In der Challenge Version von Pokémon Hero Legacy besteht die Möglichkeit, zahlreiche Einstellungen vor dem Start vorzunehmen, um das Spielerlebnis zu individualisieren. Es handelt sich dabei um eine separate Spieldatei mit dem Namen "Pokémon Hero Legacy CV" und hat somit auch ihr eigenes Save-File.
Beim Spielstart können die folgenden Einschränkungen / Einstellungen frei gewählt und beliebig kombiniert werden. Eine Änderung der Einstellung ist nach dem Spielstart nicht mehr möglich.
Randomizer: Zufällige Pokémon bei Trainerkämpfen, bei wilden Pokémon und Events. Folgende Feineinstellungen sind möglich und können einzeln ein- oder ausgeschaltet werden. Randomizer für:
Wilde Pokémon
Trainer-Pokémon
geschenkte Pokémon
Legendäre separate (EIN, damit legendäre Pokémon nicht geändert werden)
ähnliche Stärke (EIN, damit das Ursprungspokémon und das zufällig generierte Zielpokémon ähnliche Basiswerte haben. Verhindert ein Raupy wird zu Arceus)
Permafaint: Pokémon, die besiegt werden, können nicht mehr eingesetzt werden. Werden alle Pokémon des Teams besiegt, ist eine Fortsetzung der Herausforderung mit anderen Pokémon möglich.
No White-Out: Wenn alle Pokémon in deinem Team besiegt werden, endet die Herausforderung sofort. Wiedereinstieg ist nicht möglich.
One Capture per Map: Nur das erste Pokémon pro Gebiet kann gefangen werden. Folgende Feineinstellungen sind möglich:
Shiny Clause: Shiny Pokémon können trotz der One Capture - Einstellung gefangen werden.
Dupes Clause: Entwicklungen eines Pokémons, das man schon gefangen hat, zählen nicht als erste Begegnung des Gebiets.
Gift Clause: Pokémon oder Eier, die man geschenkt bekommt, zählen nicht als erste Begegnung des Gebiets.
Monotype Mode: Der Spieler muss sich auf einen Typ beschränken und kann Pokémon eines anderen Typs weder fangen noch einsetzen. Folgende Grundeinstellungen, die nicht verändert werden können, gilt es dabei zu beachten:
Starter-Pokémon: Passt der gewählte Typ für den Monotype-Run nicht zu einem der Starter-Pokémon, startet man mit einem Pokémon des gewählten Typs.
Entwicklung: Wählt man einen Typ aus und besitzt ein Pokémon, das erst durch seine Entwicklung den gewählten Typ erlangt, kann man dieses trotzdem im Team haben. (z.B. Stahl-Monotype, man darf Riolu nutzen, obwohl erst Lucario den Stahl-Typ erhält)
Entwicklung: Wählt man einen Typ aus und besitzt ein Pokémon, das nach der Entwicklung den Typ verliert, kann sich das Pokémon NICHT weiterentwickeln. (z.B. Normal-Monotype, Azurill kann gefangen werden, sich jedoch nicht zu Marill entwickeln, da dieses Wasser/Fee ist)
Vermeide die kombinierte Einstellung aus Monotyp und Randomizer.
Trainer Scaling: Erhöht das Level aller Pokémon von Trainern um +2, verbessert Attackenliste und hat Chance auf Item
Hardcore Mode: Alle Pokémon (eigene und fremde) haben 31er DVs. EVs sind komplett deaktiviert.
Limited Healing: Limitiert die Anzahl der Heilungen in PokéCentern und heilenden NPCs. Feineinstellungen von 1-5 sind möglich.
No Pokémon Centers: Pokémon Center und heildende NPCs können nicht benutzt werden, um Pokémon zu heilen. Heilung per Items oder in bestimmten Situationen während der Story sind weiterhin möglich.
Item Restrictions: Verhindert den Einsatz von X-Items, limitiert die Nutzung von Top-Genesung auf 2 und Belebern auf 1.
No Items in Trainer Battles: Items können in Trainerkämpfen nicht verwendet werden.
Forced Nicknames: Zwingt den Spieler, den Pokémon Spitznamen zu geben.
Forced Set Battle Style: Die Option, nach dem Besiegen eines gegnerischen Pokémon das eigene Pokémon zu wechseln, wird nicht angezeigt.
Species Clause: Du darfst nicht zwei Pokémon der selben Spezies im Team haben. Sorgt für mehr Teamvielfalt.
No Legendaries: Legendäre Pokémon können weder gefangen noch in Kämpfen eingesetzt werden.
Achtung:
Je nach Challenge-Einstellung können evtl. nicht alle Quests im Spiel absolviert werden, einige Features sind deaktiviert, limitiert oder funktionieren nicht mehr korrekt. Die Hauptstory inklusive Haupt-Postgame-Story sind jedoch dank einigen Anpassungen in dieser Spielversion komplettierbar. Folgende Änderungen wurden im Vergleich zum Hauptspiel vorgenommen:
Neues Spiel+ ist nicht verfügbar.
Je nach Einstellung sind einige Nebenquests nicht machbar. (z.B. One-Capture - Einstellung aktiviert, was verhindert, dass man bestimmte Pokémon für einen Tausch fangen kann, der in einer Quest notwendig ist.)
Änderung an der Quest Das Haus der Drachen:
Abschnitt 7 wird übersprungen. Fangen von 10 Drachen-Pokémon nicht nötig.
Änderungen an der Quest Der Phönix aus der Asche:
Abschnitt 3 wird übersprungen. Tausch von 5 Pokémon mit TR-Mitgliedern nicht nötig.
Änderungen an der Quest Baum!:
Abschnitt 3 wird übersprungen. Tausch von Panzaeron nicht nötig.
Änderungen an der Quest Das Helden-Vermächtnis:
Suicune: Fangen von Suicune nicht nötig. Interaktion mit der Suicune-Statue in Porington City notwendig.
Rayquaza: Sieg gegen Amalia in Tarakona City, ohne Rayquaza fangen zu müssen.
Celebi: Zeitreise abschliessen, ohne Celebi fangen zu müssen.
Xerneas: Muss nicht gefangen werden. Quest Es werde Lichtel abschliessen und dann mit Ziva sprechen.
Änderungen an der Quest Es werde Lichtel:
Lichtel, Laternecto und Skelabra müssen nicht mehr im Team sein, um in der Quest voranzuschreiten. Nach dem Dialog mit Ziva erscheinen sie jeweils draussen im Schloss. Spricht man sie an, ändert sich der Raum in der Gruft. Lichtel = 1, Laternecto = 2, Skelabra = 3, mit irgendeiner blauen Kerze draussen = 4
Anpassungen an der Wiederbelebung von Fossilien im Laufe der Quest Aus der Vergangenheit, wenn man Monotype oder One Capture Methode aktiviert hat.