• 赤松良久, 今村史子, 中尾遼平, 後藤益滋 (2020) 地下水動態を可視化するDNAトレーサーに関する基礎的実験. 土木学会論文集B1(水工学), Vol.76, No.2, I_1027-I_1032.

• 乾隆帝, 中尾遼平, 宮園誠二, 齋藤 稔, 赤松良久, 河野誉仁, 小林勘太 (2020) 異なる粒子保持径のガラスフィルターから得られた魚類の環境DNAメタバーコーディングと採集調査の比較. 土木学会論文集B1 (水工学), Vol.76, No.2, I_1297-I_1302.

• 小林勘太, 齋藤 稔, 赤松良久, 乾 隆帝, 河野誉仁, 辻 冴月, 中尾遼平 (2020) 環境DNA分析を用いた高津川における河川生物量の季節変動の評価. 土木学会論文集B1 (水工学), Vol.76, No.2, I_1303-I_1308.

• 宮園誠二, 児玉貴央, 赤松良久, 中尾遼平, 辻 冴月 (2020) 環境DNA分析による土師ダム下流区間の魚類群集に影響を与える環境要因の検討. 土木学会論文集B1 (水工学), Vol.76, No.2, I_1309-I_1314.

• 齋藤 稔, 乾 隆帝, 河野誉仁, 赤松良久, 中尾遼平, 小林勘太 (2020) 高津川における環境DNAを用いたアユの産卵活性評価に適した時間帯の検討, 土木学会論文集B1 (水工学), Vol.76, No.2, I_1315-I_1320.

• Miyazono, S., Kodama, T., Akamatsu, Y., Nakao, R., Saito M. (2020) Application of environmental DNA methods for the detection and abundance estimation of invasive aquatic plant Egeria densa in lotic habitats. Limnology. https://doi.org/10.1007/s10201-020-00636-w

• 齋藤 稔, 高橋直己, 小部博正, 米澤隆志, 米澤孝康, 赤松良久, 中尾遼平, 岡 直宏, 浜野龍夫 (2020) 徳島県日和佐川における可搬魚道の設置がアユの河川内分布におよぼす効果. 河川技術論文集, 26, 379–384.

• 中尾遼平, 赤松良久, 乾 隆帝, 内藤太輔, 都築隆禎. 環境DNA手法を用いた河川流程における魚類相再現性の検証～中国地方1級河川における河川水辺の国勢調査との比較. 河川技術論文集, 26, 331–336. 

• 乾 隆帝, 赤松良久, 岡田将治, 河野誉仁, 中尾遼平 (2020) 環境DNA分析を用いた高知県四万十川と島根県高津川のアユの降下・産卵期の比較～河川水温との関係性を中心に～. 河川技術論文集, 26, 331–336. 

• 児玉貴央, 宮園誠二, 山口皓平, 中尾遼平, 赤松良久 (2020) 江の川におけるオオカナダモの繁茂がアユに与える影響の検討. 河川技術論文集, 26, 367–372. 

• 松村憲吾, 赤松良久, 中尾遼平 (2020) 環境DNAを用いたダクタイル鋳鉄かご工法「鋳田籠」の魚類・甲殻類の生息場としての機能評価. 河川技術論文集, 26巻, 385–390. 

<<2019>>

• Qianqian, Wu., Kawano, K. , Ishikawa, T., Sakata, M. K., Nakao, R. , Hiraiwa, M. K., Tsuji, S., Yamanaka, H., & Minamoto. T. (2019) Habitat selection and migration of the common shrimp, Palaemon paucidens in Lake Biwa, Japan—An eDNA‐based study. Environmental DNA, 1: 54–63. https://doi.org/10.1002/edn3.6 

• Iguchi, Y., Nakao, R., Takata, K., & Kitagawa, T. (2019) Development of a single-copy nuclear DNA sequence marker for the detection of artificially caused genetic introgressions in Japanese wild medaka populations. Conserv. genet. Resour. https://doi.org/10.1007/s12686-019-01106-x

• Iguchi, Y., Nakao,  R., Matsuda, M., Takata, K., &  Kitagawa, T. (2019) Origin of the widely and discontinuously distributed mitochondrial genotypes of Oryzias latipes: introduced or native genotypes? Ichthyol. Res., 66: 183–188. https://doi.org/10.1007/s10228-018-0662-3 

<<2017>>

• 入口友香, 中尾遼平, 高田啓介, 北川忠生 (2017) 関東地方におけるミナミメダカ集団の在来マイトタイプの再検討．魚類学雑誌，64: 11–18. https://doi.org/10.11369/jji.64-11

• Nakao, R., Kano, Y., Iguchi, Y., & Kitagawa., T. (2017) Genetic disturbance in wild Minami-medaka populations in the Kyushu Region, Japan. International J. Biol. 9: 71–77. LINK 

• 中尾遼平, 入口友香, 周 翔瀛, 上出櫻子, 北川忠生, 小林牧人 (2017) 東京都野川のミナミメダカにおける外来遺伝子の河川内分布現況．魚類学雑誌，64: 131-138. https://doi.org/10.11369/jji.64-131 

• Nakao, R., Iguchi, Y. Koyama, N.,  Nakai, K., & Kitagawa, T. (2017) Current status of genetic disturbances in wild medaka populations (Oryzias latipes species complex) in Japan. Ichthyol. Res. 64: 116–119. https://doi.org/10.11369/jji.64-131 

<<2016 and Before>>

• Nakao, R., & Kitagawa, T. (2015) Differences in the behavior and ecology of wild type medaka (Oryzias latipes complex) and an orange commercial variety (himedaka). J. Exp. Zool. 323A: 349–358. https://doi.org/10.1002/jez.1916 

• 中井宏施・中尾遼平・深町昌司・小山直人・北川忠生 (2011) ヒメダカ体色原因遺伝子マーカーによる奈良県大和川水系のメダカ集団の解析．魚類学雑誌，58: 189–193. https://doi.org/10.11369/jji.58.189 

Articles (査読なし)

• 北川忠生, 中尾遼平, 中井宏施, 入口友香 (2017) 野生メダカの遺伝的多様性と飼育品種メダカの遺伝的特徴．海洋と生物，39: 120-125.

• 中尾遼平, 入口友香, 北川忠生 (2017) 日本の野生メダカにおける遺伝的撹乱の現状．海洋と生物，39: 126–130.

Books

• 北川忠生, 中尾遼平, 入口友香  (2020) 野生メダカの遺伝的多様性と飼育品種メダカの遺伝的特徴. 宗像有宗・北川忠生・小林牧人 (編著) 日本の野生メダカを守る–正しく知って正しく守る. 生物研究社 (東京), pp. 71–84.

• 中尾遼平 (2020) 日本の野生メダカにおける遺伝的撹乱の現状. 宗像有宗・北川忠生・小林牧人 (編著) 日本の野生メダカを守る–正しく知って正しく守る. 生物研究社 (東京), pp. 71–84.

• 中尾遼平．2016．ミナミメダカ．奈良県景観・自然環境課（編），p193．奈良県版レッドデータブック2016，奈良．

• 中尾遼平．2015．ミナミメダカ．京都府自然環境保全課（編），p152．京都府版レッドデータブック2015，京都．

• 中尾遼平．2015．キタノメダカ．京都府自然環境保全課（編），p153．京都府版レッドデータブック2015，京都．

博士論文（Doctoral Thesis）March, 2016

全国のメダカ種群におけるヒメダカによる遺伝的撹乱に関する研究

A study on genetic disturbance in medaka Oryzias latipes species complex caused by orange-red commercial variety “himedaka” in Japan